More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1851 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1851  hydrogenase expression/formation protein  100 
 
 		 222 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0768  hydrogenase accessory protein HypB  51.57 
 
 		 224 aa  228  4e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0055  hydrogenase accessory protein HypB  51.12 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1150  hydrogenase accessory protein HypB  51.12 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.922491  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1020  hydrogenase accessory protein HypB  53.77 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0833  hydrogenase accessory protein HypB  51.8 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  42.92 
 
 		 225 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1515  hypothetical protein  46.38 
 
 		 215 aa  191  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.890478 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0335  hydrogenase accessory protein HypB  46.01 
 
 		 215 aa  188  5e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.734472 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2484  hydrogenase accessory protein HypB  43.81 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2308  hydrogenase accessory protein HypB  44.6 
 
 		 215 aa  183  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  40.78 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  38.97 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08010  hydrogenase accessory protein HypB  42.16 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0470  hydrogenase accessory protein HypB  42.25 
 
 		 215 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.296662  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2335  hydrogenase accessory protein HypB  47.12 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  41.67 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  38.35 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  39.51 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1644  hydrogenase accessory protein HypB  38.25 
 
 		 270 aa  174  9e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3904  hydrogenase accessory protein HypB  39.81 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  42.36 
 
 		 322 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  41.4 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  38.94 
 
 		 269 aa  171  5.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796055  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2417  hydrogenase accessory protein HypB  40.95 
 
 		 267 aa  170  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0580161  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  39.05 
 
 		 300 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  37.33 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  38.94 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  38.57 
 
 		 235 aa  169  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1169  hydrogenase accessory protein HypB  40.95 
 
 		 268 aa  169  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  37.44 
 
 		 231 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  40.28 
 
 		 283 aa  169  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  37.26 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  39.41 
 
 		 290 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  39.22 
 
 		 301 aa  168  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  39.41 
 
 		 290 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  40.1 
 
 		 303 aa  168  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  39.41 
 
 		 290 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  39.41 
 
 		 290 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  38.6 
 
 		 292 aa  168  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2191  hydrogenase accessory protein HypB  40.95 
 
 		 261 aa  167  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2145  hydrogenase accessory protein HypB  40.95 
 
 		 261 aa  167  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  36.84 
 
 		 242 aa  166  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0478  hydrogenase nickel incorporation  39.81 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2132  hydrogenase accessory protein HypB  40.95 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364389 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3748  hydrogenase accessory protein HypB  39.71 
 
 		 319 aa  166  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  36.84 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  40.3 
 
 		 306 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  38.57 
 
 		 352 aa  165  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  36.49 
 
 		 281 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02577  GTP hydrolase involved in nickel liganding into hydrogenases  38.92 
 
 		 290 aa  165  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  38.92 
 
 		 290 aa  165  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.92 
 
 		 290 aa  165  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.92 
 
 		 290 aa  165  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  38.92 
 
 		 290 aa  165  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.42 
 
 		 290 aa  165  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2852  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.92 
 
 		 290 aa  165  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.484483 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3150  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.92 
 
 		 290 aa  165  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.92 
 
 		 290 aa  165  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3165  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.92 
 
 		 290 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.591749 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2829  hydrogenase accessory protein HypB  35.27 
 
 		 216 aa  164  8e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  37.8 
 
 		 246 aa  164  8e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  40.2 
 
 		 303 aa  164  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1458  hydrogenase accessory protein HypB  45.51 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  40.4 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  39.41 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  39.9 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  35.94 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  38.92 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1765  hydrogenase accessory protein HypB  38.28 
 
 		 264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.997182 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  39.9 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1160  hydrogenase accessory protein HypB  38.46 
 
 		 313 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0721  hydrogenase accessory protein HypB  39.42 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1417  hydrogenase accessory protein HypB  38.57 
 
 		 394 aa  162  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  39.41 
 
 		 247 aa  162  3e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  39.23 
 
 		 293 aa  162  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  38.89 
 
 		 326 aa  162  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  37.62 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  36.36 
 
 		 280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  37.62 
 
 		 270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  38.21 
 
 		 294 aa  161  6e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00350  hydrogenase accessory protein HypB  37.27 
 
 		 248 aa  162  6e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0469  hydrogenase accessory protein HypB  36.36 
 
 		 230 aa  161  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.590808  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  40.59 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0866  hydrogenase accessory protein HypB  37.32 
 
 		 305 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1079  hydrogenase accessory protein HypB  37.31 
 
 		 297 aa  160  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0788642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  39.71 
 
 		 307 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0718  hydrogenase accessory protein HypB  37.32 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2527  hydrogenase accessory protein HypB  39.41 
 
 		 407 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455957  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3365  hydrogenase expression/synthesis, HypA  39.9 
 
 		 263 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186715 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2488  hydrogenase accessory protein HypB  38.94 
 
 		 308 aa  159  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0534  hydrogenase accessory protein HypB  41.38 
 
 		 275 aa  159  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  39.6 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1212  GTP hydrolase, accessory liganding Ni into hydrogenases, HypB  38.94 
 
 		 264 aa  159  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2007  hydrogenase nickel incorporation  37.62 
 
 		 321 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  37.21 
 
 		 312 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  35.71 
 
 		 295 aa  158  5e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11720  hydrogenase accessory protein HypB  38.16 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.708429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1648  hydrogenase accessory protein HypB  40 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2018  hydrogenase accessory protein HypB  38.28 
 
 		 315 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>