More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0777 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0923  SMC domain protein  67.4 
 
 		 550 aa  656    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.757485 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0777  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 539 aa  1065    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397479  normal  0.58729 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2596  DNA repair protein RecN  61.77 
 
 		 537 aa  630  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1216  SMC domain protein  58.68 
 
 		 531 aa  561  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0021  SMC domain protein  50.09 
 
 		 533 aa  486  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2848  SMC domain protein  50 
 
 		 533 aa  442  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  34.78 
 
 		 577 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  34.99 
 
 		 554 aa  267  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  35.56 
 
 		 558 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  32.01 
 
 		 580 aa  256  7e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 554 aa  250  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  35.75 
 
 		 553 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  31.83 
 
 		 573 aa  243  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  32.67 
 
 		 565 aa  238  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  34.86 
 
 		 556 aa  238  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 578 aa  237  4e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  33.63 
 
 		 574 aa  237  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  35.3 
 
 		 553 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  31.83 
 
 		 573 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  32.53 
 
 		 605 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  32.09 
 
 		 572 aa  231  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  35.13 
 
 		 553 aa  229  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  36.18 
 
 		 549 aa  229  9e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  31.75 
 
 		 555 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  34.62 
 
 		 556 aa  228  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  32.09 
 
 		 575 aa  227  4e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  31.79 
 
 		 589 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  34.98 
 
 		 557 aa  226  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  31.26 
 
 		 553 aa  226  7e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0426  DNA repair protein RecN  31.42 
 
 		 553 aa  224  3e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  34.55 
 
 		 554 aa  224  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  37.41 
 
 		 529 aa  223  4.9999999999999996e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  32.41 
 
 		 560 aa  223  6e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  32.04 
 
 		 582 aa  222  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  30.78 
 
 		 586 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  34.3 
 
 		 561 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  32.07 
 
 		 572 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  30.38 
 
 		 570 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  32.07 
 
 		 576 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  31.79 
 
 		 559 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  34.54 
 
 		 553 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  30.1 
 
 		 586 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  36.13 
 
 		 546 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  28.65 
 
 		 562 aa  220  3.9999999999999997e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  33.03 
 
 		 560 aa  219  7e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  36.41 
 
 		 572 aa  219  7.999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  30.1 
 
 		 586 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  28.78 
 
 		 565 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  32.41 
 
 		 568 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  31.78 
 
 		 560 aa  218  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  31.93 
 
 		 553 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  28.99 
 
 		 555 aa  218  2e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  28.9 
 
 		 579 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  30.06 
 
 		 608 aa  218  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  34.12 
 
 		 554 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  35.2 
 
 		 523 aa  218  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  30.06 
 
 		 556 aa  218  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  33.64 
 
 		 557 aa  218  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  30.95 
 
 		 553 aa  217  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  33.99 
 
 		 586 aa  217  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  28.98 
 
 		 579 aa  217  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  28.9 
 
 		 579 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  28.9 
 
 		 579 aa  217  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  36.13 
 
 		 546 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  28.9 
 
 		 579 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  34.27 
 
 		 565 aa  216  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  28.72 
 
 		 583 aa  216  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  32.1 
 
 		 569 aa  216  9e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 556 aa  216  9e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  28.72 
 
 		 583 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  28.72 
 
 		 579 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  34.38 
 
 		 557 aa  216  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  28.72 
 
 		 579 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 558 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  33.87 
 
 		 559 aa  216  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0776  DNA repair protein RecN  34.7 
 
 		 611 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163902  normal  0.739738 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  30.04 
 
 		 555 aa  215  9.999999999999999e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  32.92 
 
 		 595 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  34.83 
 
 		 557 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  34.04 
 
 		 561 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  32.04 
 
 		 568 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  33.03 
 
 		 557 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  28.6 
 
 		 565 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  29.16 
 
 		 574 aa  214  3.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  29.8 
 
 		 569 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  33.69 
 
 		 559 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 561 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  32.66 
 
 		 565 aa  213  7e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  33.04 
 
 		 601 aa  213  7.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  33.03 
 
 		 557 aa  213  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  32.14 
 
 		 557 aa  212  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  33.09 
 
 		 552 aa  212  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  27.87 
 
 		 552 aa  212  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  29.57 
 
 		 579 aa  212  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  33.98 
 
 		 599 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  29.91 
 
 		 565 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  31.61 
 
 		 567 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 561 aa  211  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  29.35 
 
 		 551 aa  211  3e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0537  DNA repair protein RecN  30.88 
 
 		 568 aa  210  4e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.674533  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>