More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3019 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
370 aa  746    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0593  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.35 
 
 
369 aa  208  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
387 aa  106  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 
386 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 
356 aa  100  6e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 
385 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
385 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  36.27 
 
 
350 aa  97.4  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
377 aa  97.1  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
377 aa  97.1  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 
389 aa  96.7  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
371 aa  96.3  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2730  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 
365 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.9123 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
398 aa  94.7  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  25.84 
 
 
374 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0381  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
367 aa  94  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  29.76 
 
 
366 aa  93.2  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
353 aa  93.2  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
384 aa  93.2  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
379 aa  93.2  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 
360 aa  92.8  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 
390 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
408 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.52 
 
 
366 aa  92.4  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  24.34 
 
 
369 aa  91.3  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
386 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
376 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
396 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
386 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  34.46 
 
 
391 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.44 
 
 
419 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0320  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
373 aa  90.9  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527703  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
364 aa  90.5  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 
398 aa  90.1  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
377 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  31.12 
 
 
369 aa  89.7  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
395 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
364 aa  89  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3264  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
377 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
364 aa  89  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 
399 aa  89  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
388 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 
390 aa  88.2  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
369 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 
370 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
378 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2939  glycosyl transferase group 1  36.51 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.808292 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2380  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
371 aa  87.8  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
373 aa  87  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
372 aa  87  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 
401 aa  87  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  30.97 
 
 
372 aa  86.3  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 
439 aa  86.3  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 
476 aa  86.3  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 
360 aa  85.9  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  33.76 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
399 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0914  capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.5 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000157523  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 
403 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  33.96 
 
 
395 aa  84.7  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 
382 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 
384 aa  84.3  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  33.92 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.93 
 
 
373 aa  84  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 
436 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
743 aa  84  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  30.63 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 
382 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
396 aa  83.2  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  36.2 
 
 
739 aa  83.2  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  44.66 
 
 
750 aa  83.2  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  31.69 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
391 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  26.96 
 
 
381 aa  82.8  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 
396 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  31.42 
 
 
386 aa  82  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  31.38 
 
 
400 aa  82  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
371 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  31.89 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4421  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
370 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.54 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
1080 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0185  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 
385 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.634207 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
381 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1431  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.22 
 
 
498 aa  81.3  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1051  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 
445 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0660  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 
327 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.275219  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0461  lipopolysaccharide biosynthesis-related protein  19.58 
 
 
383 aa  80.5  0.00000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00755363  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
384 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.67 
 
 
465 aa  80.1  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  23.68 
 
 
371 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>