More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2581 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2581  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 		 218 aa  442  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2829  hydrogenase accessory protein HypB  50.5 
 
 		 216 aa  211  7e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  51.17 
 
 		 225 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3363  hydrogenase accessory protein HypB  44.55 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0448  hydrogenase accessory protein HypB  46.15 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0929  hydrogenase accessory protein HypB  48.08 
 
 		 224 aa  198  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3165  hydrogenase accessory protein HypB  47.87 
 
 		 218 aa  198  6e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0461052 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11720  hydrogenase accessory protein HypB  53.54 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.708429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  45.75 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  45.28 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  47.14 
 
 		 300 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  45.28 
 
 		 217 aa  192  4e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  41.9 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1307  hydrogenase accessory protein HypB  48.34 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00162338  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1497  hydrogenase accessory protein HypB  45.67 
 
 		 222 aa  190  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  45.24 
 
 		 217 aa  188  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  47.37 
 
 		 268 aa  186  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0756  hydrogenase accessory protein HypB  42.31 
 
 		 218 aa  185  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.901261  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0469  hydrogenase accessory protein HypB  45.71 
 
 		 230 aa  184  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.590808  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3219  hydrogenase accessory protein HypB  46.98 
 
 		 261 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  41.86 
 
 		 225 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  44.34 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  45.16 
 
 		 283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  42.45 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  42.45 
 
 		 247 aa  182  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  44.76 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  46.73 
 
 		 301 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  42.45 
 
 		 247 aa  181  6e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  40.93 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  46.41 
 
 		 277 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  43.66 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  42.45 
 
 		 295 aa  178  5.999999999999999e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1648  hydrogenase accessory protein HypB  48.84 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  43.46 
 
 		 286 aa  178  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2357  hydrogenase accessory protein HypB  44.81 
 
 		 254 aa  177  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142835 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  41.98 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03880  hydrogenase accessory protein HypB  41.23 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1563  hydrogenase accessory protein HypB  40.57 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0444465  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0478  hydrogenase nickel incorporation  44.5 
 
 		 237 aa  175  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1089  hydrogenase accessory protein HypB  40.38 
 
 		 220 aa  175  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  38.53 
 
 		 253 aa  175  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  41.98 
 
 		 307 aa  175  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  42.92 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  46.73 
 
 		 254 aa  174  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  44.08 
 
 		 231 aa  174  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  47.42 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  39.35 
 
 		 352 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2488  hydrogenase accessory protein HypB  44.44 
 
 		 308 aa  173  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  41.78 
 
 		 276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1079  hydrogenase accessory protein HypB  44.81 
 
 		 297 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0788642  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2165  hydrogenase accessory protein HypB  39.62 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2191  hydrogenase accessory protein HypB  44.29 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3017  hydrogenase accessory protein HypB  39.62 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2145  hydrogenase accessory protein HypB  44.29 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  43.87 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2157  hydrogenase accessory protein HypB  44.13 
 
 		 289 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.126874  normal  0.122693 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  43.4 
 
 		 303 aa  171  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  41.67 
 
 		 326 aa  171  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  43.81 
 
 		 293 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1933  hydrogenase nickel incorporation protein  40.48 
 
 		 223 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.125072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  42.58 
 
 		 268 aa  171  9e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2007  hydrogenase nickel incorporation  43.81 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0506  NI2+-binding GTPase protein HypB  43.66 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2132  hydrogenase accessory protein HypB  43.6 
 
 		 263 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364389 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  43.27 
 
 		 292 aa  169  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  39.52 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0871  hydrogenase accessory protein HypB  40.48 
 
 		 283 aa  169  3e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3365  hydrogenase expression/synthesis, HypA  41.71 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186715 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  40 
 
 		 278 aa  168  5e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1417  hydrogenase accessory protein HypB  42.38 
 
 		 394 aa  168  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2548  hydrogenase accessory protein HypB  44.2 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0731217  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3748  hydrogenase accessory protein HypB  43.06 
 
 		 319 aa  167  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0175  hydrogenase nickel incorporation protein  45.13 
 
 		 279 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  42.92 
 
 		 244 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1169  hydrogenase accessory protein HypB  41.9 
 
 		 268 aa  166  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  42.45 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00350  hydrogenase accessory protein HypB  40.18 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  41.01 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796055  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2417  hydrogenase accessory protein HypB  42.18 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0580161  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  40.48 
 
 		 266 aa  165  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  40.48 
 
 		 267 aa  165  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1160  hydrogenase accessory protein HypB  41.98 
 
 		 313 aa  165  5.9999999999999996e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  41.04 
 
 		 290 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0438  hydrogenase accessory protein HypB  38.21 
 
 		 284 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408549 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  41.04 
 
 		 290 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0427  hydrogenase accessory protein HypB  38.21 
 
 		 284 aa  164  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  41.04 
 
 		 290 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  41.04 
 
 		 290 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  42.79 
 
 		 296 aa  164  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08010  hydrogenase accessory protein HypB  44.34 
 
 		 273 aa  164  9e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  43.33 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3978  hydrogenase accessory protein HypB  40.57 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  40.93 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2445  hydrogenase accessory protein HypB  39.08 
 
 		 323 aa  162  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1851  hydrogenase expression/formation protein  38.76 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0718  hydrogenase accessory protein HypB  41.78 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  44.44 
 
 		 303 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  40.57 
 
 		 290 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0866  hydrogenase accessory protein HypB  41.78 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0721  hydrogenase accessory protein HypB  40 
 
 		 270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>