More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1515 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1515  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  436  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.890478 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2308  hydrogenase accessory protein HypB  70.23 
 
 		 215 aa  327  6e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2484  hydrogenase accessory protein HypB  67.91 
 
 		 215 aa  317  6e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0470  hydrogenase accessory protein HypB  67.44 
 
 		 215 aa  313  9.999999999999999e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.296662  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0335  hydrogenase accessory protein HypB  62.62 
 
 		 215 aa  298  4e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.734472 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1150  hydrogenase accessory protein HypB  51.42 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.922491  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0055  hydrogenase accessory protein HypB  51.42 
 
 		 224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0768  hydrogenase accessory protein HypB  49.53 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1020  hydrogenase accessory protein HypB  48.57 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1851  hydrogenase expression/formation protein  46.38 
 
 		 222 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0833  hydrogenase accessory protein HypB  48.58 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2335  hydrogenase accessory protein HypB  49.17 
 
 		 297 aa  168  5e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  43.43 
 
 		 242 aa  168  7e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  40.48 
 
 		 253 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1759  hydrogenase accessory protein HypB  41.26 
 
 		 277 aa  165  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2109  hydrogenase accessory protein HypB  41.5 
 
 		 239 aa  164  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432968  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1836  hydrogenase accessory protein HypB  41.18 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1908  hydrogenase accessory protein HypB  40.69 
 
 		 277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.121577  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2007  hydrogenase nickel incorporation  42.57 
 
 		 321 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1883  hydrogenase accessory protein HypB  40.69 
 
 		 281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  40.89 
 
 		 326 aa  161  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  39.71 
 
 		 225 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2093  hydrogenase accessory protein HypB  41.18 
 
 		 264 aa  160  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1902  hydrogenase accessory protein HypB  40.49 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389713 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1915  hydrogenase accessory protein HypB  40.2 
 
 		 281 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.228802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1816  hydrogenase accessory protein HypB  40.5 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1871  hydrogenase accessory protein HypB  40.2 
 
 		 253 aa  158  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  41.84 
 
 		 244 aa  158  6e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2411  hydrogenase accessory protein HypB  40.2 
 
 		 285 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0449174  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  39.8 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  40.69 
 
 		 293 aa  156  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  40.89 
 
 		 303 aa  156  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2161  hydrogenase accessory protein HypB  39.71 
 
 		 253 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  41.58 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  40.87 
 
 		 269 aa  156  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2027  hydrogenase accessory protein HypB  39.51 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  39.9 
 
 		 247 aa  155  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  40.38 
 
 		 294 aa  155  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  39.91 
 
 		 252 aa  155  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1417  hydrogenase accessory protein HypB  40.59 
 
 		 394 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  39.39 
 
 		 247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2527  hydrogenase accessory protein HypB  39.9 
 
 		 407 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455957  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  38.42 
 
 		 295 aa  153  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  38.89 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3881  hydrogenase accessory protein HypB  35.98 
 
 		 267 aa  152  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1673  hydrogenase accessory protein HypB  38.42 
 
 		 258 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  40.39 
 
 		 290 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  40.39 
 
 		 290 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  40.39 
 
 		 290 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  40.39 
 
 		 290 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4608  hydrogenase accessory protein HypB  36.41 
 
 		 281 aa  151  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0534  hydrogenase accessory protein HypB  40.38 
 
 		 275 aa  151  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  36.27 
 
 		 278 aa  151  7e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0175  hydrogenase nickel incorporation protein  45.18 
 
 		 279 aa  151  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  40.5 
 
 		 307 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  38.19 
 
 		 301 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0534  hydrogenase accessory protein HypB  38.36 
 
 		 300 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  37.26 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1169  hydrogenase accessory protein HypB  38.42 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  36.45 
 
 		 284 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  36.45 
 
 		 281 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1212  GTP hydrolase, accessory liganding Ni into hydrogenases, HypB  37.14 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113745 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  37.56 
 
 		 252 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1430  hydrogenase accessory protein HypB  37.25 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  39.3 
 
 		 300 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02577  GTP hydrolase involved in nickel liganding into hydrogenases  39.42 
 
 		 290 aa  148  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  39.42 
 
 		 290 aa  148  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  39.42 
 
 		 290 aa  148  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  39.42 
 
 		 290 aa  148  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  39.42 
 
 		 290 aa  148  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2852  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  39.42 
 
 		 290 aa  148  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.484483 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3150  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  39.42 
 
 		 290 aa  148  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  38.38 
 
 		 217 aa  148  6e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0929  hydrogenase accessory protein HypB  35.24 
 
 		 224 aa  148  7e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  38.94 
 
 		 266 aa  147  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  38.94 
 
 		 267 aa  148  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  38.42 
 
 		 312 aa  147  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3165  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  39.9 
 
 		 290 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.591749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  39.42 
 
 		 290 aa  147  9e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  40.3 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  38.83 
 
 		 296 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2445  hydrogenase accessory protein HypB  34.62 
 
 		 323 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3904  hydrogenase accessory protein HypB  38.46 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  35.27 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2815  hydrogenase-3 accessory protein, assembly of metallocenter  37.04 
 
 		 345 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  37.62 
 
 		 306 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  37.86 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1963  hydrogenase accessory protein HypB  37.67 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  37.02 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.46 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  37.76 
 
 		 270 aa  145  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  37.95 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0871  hydrogenase accessory protein HypB  35.78 
 
 		 283 aa  145  3e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  38.58 
 
 		 217 aa  146  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3165  hydrogenase accessory protein HypB  36.18 
 
 		 218 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0461052 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  39.05 
 
 		 269 aa  145  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  35.96 
 
 		 280 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0171  hydrogenase accessory protein HypB  35.21 
 
 		 303 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.452603  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1644  hydrogenase accessory protein HypB  39.8 
 
 		 270 aa  145  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0721  hydrogenase accessory protein HypB  37.98 
 
 		 270 aa  145  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>