More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0987 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0987  Holliday junction resolvase  100 
 
 		 166 aa  330  4e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3202  Holliday junction resolvase  75.64 
 
 		 197 aa  237  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0673445 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2324  Holliday junction resolvase  67.3 
 
 		 166 aa  204  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.747333  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  60.12 
 
 		 173 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3491  Holliday junction resolvase  56.6 
 
 		 173 aa  196  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1747  Holliday junction resolvase  57.86 
 
 		 170 aa  191  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  0.595925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  42.04 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  44.1 
 
 		 176 aa  127  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  43.04 
 
 		 180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.94 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  40.94 
 
 		 173 aa  124  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  44 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  44 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  44.67 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  40.99 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.86 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.99 
 
 		 173 aa  121  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  40.37 
 
 		 173 aa  120  8e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  40.79 
 
 		 174 aa  120  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  40.79 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.87 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  44 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  39.13 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  39.75 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  39.75 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  37.58 
 
 		 182 aa  118  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  39.75 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  39.13 
 
 		 180 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  40.37 
 
 		 180 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  40.99 
 
 		 180 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  40.99 
 
 		 180 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  38.51 
 
 		 173 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3065  Holliday junction resolvase  42.67 
 
 		 169 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.31187  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2493  Holliday junction resolvase  48 
 
 		 165 aa  117  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  39.13 
 
 		 173 aa  117  9e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  40.99 
 
 		 180 aa  117  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  40.99 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2211  Holliday junction resolvase  47.33 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.06 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  39.38 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  39.75 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  39.75 
 
 		 180 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  40.14 
 
 		 180 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  40.67 
 
 		 275 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  40.67 
 
 		 284 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  39.75 
 
 		 180 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  39.75 
 
 		 180 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2236  Crossover junction endodeoxyribonuclease  44.22 
 
 		 179 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2240  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.58 
 
 		 182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  39.75 
 
 		 180 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  37.58 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  40.27 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  39.6 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  40.79 
 
 		 175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  39.75 
 
 		 180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  40.37 
 
 		 180 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  40.82 
 
 		 183 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  43.51 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  40.82 
 
 		 183 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0539  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.47 
 
 		 187 aa  114  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  40.74 
 
 		 181 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.33 
 
 		 162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  38.51 
 
 		 173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.24 
 
 		 179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  39.75 
 
 		 173 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  39.07 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1377  Holliday junction resolvase  35.26 
 
 		 184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180632  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  36.6 
 
 		 200 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  37.89 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  37.89 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0061  Holliday junction resolvase  45.86 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317029  normal  0.843846 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  37.89 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  38.12 
 
 		 162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  42.52 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  38.61 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  40.49 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.78 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  37.89 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0420  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.75 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0769  Holliday junction resolvase  37.28 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0476  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.47 
 
 		 190 aa  111  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3512  Holliday junction resolvase  39.63 
 
 		 169 aa  111  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658473  normal  0.710668 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0529  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.76 
 
 		 188 aa  111  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2535  Holliday junction resolvase  41.25 
 
 		 173 aa  110  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.278528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  41.36 
 
 		 181 aa  110  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1103  Holliday junction resolvase  47.15 
 
 		 176 aa  110  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.788041  normal  0.52984 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  46.92 
 
 		 168 aa  110  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1846  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.11 
 
 		 186 aa  110  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.018832  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0060  Holliday junction resolvase  45.16 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1349  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353939 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3604  Holliday junction resolvase  39.63 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.758164  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1225  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.177509  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2057  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0681914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2052  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0336  Holliday junction resolvase  43.04 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2112  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0214105 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1247  Holliday junction resolvase  45.4 
 
 		 178 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2102  Holliday junction resolvase  39.35 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2431  Holliday junction resolvase  38.06 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.45 
 
 		 183 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>