84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3474 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3474  fimbrial protein  100 
 
 
173 aa  351  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.855494  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2492  putative minor fimbrial subunit  80.65 
 
 
174 aa  264  5e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000455389  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2628  fimbrial protein  60.36 
 
 
179 aa  206  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1323  Fimbrial protein  56.57 
 
 
179 aa  200  9e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.539494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2485  fimbrial protein  57.96 
 
 
179 aa  191  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1319  fimbrial protein  57.96 
 
 
179 aa  191  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02258  predicted fimbrial-like adhesin protein  53.8 
 
 
183 aa  174  8e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02218  hypothetical protein  53.8 
 
 
183 aa  174  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.918949  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0221  minor fimbrial subunit StfG  45.66 
 
 
176 aa  144  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000010852  normal  0.588563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0237  minor fimbrial subunit StfG  45.09 
 
 
176 aa  144  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000054722  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0236  minor fimbrial subunit StfG  46.71 
 
 
176 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0219  minor fimbrial subunit StfG  45.66 
 
 
176 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000084521  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3093  fimbrial subunit  40.72 
 
 
178 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3274  fimbrial subunit  40 
 
 
178 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3176  fimbrial subunit  40 
 
 
178 aa  127  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.312999 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3157  fimbrial subunit  38.24 
 
 
178 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.243757 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3475  putative minor fimbrial subunit  100 
 
 
57 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.448503  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2713  fimbrial protein  59.68 
 
 
89 aa  82  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.790639  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0408  fimbrial protein  31.01 
 
 
181 aa  79  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4139  fimbrial protein  25.97 
 
 
180 aa  77.4  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274717  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4717  fimbrial protein  31.21 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0885059  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  29.05 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0822  Fimbrial protein  37 
 
 
189 aa  61.2  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  32.43 
 
 
176 aa  60.8  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1057  Fimbrial protein  37 
 
 
189 aa  60.5  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  28.9 
 
 
171 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  28.9 
 
 
171 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  28.9 
 
 
171 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  29.11 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  29.11 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  26.67 
 
 
179 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  26.67 
 
 
179 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  26.92 
 
 
165 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  26.67 
 
 
179 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  26.67 
 
 
179 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  32.28 
 
 
182 aa  52  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  32.31 
 
 
184 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  26.67 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  28.81 
 
 
182 aa  48.1  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  30.51 
 
 
177 aa  47.8  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  26.67 
 
 
165 aa  47  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  27.7 
 
 
170 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  31.54 
 
 
182 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  28.57 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  26.46 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  25.89 
 
 
185 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  31.54 
 
 
182 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  31.54 
 
 
182 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  26.29 
 
 
185 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  26.29 
 
 
185 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  27.89 
 
 
174 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  27.72 
 
 
183 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00949  hypothetical protein  25.14 
 
 
179 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.654237  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00942  predicted fimbrial-like adhesin protein  25.14 
 
 
179 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.608111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2705  Fimbrial protein  25.14 
 
 
179 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296528  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  27.52 
 
 
170 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  25.27 
 
 
176 aa  44.7  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2658  fimbrial protein  25.14 
 
 
179 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  25.27 
 
 
176 aa  44.7  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  25.27 
 
 
176 aa  44.7  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  25.27 
 
 
176 aa  44.7  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  27.52 
 
 
170 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  25.27 
 
 
176 aa  44.7  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  27.52 
 
 
170 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  27.52 
 
 
170 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  28.74 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  27.52 
 
 
170 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  28.74 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.74 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  28.74 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  28.74 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4672  fimbrial protein  27.51 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1100  fimbrial protein  25.95 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.159551  normal  0.51089 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4919  putative fimbrial chaparone  24.53 
 
 
181 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.663343  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  27.98 
 
 
176 aa  42.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  28.99 
 
 
176 aa  42  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  28.99 
 
 
176 aa  42  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4846  putative fimbrial chaparone  24.16 
 
 
181 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.417477  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5008  putative fimbrial chaperone  24.16 
 
 
181 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  28.8 
 
 
174 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  28.8 
 
 
174 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4953  putative fimbrial chaperone  24.16 
 
 
181 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  28.8 
 
 
174 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5005  putative fimbrial chaperone  24.16 
 
 
181 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>