More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2536 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0679  E1-E2 ATPase-associated domain protein  45.06 
 
 
797 aa  693    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.203098  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3569  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  43.32 
 
 
804 aa  686    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.532443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5325  Copper-exporting ATPase  44.46 
 
 
823 aa  715    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2536  copper-exporting ATPase  100 
 
 
795 aa  1620    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1133  Cu(I)-translocating P-type ATPase  44.36 
 
 
799 aa  685    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710134  normal  0.817689 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2482  Copper-exporting ATPase  45.23 
 
 
799 aa  735    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.113169  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  29.38 
 
 
787 aa  343  5.999999999999999e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  27.81 
 
 
815 aa  339  9.999999999999999e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  27.15 
 
 
796 aa  337  5.999999999999999e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  28.02 
 
 
787 aa  336  9e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  26.67 
 
 
790 aa  333  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  26.8 
 
 
791 aa  325  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  27.17 
 
 
797 aa  317  4e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  25.44 
 
 
826 aa  317  6e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  28.64 
 
 
794 aa  316  9e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  27.08 
 
 
812 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  26.52 
 
 
839 aa  311  4e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  28.08 
 
 
732 aa  311  4e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  25.73 
 
 
820 aa  310  5e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  26.61 
 
 
828 aa  310  8e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  24.94 
 
 
838 aa  310  8e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  27.59 
 
 
808 aa  310  9e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  26.09 
 
 
807 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  27.05 
 
 
814 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  24.78 
 
 
846 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  27.28 
 
 
795 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  26.44 
 
 
806 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0451  heavy metal translocating P-type ATPase  28.33 
 
 
811 aa  303  7.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0831309  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  27.21 
 
 
803 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  27.03 
 
 
803 aa  301  4e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0472  heavy metal translocating P-type ATPase  28.86 
 
 
781 aa  300  8e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  26.84 
 
 
803 aa  299  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  26.43 
 
 
799 aa  296  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  25.44 
 
 
765 aa  296  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  26.78 
 
 
806 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  26.16 
 
 
807 aa  294  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  26.82 
 
 
799 aa  295  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  26.35 
 
 
819 aa  294  4e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  23.97 
 
 
847 aa  294  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  27.24 
 
 
818 aa  294  5e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0267  copper-translocating P-type ATPase  27.98 
 
 
797 aa  293  6e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.594062  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5920  copper-translocating P-type ATPase  27.96 
 
 
755 aa  293  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.509848 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  23.99 
 
 
851 aa  292  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  26.71 
 
 
806 aa  293  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  25.25 
 
 
834 aa  292  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  26.86 
 
 
806 aa  292  2e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  26.65 
 
 
799 aa  292  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  26.65 
 
 
799 aa  292  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  27.44 
 
 
792 aa  291  4e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0667  nitrogen fixation protein fixI  27.51 
 
 
729 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  27.19 
 
 
802 aa  290  5.0000000000000004e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  26.28 
 
 
799 aa  290  7e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1102  heavy metal translocating P-type ATPase  23.72 
 
 
847 aa  289  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165186  normal  0.905045 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  25.88 
 
 
791 aa  288  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  27.14 
 
 
813 aa  288  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2046  heavy metal translocating P-type ATPase  25.8 
 
 
861 aa  288  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504527  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  28.32 
 
 
793 aa  288  2.9999999999999996e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0573  heavy metal translocating P-type ATPase  29.56 
 
 
783 aa  288  2.9999999999999996e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.113758  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  26.4 
 
 
799 aa  287  5e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  27.78 
 
 
737 aa  287  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  26.15 
 
 
799 aa  286  7e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  28.61 
 
 
738 aa  286  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2043  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  25.46 
 
 
849 aa  285  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1291  heavy metal translocating P-type ATPase  29.38 
 
 
783 aa  284  4.0000000000000003e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2255  heavy metal translocating P-type ATPase  26.88 
 
 
746 aa  284  5.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1237  heavy metal translocating P-type ATPase  24.75 
 
 
807 aa  283  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  27.35 
 
 
792 aa  283  9e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1172  heavy metal translocating P-type ATPase  29.62 
 
 
783 aa  283  1e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  25.37 
 
 
807 aa  281  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  25.35 
 
 
800 aa  280  6e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1339  heavy metal translocating P-type ATPase  25.06 
 
 
807 aa  280  6e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527377  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1365  heavy metal translocating P-type ATPase  27.55 
 
 
810 aa  280  8e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.576345 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0690  copper-translocating P-type ATPase, RdxI  27.64 
 
 
737 aa  279  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247145  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  26.38 
 
 
809 aa  278  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  27.21 
 
 
737 aa  277  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.231434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  24.06 
 
 
882 aa  277  7e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  23.93 
 
 
824 aa  276  9e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1450  heavy metal translocating P-type ATPase  28.88 
 
 
792 aa  274  4.0000000000000004e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0366901  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  25.72 
 
 
794 aa  272  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2538  heavy metal translocating P-type ATPase  26.16 
 
 
727 aa  273  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  24.16 
 
 
824 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  23.87 
 
 
811 aa  272  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  26.69 
 
 
743 aa  271  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  26.39 
 
 
817 aa  269  1e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  26.08 
 
 
809 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  23.68 
 
 
814 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0357  nitrogen fixation protein FixI, putative  26.53 
 
 
752 aa  264  6e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1420  copper-translocating P-type ATPase  28.1 
 
 
789 aa  263  8.999999999999999e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  23.65 
 
 
823 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  23.59 
 
 
811 aa  263  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  24.78 
 
 
802 aa  263  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  25.36 
 
 
728 aa  261  3e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4956  heavy metal translocating P-type ATPase  25.87 
 
 
761 aa  261  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00130227  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3851  heavy metal translocating P-type ATPase  27.13 
 
 
731 aa  261  5.0000000000000005e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0463  copper-translocating P-type ATPase  26.99 
 
 
752 aa  260  7e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  27 
 
 
798 aa  260  7e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1796  heavy metal translocating P-type ATPase  26.12 
 
 
724 aa  260  8e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  23.82 
 
 
824 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6713  copper-translocating P-type ATPase  25.93 
 
 
758 aa  257  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2773  heavy metal translocating P-type ATPase  25.79 
 
 
824 aa  257  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>