More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3884 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3884  response regulator receiver protein  100 
 
 		 134 aa  266  5.9999999999999995e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110956  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3787  response regulator receiver protein  36 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0337  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081011  hitchhiker  0.000378914 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3825  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44747  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 		 1651 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 823 aa  57.4  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3183  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3744  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.139387  hitchhiker  0.00363561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  29.27 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  38.04 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3821  response regulator receiver protein  29.01 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305029  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4021  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.68 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0674  response regulator receiver protein  37.35 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0682036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0124  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 470 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3740  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5055  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000148317  normal  0.0527856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  28.36 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1631 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0161  response regulator receiver protein  36.14 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1431 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1791  response regulator receiver protein  28.32 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  28.57 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2840  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  32 
 
 		 486 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  27.64 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0148  response regulator, CheY-like  28.35 
 
 		 145 aa  50.1  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1833  putative diguanylate phosphodiesterase  35.24 
 
 		 566 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  27.56 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4337  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  hitchhiker  0.000570677 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1876  histidine kinase  29.07 
 
 		 979 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0246829  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5172  response regulator receiver protein  31.76 
 
 		 129 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.0583946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1220  CheY-like response regulator  32.23 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0243191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5381  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.13 
 
 		 235 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  33.08 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1766  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  34.29 
 
 		 554 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.449709  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  25.62 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4016  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0206  response regulator receiver protein  35.63 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.164513  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  26.45 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  26.45 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  27.05 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0958  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.09 
 
 		 734 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1842  response regulator receiver protein  28.8 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.808404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  24.59 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2749  response regulator receiver domain-containing protein  30.95 
 
 		 436 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  34.07 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 1003 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  24.59 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4012  response regulator receiver protein  28.68 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786329  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0078  two component response regulator transcription regulator protein  29.13 
 
 		 239 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000511995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2150  response regulator receiver protein  31.48 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0332475  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  25.62 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 1646 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 		 659 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.47344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 		 1415 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2157  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1772  two component transcriptional regulator, Fis family  27.27 
 
 		 227 aa  47.4  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.979845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3763  response regulator receiver protein  26.45 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113093  normal  0.0284745 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2388  response regulator receiver  33.33 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0389923  normal  0.541574 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 		 778 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 		 1016 aa  47.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1421  response regulator receiver protein  34.41 
 
 		 384 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0650838  normal  0.210106 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0241  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.98 
 
 		 582 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  28.57 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2092  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 298 aa  47  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  29.1 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1409  putative chemotaxis response regulator transcription regulator protein  23.02 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1853  response regulator receiver protein  28.45 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.955028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 394 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0776  response regulator receiver domain-containing protein  26.83 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0195762  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  24.79 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  27.05 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0042  two component Fis family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 229 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0824  response regulator receiver protein  30.85 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.494027  normal  0.693271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2287  response regulator  25.98 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  22.76 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.92 
 
 		 933 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41160  Response regulator  29.21 
 
 		 261 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 1258 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  22.76 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  32.93 
 
 		 417 aa  45.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.93 
 
 		 1323 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0155  chemotaxis response regulator  26.23 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  31.82 
 
 		 1299 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2942  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.78 
 
 		 702 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897088  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.79 
 
 		 1629 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  27.56 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 		 755 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0483  response regulator receiver domain-containing protein  29.03 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  31.46 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3361  response regulator receiver protein  26.61 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  25.41 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 		 233 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00866984  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  26.23 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>