More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_1002 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_1002  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 257 aa  528  1e-149  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0809  cytochrome-c oxidase  90.28 
 
 		 247 aa  441  1e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0300  cytochrome c oxidase, subunit II  53.33 
 
 		 254 aa  311  9e-84  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  46.37 
 
 		 255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4648  cytochrome c oxidase subunit II  46.64 
 
 		 286 aa  218  8.999999999999998e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.5298  normal  0.167898 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  41.1 
 
 		 279 aa  216  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  38.96 
 
 		 284 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0255  cytochrome-c oxidase  41 
 
 		 285 aa  206  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3463  cytochrome-c oxidase  41 
 
 		 285 aa  206  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2234  cytochrome-c oxidase  40.38 
 
 		 292 aa  205  6e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00748725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  42.92 
 
 		 279 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal  0.503108 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0223  cytochrome c oxidase, subunit II  41.18 
 
 		 285 aa  202  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0761  cytochrome c oxidase, subunit II  41.18 
 
 		 285 aa  202  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  40.47 
 
 		 287 aa  202  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0467  cytochrome c oxidase, subunit II  41.87 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0581  cytochrome c oxidase subunit II  43.44 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00300077  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4588  cytochrome-c oxidase  40.68 
 
 		 284 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1237  cytochrome c oxidase, subunit II  39.48 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109976 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0899  cytochrome c oxidase, subunit II  41.1 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20634  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  37.89 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0260  cytochrome c oxidase, subunit II  38.96 
 
 		 288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150091  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2336  cytochrome c oxidase, subunit II  37.09 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.273176  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  38.82 
 
 		 304 aa  194  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  36.8 
 
 		 279 aa  192  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  41.92 
 
 		 401 aa  192  6e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  41.92 
 
 		 401 aa  192  6e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3155  cytochrome c oxidase, subunit II  38.98 
 
 		 320 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2349  cytochrome c oxidase, subunit II  38.89 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  40.24 
 
 		 320 aa  189  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  35.57 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  35.57 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1140  cytochrome c oxidase subunit II  37.86 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0518  cytochrome c oxidase subunit II  41.42 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3875  cytochrome c oxidase, subunit II  45.07 
 
 		 338 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4787  cytochrome-c oxidase  40.25 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0614  cytochrome-c oxidase  38.76 
 
 		 303 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1039  cytochrome c oxidase subunit II  40.89 
 
 		 312 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866528  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0913  cytochrome-c oxidase  39.83 
 
 		 349 aa  180  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214333  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1826  cytochrome c oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2)  37.35 
 
 		 303 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0474  cytochrome-c oxidase  37.35 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  40.61 
 
 		 405 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  38.14 
 
 		 343 aa  177  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0730  cytochrome c oxidase, subunit II  37.39 
 
 		 295 aa  175  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.255439  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  38.1 
 
 		 377 aa  175  5e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  37.25 
 
 		 385 aa  175  8e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04019  cytochrome c oxidase, subunit II  39.02 
 
 		 308 aa  175  8e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  37.69 
 
 		 520 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  36.69 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0642  cytochrome c oxidase, subunit II  36.92 
 
 		 294 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.439468 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  37.45 
 
 		 513 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4321  cytochrome-c oxidase  35.46 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.018888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  38.37 
 
 		 512 aa  172  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  37.07 
 
 		 513 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  36.68 
 
 		 513 aa  171  9e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  36.14 
 
 		 385 aa  171  9e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  38.91 
 
 		 513 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0142  cytochrome c oxidase, subunit II  37.11 
 
 		 374 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  37.6 
 
 		 518 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  37.89 
 
 		 518 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  37.6 
 
 		 518 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  37.89 
 
 		 518 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  40.36 
 
 		 524 aa  169  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  39.16 
 
 		 528 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  36.86 
 
 		 521 aa  168  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  37.6 
 
 		 524 aa  168  8e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2167  cytochrome c oxidase, subunit II  36.29 
 
 		 316 aa  168  8e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.238577  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  35.91 
 
 		 513 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0602  cytochrome c oxidase, subunit II  36.92 
 
 		 294 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  35.51 
 
 		 422 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  37.77 
 
 		 523 aa  164  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  34.8 
 
 		 418 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  36.76 
 
 		 387 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  35.63 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  35.97 
 
 		 421 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  34.4 
 
 		 418 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  38.15 
 
 		 401 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  33.85 
 
 		 374 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  34.14 
 
 		 389 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  35.27 
 
 		 366 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  33.71 
 
 		 538 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  33.85 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  36.73 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  36.29 
 
 		 382 aa  159  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  40.35 
 
 		 511 aa  159  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  34.09 
 
 		 544 aa  158  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  32.31 
 
 		 375 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  33.74 
 
 		 373 aa  157  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  33.74 
 
 		 375 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  33.72 
 
 		 557 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  33.73 
 
 		 392 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  33.2 
 
 		 375 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  33.2 
 
 		 375 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  32.57 
 
 		 531 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  32.57 
 
 		 532 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  36.96 
 
 		 384 aa  156  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  32.57 
 
 		 532 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  32.57 
 
 		 532 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  34.01 
 
 		 390 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  32.54 
 
 		 398 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  32.78 
 
 		 375 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>