More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0357 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0357  OmpA/MotB  100 
 
 		 187 aa  377  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6457  OmpA/MotB domain-containing protein  64.17 
 
 		 186 aa  211  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  31.15 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  37.7 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  38.46 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  31.97 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  36.51 
 
 		 587 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  37.07 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  31.85 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4203  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.64 
 
 		 163 aa  62  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  36.13 
 
 		 576 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  31.11 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  36.21 
 
 		 270 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1234  OmpA/MotB domain-containing protein  36.27 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455837  normal  0.175097 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  38.26 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  38.26 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  36.21 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  35.25 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  36.21 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  32.8 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  32.48 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  38.24 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.97 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  33.9 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  38.61 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  33.9 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  38.61 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  38.61 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  38.61 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  38.61 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  38.61 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  38.61 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  32.74 
 
 		 357 aa  58.9  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  37.62 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  37.62 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  34.51 
 
 		 353 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  34.58 
 
 		 320 aa  58.5  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  37.62 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  35.63 
 
 		 358 aa  58.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  37.62 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  37.62 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  34.51 
 
 		 353 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  33.06 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  31.36 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  31.15 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  32.79 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  32 
 
 		 214 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  32.79 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0918  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.18 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3719  OmpA/MotB domain-containing protein  30.77 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.271162 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  32.67 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  31.78 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  29.66 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  34.19 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  32.79 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4195  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.82 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678066  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1223  peptidoglycan-associated lipoprotein OprL  30.82 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  31.78 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  31.78 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  31.78 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  31.78 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  31.78 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  31.78 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1252  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.82 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0470873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  31.82 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  32.2 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  31.78 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  29.66 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3328  OmpA/MotB  36.27 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2528  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.91 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  33.91 
 
 		 637 aa  55.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  35.96 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  31.2 
 
 		 316 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  31.15 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  35.96 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  33.98 
 
 		 364 aa  55.5  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1278  OmpA domain-containing protein  30.82 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0630955  normal  0.378402 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1558  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 		 397 aa  55.5  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0671389  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  31.15 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  35.96 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  31.15 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3127  OmpA domain-containing protein  35.11 
 
 		 550 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  32.69 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  31.2 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  31.2 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  31.2 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  33.33 
 
 		 361 aa  55.1  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  31.2 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  35.06 
 
 		 445 aa  55.1  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  31.2 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  31.2 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  36.21 
 
 		 452 aa  55.1  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  31.58 
 
 		 630 aa  55.1  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  31.13 
 
 		 350 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  31.2 
 
 		 261 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1406  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  35.96 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  35.96 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4417  OmpA/MotB domain-containing protein  29.24 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>