154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2260 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2260  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 259 aa  525  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0345  cobalamin synthesis protein, P47K  56.39 
 
 		 232 aa  276  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0743251  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0476  hypothetical protein  53.16 
 
 		 238 aa  275  4e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3327  cobalamin synthesis protein, P47K  55.07 
 
 		 227 aa  275  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0445  cobalamin synthesis protein P47K  55.51 
 
 		 228 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1989  cobalamin synthesis protein P47K  51.98 
 
 		 232 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1036  cobalamin synthesis protein P47K  53.1 
 
 		 227 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2095  hypothetical protein  51.98 
 
 		 227 aa  264  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.142349  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2105  urease and hydrogenase maturation regulator/Ni2+-binding GTPase  54.82 
 
 		 228 aa  261  4.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4262  cobalamin synthesis protein P47K  54.19 
 
 		 232 aa  261  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000645522  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1675  hypothetical protein  52.42 
 
 		 230 aa  258  6e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1977  cobalamin synthesis protein P47K  49.56 
 
 		 231 aa  258  6e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856485  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2370  cobalamin synthesis protein, P47K  55.51 
 
 		 234 aa  255  6e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00470  nickel incorporation protein  49.17 
 
 		 240 aa  254  8e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146336  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2266  hypothetical protein  49.13 
 
 		 230 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0407392  normal  0.68566 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1684  hypothetical protein  50.22 
 
 		 230 aa  249  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02420  nickel incorporation protein  49.12 
 
 		 234 aa  228  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183496  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1401  cobalamin synthesis protein, P47K  42.86 
 
 		 232 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.265062  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1275  cobalamin synthesis protein P47K  42.41 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0681  cobalamin synthesis protein P47K  42.86 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1283  cobalamin synthesis protein P47K  41.59 
 
 		 234 aa  209  4e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2610  cobalamin synthesis protein P47K  44.64 
 
 		 234 aa  195  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000165447  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0155  cobalamin synthesis protein P47K  39.91 
 
 		 236 aa  191  7e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1456  cobalamin synthesis protein, P47K  42.92 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0687195  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0682  cobalamin synthesis protein, P47K  43.36 
 
 		 232 aa  189  4e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2980  cobalamin synthesis protein, P47K  38.03 
 
 		 234 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1067  cobalamin synthesis protein/P47K  40.09 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0500  hypothetical protein  37.89 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0108  cobalamin synthesis protein, P47K  40.61 
 
 		 235 aa  154  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.83483  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2114  cobalamin synthesis protein, P47K  37.12 
 
 		 235 aa  148  9e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1793  cobalamin synthesis protein P47K  37.89 
 
 		 235 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2737  cobalamin synthesis protein P47K  35.37 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  27.81 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  27.51 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0748  urease accessory protein UreG  27.46 
 
 		 212 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2409  urease accessory protein UreG  29.38 
 
 		 220 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  24.18 
 
 		 278 aa  52.4  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  27.27 
 
 		 247 aa  52.4  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1430  hydrogenase accessory protein HypB  28.48 
 
 		 266 aa  52  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  26.49 
 
 		 225 aa  52  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  26.74 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  32 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4441  urease accessory protein UreG  27.08 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1902  hydrogenase accessory protein HypB  27.22 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389713 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2027  hydrogenase accessory protein HypB  28.57 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  30.48 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1883  hydrogenase accessory protein HypB  27.47 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  28.18 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  31.03 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2411  hydrogenase accessory protein HypB  27.47 
 
 		 285 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0449174  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1908  hydrogenase accessory protein HypB  27.62 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.121577  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1759  hydrogenase accessory protein HypB  27.5 
 
 		 277 aa  49.3  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2663  urease accessory protein UreG  31.08 
 
 		 249 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093444 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1915  hydrogenase accessory protein HypB  30.71 
 
 		 281 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.228802  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2093  hydrogenase accessory protein HypB  26.74 
 
 		 264 aa  48.9  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4413  urease accessory protein UreG  28 
 
 		 208 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0992  urease accessory protein UreG  32.43 
 
 		 207 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1198  urease accessory protein UreG  25.91 
 
 		 214 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195176  normal  0.215478 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1082  urease accessory protein UreG  27.04 
 
 		 220 aa  48.9  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3559  urease accessory protein  27.04 
 
 		 220 aa  48.9  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29571  normal  0.0153059 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1136  urease accessory protein UreG  27.04 
 
 		 220 aa  48.9  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.755264  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3363  hydrogenase accessory protein HypB  26.23 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  28 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2109  hydrogenase accessory protein HypB  31.72 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432968  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1963  urease accessory protein UreG  28.21 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  27.57 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  27.37 
 
 		 217 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3942  urease accessory protein UreG  28.65 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  26.77 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1816  hydrogenase accessory protein HypB  30.94 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2161  hydrogenase accessory protein HypB  30.94 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1358  urease accessory protein UreG  25.91 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6188  urease accessory protein UreG  27.18 
 
 		 208 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1836  hydrogenase accessory protein HypB  27.22 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  27.37 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1701  urease accessory protein UreG  27.37 
 
 		 204 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266659 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0534  hydrogenase accessory protein HypB  31.13 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1938  hydrogenase accessory protein HypB  28.81 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  26.63 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1871  hydrogenase accessory protein HypB  30.94 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3881  hydrogenase accessory protein HypB  26.14 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785177 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1137  urease accessory protein UreG  25.91 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1497  hydrogenase accessory protein HypB  28.89 
 
 		 222 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  29.14 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0058  urease accessory protein UreG  30.38 
 
 		 204 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.418935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  29.94 
 
 		 306 aa  46.6  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0723  urease accessory protein UreG  30.41 
 
 		 203 aa  46.6  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2360  urease accessory protein  28.21 
 
 		 202 aa  46.6  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.695138 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  28.02 
 
 		 224 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2196  urease accessory protein UreG  28.35 
 
 		 220 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0983  urease accessory protein UreG  26.6 
 
 		 217 aa  46.2  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.942838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1946  urease accessory protein UreG  31.08 
 
 		 207 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00965207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  30.05 
 
 		 204 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64670  urease accessory protein UreG  29.53 
 
 		 204 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00341231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  27.43 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17110  hydrogenase accessory protein HypB  27.23 
 
 		 223 aa  45.8  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0302  urease accessory protein G  31.08 
 
 		 207 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1089  hydrogenase accessory protein HypB  27.63 
 
 		 220 aa  45.4  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0335  hydrogenase accessory protein HypB  28.57 
 
 		 215 aa  45.4  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.734472 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  27.43 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>