135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1108 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1108  trigger factor domain-containing protein  100 
 
 		 433 aa  835    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00276647  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0983  trigger factor domain-containing protein  42.76 
 
 		 435 aa  312  9e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0236  trigger factor domain-containing protein  42.45 
 
 		 425 aa  272  7e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0234  trigger factor domain-containing protein  42.45 
 
 		 425 aa  272  7e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0632547  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1708  trigger factor domain-containing protein  35.21 
 
 		 460 aa  200  3.9999999999999996e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0955  trigger factor  24.49 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0121977  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0323  trigger factor  26 
 
 		 440 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  23.71 
 
 		 513 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  24.42 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  23.95 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  23.72 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  24.38 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  21.14 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  21.64 
 
 		 491 aa  66.6  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0432  trigger factor-like protein  22.56 
 
 		 449 aa  66.6  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.746962  normal  0.196981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1477  trigger factor  25.62 
 
 		 506 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.571552  normal  0.413399 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2739  trigger factor  24.38 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138547  decreased coverage  0.00279907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  24.26 
 
 		 488 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  21.95 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  23.77 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3661  trigger factor  24.6 
 
 		 539 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805979  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  24.5 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  25.86 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  21.55 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  23.37 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  26.63 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1569  trigger factor  26.7 
 
 		 407 aa  57  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.681108  normal  0.0237303 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  25.69 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  27.01 
 
 		 427 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0517  trigger factor  23.67 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  22.38 
 
 		 507 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2189  trigger factor  23.86 
 
 		 427 aa  55.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.981322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  23.02 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0722  trigger factor domain-containing protein  24.68 
 
 		 426 aa  54.3  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000704861  hitchhiker  0.0000000324572 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  27.22 
 
 		 446 aa  53.9  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  23.56 
 
 		 427 aa  53.1  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  25.68 
 
 		 425 aa  53.1  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  25.32 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  22.63 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  24.69 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  25.68 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  22.12 
 
 		 437 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2137  trigger factor  23.25 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  22.55 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0149  trigger factor domain  27.14 
 
 		 456 aa  52  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000935038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  25.41 
 
 		 425 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  25.41 
 
 		 425 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  25.41 
 
 		 425 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  25.41 
 
 		 425 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  25.41 
 
 		 425 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  25.41 
 
 		 425 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  24.64 
 
 		 441 aa  51.6  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0238  trigger factor  25.97 
 
 		 440 aa  51.2  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  22.19 
 
 		 483 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2406  trigger factor  20.85 
 
 		 450 aa  51.2  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.32784  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  21.7 
 
 		 447 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  29.93 
 
 		 451 aa  51.2  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1553  trigger factor  23.24 
 
 		 436 aa  50.4  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1954  trigger factor  24.07 
 
 		 428 aa  50.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.657393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  22.13 
 
 		 450 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  22.69 
 
 		 448 aa  50.4  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  21.17 
 
 		 444 aa  50.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  23.79 
 
 		 435 aa  49.7  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  25.94 
 
 		 428 aa  49.7  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0690  trigger factor  22.35 
 
 		 452 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.110264  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1677  trigger factor  22.08 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294765  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2958  trigger factor  23.04 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137272 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  22.38 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2564  trigger factor domain  24.19 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl405  trigger factor, prolyl isomerase  20.85 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  23.74 
 
 		 461 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  27.05 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  25.98 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  22.31 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  24.29 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  24.29 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1127  trigger factor  25.5 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  20.91 
 
 		 478 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  23.17 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2292  trigger factor  27.93 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  20.91 
 
 		 478 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2510  trigger factor  26 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1208  trigger factor  25.5 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.774051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  20.91 
 
 		 482 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  21.93 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  22.36 
 
 		 440 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  24.29 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  24.29 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  24.29 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  25.48 
 
 		 439 aa  47.8  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  24.67 
 
 		 430 aa  47.8  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  23.58 
 
 		 424 aa  47.4  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1408  trigger factor  23.82 
 
 		 434 aa  47  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0266398  normal  0.89684 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  26.37 
 
 		 428 aa  47.4  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  23.67 
 
 		 434 aa  47  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  22.85 
 
 		 433 aa  47  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  22.62 
 
 		 448 aa  47  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04590  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  24.89 
 
 		 430 aa  46.6  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00333842  hitchhiker  0.0000000448049 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  24.01 
 
 		 432 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  24.59 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>