More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0529 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0529  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 		 188 aa  380  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  44.94 
 
 		 182 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  48.72 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  43.71 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2236  Crossover junction endodeoxyribonuclease  48.75 
 
 		 179 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.71 
 
 		 173 aa  131  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  44.3 
 
 		 180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  43.83 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  47.44 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  43.83 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  45.86 
 
 		 174 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.12 
 
 		 165 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  43.45 
 
 		 173 aa  127  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  45.86 
 
 		 174 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  45.03 
 
 		 164 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01556  Holliday junction resolvase  44.23 
 
 		 174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  45.22 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  45.22 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  43.04 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  45.1 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  43.04 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  45.22 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  43.04 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2188  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.4 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240809  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  45.22 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  45.22 
 
 		 275 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  45.22 
 
 		 284 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  42.41 
 
 		 180 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  46.5 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  45.22 
 
 		 180 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1747  Holliday junction resolvase  42.86 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  0.595925 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  46.05 
 
 		 181 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  43.12 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  43.03 
 
 		 164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  44.3 
 
 		 168 aa  125  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  44.59 
 
 		 180 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  41.46 
 
 		 181 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  42.41 
 
 		 180 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  42.68 
 
 		 181 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  42.41 
 
 		 180 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  41.46 
 
 		 181 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  45.03 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.61 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  40.27 
 
 		 166 aa  122  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1060  Holliday junction resolvase  44.08 
 
 		 181 aa  121  6e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.68 
 
 		 175 aa  121  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  44 
 
 		 164 aa  121  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  44.16 
 
 		 173 aa  120  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2535  Holliday junction resolvase  45.81 
 
 		 173 aa  120  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.278528 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0941  Holliday junction resolvase  44.08 
 
 		 204 aa  120  9e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0987  Holliday junction resolvase  39.76 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  41.46 
 
 		 181 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1243  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.38 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  44.81 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1706  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.69 
 
 		 175 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0826466  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  43.42 
 
 		 180 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  42.04 
 
 		 175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0079  Holliday junction resolvase  38.22 
 
 		 181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2259  Holliday junction resolvase  47.88 
 
 		 173 aa  118  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1818  Holliday junction resolvase  47.88 
 
 		 173 aa  118  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2946  Holliday junction resolvase  46.15 
 
 		 173 aa  118  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185202  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2017  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.97 
 
 		 171 aa  117  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.365662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  42 
 
 		 164 aa  118  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2102  Holliday junction resolvase  47.59 
 
 		 173 aa  117  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  43.12 
 
 		 173 aa  117  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0061  Holliday junction resolvase  45.81 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317029  normal  0.843846 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0060  Holliday junction resolvase  45.75 
 
 		 166 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.14 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  42.68 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  38.86 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  44.72 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  47.01 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2778  Holliday junction resolvase  48.68 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0283844 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  44.1 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  44.1 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.75 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  40.26 
 
 		 180 aa  115  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2493  Holliday junction resolvase  45.75 
 
 		 165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  39.07 
 
 		 165 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  45 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  45 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  45 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  37.09 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.45 
 
 		 191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  40.52 
 
 		 156 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  45 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2032  Holliday junction resolvase  44.97 
 
 		 173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000234301  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  43.48 
 
 		 173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  37.27 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.34 
 
 		 163 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2145  Holliday junction resolvase  44.97 
 
 		 173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25841  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1846  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.05 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.018832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2423  Holliday junction resolvase  44.97 
 
 		 173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0385722  normal  0.655907 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  44.23 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  44.1 
 
 		 173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0138  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.17 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1377  Holliday junction resolvase  36.84 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  38.26 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0400  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.9 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3491  Holliday junction resolvase  36.53 
 
 		 173 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>