More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1089 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1089  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 		 220 aa  448  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3363  hydrogenase accessory protein HypB  47.73 
 
 		 220 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  43.46 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  43.93 
 
 		 217 aa  188  4e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  42.99 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0448  hydrogenase accessory protein HypB  39.52 
 
 		 220 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1307  hydrogenase accessory protein HypB  39.62 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00162338  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2829  hydrogenase accessory protein HypB  41.43 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11720  hydrogenase accessory protein HypB  43.33 
 
 		 217 aa  181  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.708429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0929  hydrogenase accessory protein HypB  39.9 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  41.51 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1497  hydrogenase accessory protein HypB  38.03 
 
 		 222 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  41.63 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3165  hydrogenase accessory protein HypB  39.15 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0461052 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  41.67 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  40.87 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03880  hydrogenase accessory protein HypB  40.87 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  45.71 
 
 		 326 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0534  hydrogenase accessory protein HypB  40.19 
 
 		 275 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  43.15 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2581  hydrogenase accessory protein HypB  40.38 
 
 		 218 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3017  hydrogenase accessory protein HypB  41.46 
 
 		 217 aa  171  9e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3904  hydrogenase accessory protein HypB  39.9 
 
 		 284 aa  169  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  40.98 
 
 		 303 aa  170  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0866  hydrogenase accessory protein HypB  42.11 
 
 		 305 aa  169  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  45.09 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0718  hydrogenase accessory protein HypB  42.11 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  45.09 
 
 		 266 aa  168  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1458  hydrogenase accessory protein HypB  42.16 
 
 		 268 aa  168  6e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2482  hydrogenase accessory protein HypB  44.19 
 
 		 239 aa  168  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0721  hydrogenase accessory protein HypB  42.11 
 
 		 270 aa  168  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  39.44 
 
 		 227 aa  168  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3881  hydrogenase accessory protein HypB  39.72 
 
 		 267 aa  167  9e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0478  hydrogenase nickel incorporation  40.95 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  42.93 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0756  hydrogenase accessory protein HypB  38.1 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.901261  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1737  hydrogenase accessory protein HypB  39.23 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  40.38 
 
 		 253 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  42.78 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  43.41 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  39.23 
 
 		 269 aa  165  5e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796055  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0438  hydrogenase accessory protein HypB  39.53 
 
 		 284 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408549 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3978  hydrogenase accessory protein HypB  39.22 
 
 		 283 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  41.63 
 
 		 244 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0427  hydrogenase accessory protein HypB  39.53 
 
 		 284 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  41.12 
 
 		 307 aa  164  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2145  hydrogenase accessory protein HypB  39.91 
 
 		 261 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2191  hydrogenase accessory protein HypB  39.91 
 
 		 261 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  39.81 
 
 		 283 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1563  hydrogenase accessory protein HypB  39.15 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0444465  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  41.09 
 
 		 268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08010  hydrogenase accessory protein HypB  38.21 
 
 		 273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2132  hydrogenase accessory protein HypB  39.44 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364389 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  39.9 
 
 		 294 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  40.38 
 
 		 276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  39.23 
 
 		 277 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  37.16 
 
 		 352 aa  162  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1648  hydrogenase accessory protein HypB  42.51 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1169  hydrogenase accessory protein HypB  41.87 
 
 		 268 aa  162  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1020  hydrogenase accessory protein HypB  38.73 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0475  hydrogenase accessory protein HypB  39.13 
 
 		 288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1212  GTP hydrolase, accessory liganding Ni into hydrogenases, HypB  39.9 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113745 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0171  hydrogenase accessory protein HypB  41.09 
 
 		 303 aa  161  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.452603  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2043  hydrogenase accessory protein HypB  39.13 
 
 		 253 aa  161  8.000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  39.41 
 
 		 282 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  39.71 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  40.61 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1644  hydrogenase accessory protein HypB  39.22 
 
 		 270 aa  159  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  38.83 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3748  hydrogenase accessory protein HypB  41.5 
 
 		 319 aa  159  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  37.74 
 
 		 306 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2548  hydrogenase accessory protein HypB  36.73 
 
 		 264 aa  158  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0731217  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1810  hydrogenase accessory protein HypB  40.59 
 
 		 292 aa  157  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4608  hydrogenase accessory protein HypB  38.97 
 
 		 281 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  38.94 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00350  hydrogenase accessory protein HypB  39.23 
 
 		 248 aa  156  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0802  hydrogenase accessory protein HypB  38.46 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.287566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  39.9 
 
 		 295 aa  156  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  37.98 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  44 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  39.9 
 
 		 244 aa  155  3e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  38.97 
 
 		 293 aa  156  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  44 
 
 		 247 aa  155  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  44 
 
 		 246 aa  155  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1079  hydrogenase accessory protein HypB  35.81 
 
 		 297 aa  155  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0788642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3365  hydrogenase expression/synthesis, HypA  38.46 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2417  hydrogenase accessory protein HypB  37.09 
 
 		 267 aa  155  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0580161  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2007  hydrogenase nickel incorporation  39.91 
 
 		 321 aa  154  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17110  hydrogenase accessory protein HypB  39.9 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0469  hydrogenase accessory protein HypB  36.54 
 
 		 230 aa  154  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.590808  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1673  hydrogenase accessory protein HypB  37.02 
 
 		 258 aa  154  9e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0175  hydrogenase nickel incorporation protein  40 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1933  hydrogenase nickel incorporation protein  36.67 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.125072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.85 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  39.42 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0768  hydrogenase accessory protein HypB  38.24 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  35.85 
 
 		 290 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1938  hydrogenase accessory protein HypB  41.94 
 
 		 283 aa  153  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.85 
 
 		 290 aa  153  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.85 
 
 		 290 aa  153  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>