178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1344 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1344  major facilitator transporter  100 
 
 
454 aa  904    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1527  Na+/xyloside symporter  40.4 
 
 
444 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06480  Na+/melibiose symporter-like transporter  38.98 
 
 
460 aa  299  8e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.610657  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0679  major facilitator transporter  29.44 
 
 
439 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000876885  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1383  major facilitator superfamily MFS_1  23.78 
 
 
439 aa  100  7e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.07 
 
 
460 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.08 
 
 
469 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.3 
 
 
460 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  25 
 
 
436 aa  92.8  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2853  sugar transporter  27.55 
 
 
485 aa  92  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.563006  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2711  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 
442 aa  87.4  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.309074  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  25.32 
 
 
480 aa  87.4  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3075  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  25.62 
 
 
482 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.818183  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3565  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.67 
 
 
447 aa  83.6  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117988  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 
475 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.56 
 
 
457 aa  81.6  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.23 
 
 
471 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  24.03 
 
 
453 aa  80.1  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  25.56 
 
 
475 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1831  major facilitator transporter  23.22 
 
 
430 aa  75.1  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.612991  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.46 
 
 
476 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  24.63 
 
 
445 aa  73.2  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.29 
 
 
472 aa  73.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2372  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.38 
 
 
457 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  24.18 
 
 
468 aa  70.5  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  28.79 
 
 
467 aa  70.1  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2664  hypothetical protein  24.88 
 
 
486 aa  69.7  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.34 
 
 
475 aa  69.7  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  25.15 
 
 
464 aa  68.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.25 
 
 
465 aa  67.4  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.87 
 
 
466 aa  67.4  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  25.88 
 
 
486 aa  67  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.78 
 
 
472 aa  67  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  27.09 
 
 
467 aa  66.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  22.93 
 
 
469 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  25.89 
 
 
468 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  24.52 
 
 
468 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  24.52 
 
 
468 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  24.52 
 
 
468 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.88 
 
 
444 aa  64.3  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  24.52 
 
 
468 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  24.52 
 
 
468 aa  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  22.36 
 
 
472 aa  63.9  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1019  major facilitator transporter  21.53 
 
 
500 aa  63.9  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4479  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  36.21 
 
 
552 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  36.21 
 
 
552 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  21.32 
 
 
472 aa  63.2  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  23.94 
 
 
443 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.61 
 
 
544 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2069  major facilitator superfamily MFS_1  21.57 
 
 
432 aa  60.5  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  24.22 
 
 
493 aa  60.1  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1592  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.65 
 
 
464 aa  59.7  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00442608  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  22.42 
 
 
479 aa  59.3  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  22.59 
 
 
461 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1593  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.21 
 
 
462 aa  58.9  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.113599  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0776  Zinc finger-domain-containing protein  22.63 
 
 
447 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0781581 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  24.56 
 
 
465 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  30.39 
 
 
506 aa  58.9  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002666  galactose permease  24.71 
 
 
462 aa  59.3  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  22.42 
 
 
460 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.92 
 
 
448 aa  58.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.07 
 
 
442 aa  57.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03515  predicted transporter  22.42 
 
 
460 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371706  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  32.73 
 
 
459 aa  57.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  22.42 
 
 
479 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  22.42 
 
 
479 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03467  hypothetical protein  22.42 
 
 
460 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.42 
 
 
460 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  25.33 
 
 
443 aa  57.4  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  22.42 
 
 
460 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  21.97 
 
 
460 aa  56.6  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.09 
 
 
460 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30 
 
 
481 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30 
 
 
481 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30 
 
 
481 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  24.04 
 
 
416 aa  55.8  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  22.25 
 
 
461 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1446  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  23.64 
 
 
448 aa  55.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493361  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0047  xylose-proton symporter  23.7 
 
 
457 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000774004  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0046  xylose-proton symporter  23.7 
 
 
471 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00152296  normal  0.141953 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0047  xylose-proton symporter  23.7 
 
 
471 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245314  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0046  xylose-proton symporter  23.7 
 
 
457 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00338984  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  22.87 
 
 
460 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  22.87 
 
 
460 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  22.87 
 
 
460 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  22.87 
 
 
460 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29 
 
 
471 aa  54.3  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  26.32 
 
 
461 aa  54.3  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2155  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  29 
 
 
471 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00011339  normal  0.022313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  24.3 
 
 
463 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0430  major facilitator transporter  22.16 
 
 
503 aa  53.9  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 
415 aa  53.5  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  24.32 
 
 
442 aa  53.5  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0709  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.75 
 
 
474 aa  53.5  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0195  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.75 
 
 
474 aa  53.5  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0477575 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0781  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.75 
 
 
474 aa  53.5  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4396  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  31 
 
 
444 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4394  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  31 
 
 
444 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0181186  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4282  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  31 
 
 
444 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368763  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4463  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  31 
 
 
444 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>