177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2095 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2095  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  463  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.142349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2266  hypothetical protein  65.78 
 
 		 230 aa  328  3e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0407392  normal  0.68566 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1036  cobalamin synthesis protein P47K  67.7 
 
 		 227 aa  322  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1977  cobalamin synthesis protein P47K  66.67 
 
 		 231 aa  318  6e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856485  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1989  cobalamin synthesis protein P47K  62.56 
 
 		 232 aa  317  1e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4262  cobalamin synthesis protein P47K  62.56 
 
 		 232 aa  314  7e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000645522  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0476  hypothetical protein  64.47 
 
 		 238 aa  313  9.999999999999999e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3327  cobalamin synthesis protein, P47K  60.79 
 
 		 227 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0445  cobalamin synthesis protein P47K  59.91 
 
 		 228 aa  308  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2105  urease and hydrogenase maturation regulator/Ni2+-binding GTPase  60.79 
 
 		 228 aa  304  6e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0345  cobalamin synthesis protein, P47K  58.67 
 
 		 232 aa  301  6.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0743251  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1675  hypothetical protein  62.27 
 
 		 230 aa  300  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2370  cobalamin synthesis protein, P47K  59.47 
 
 		 234 aa  295  4e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02420  nickel incorporation protein  57.71 
 
 		 234 aa  293  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183496  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00470  nickel incorporation protein  54.63 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146336  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2260  cobalamin synthesis protein P47K  51.98 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1684  hypothetical protein  51.54 
 
 		 230 aa  254  7e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1456  cobalamin synthesis protein, P47K  45.33 
 
 		 232 aa  218  5e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0687195  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1283  cobalamin synthesis protein P47K  45.33 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1275  cobalamin synthesis protein P47K  45.29 
 
 		 232 aa  214  7e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1401  cobalamin synthesis protein, P47K  45.29 
 
 		 232 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.265062  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0682  cobalamin synthesis protein, P47K  46.7 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0681  cobalamin synthesis protein P47K  45.29 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0155  cobalamin synthesis protein P47K  44.49 
 
 		 236 aa  208  7e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2610  cobalamin synthesis protein P47K  41.59 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000165447  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2980  cobalamin synthesis protein, P47K  39.04 
 
 		 234 aa  164  8e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0108  cobalamin synthesis protein, P47K  38.1 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.83483  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0500  hypothetical protein  37 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2737  cobalamin synthesis protein P47K  37.61 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2114  cobalamin synthesis protein, P47K  36.48 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1067  cobalamin synthesis protein/P47K  33.48 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1793  cobalamin synthesis protein P47K  36.24 
 
 		 235 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  29.14 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2829  hydrogenase accessory protein HypB  28.98 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0723  urease accessory protein UreG  30.48 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19201  urease accessory protein UreG  32.11 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1049  urease accessory protein UreG  32.11 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.113322  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  26.14 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  26.7 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0983  urease accessory protein UreG  28.11 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.942838  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  26.59 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1424  urease accessory protein UreG  28.96 
 
 		 201 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2621  urease accessory protein UreG  32.26 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131688  normal  0.804945 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  28.32 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  26.59 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29751  urease accessory protein UreG  30.11 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  24.86 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1556  urease accessory protein UreG  24.43 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  29.05 
 
 		 244 aa  52.8  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3942  urease accessory protein UreG  30.05 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  28.95 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2165  hydrogenase accessory protein HypB  30.46 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1244  urease accessory protein UreG  27.87 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2753  urease accessory protein UreG  30.6 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0806758  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1764  urease accessory protein UreG  29.1 
 
 		 203 aa  52  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.861416  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  26.34 
 
 		 217 aa  52  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1317  urease accessory protein UreG  27.54 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4213  urease accessory protein UreG  31.06 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4413  urease accessory protein UreG  28.96 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0748  urease accessory protein UreG  27.78 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  25.82 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  26.55 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1933  hydrogenase nickel incorporation protein  25.26 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.125072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  25.99 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2360  urease accessory protein  26.63 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.695138 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09380  urease accessory protein UreG  28.96 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2717  urease accessory protein  25 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2877  urease accessory protein UreG  26.78 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00892  urease accessory protein UreG  28.88 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870329  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4636  urease accessory protein UreG  28.42 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000195315  normal  0.0674257 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1563  hydrogenase accessory protein HypB  27.22 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0444465  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3363  hydrogenase accessory protein HypB  27.07 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00350  hydrogenase accessory protein HypB  26.71 
 
 		 248 aa  48.5  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5119  urease accessory protein UreG  29.9 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2063  urease accessory protein UreG  25 
 
 		 211 aa  48.5  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000301925  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  23.86 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2251  urease accessory protein UreG  32.24 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1079  hydrogenase accessory protein HypB  23.33 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0788642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  25.85 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1813  urease accessory protein UreG  29.12 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1361  urease accessory protein UreG  27.05 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.346026  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1464  urease accessory protein UreG  28.95 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1302  urease accessory protein UreG  28.95 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2803  urease accessory protein UreG  27.12 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0187  urease accessory protein UreG  26.79 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2847  urease accessory protein UreG  27.12 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2997  urease accessory protein UreG  28.8 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.787106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2830  urease accessory protein UreG  27.12 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  28.97 
 
 		 283 aa  46.6  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1701  urease accessory protein UreG  25.7 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1684  urease accessory protein UreG  25.52 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1089  hydrogenase accessory protein HypB  30.77 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4832  urease accessory protein UreG  27.87 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  24.57 
 
 		 271 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  26.9 
 
 		 277 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0224  urease accessory protein UreG  27.27 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1810  hydrogenase accessory protein HypB  27.17 
 
 		 292 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3350  urease accessory protein UreG  27.27 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.632937  normal  0.806624 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11720  hydrogenase accessory protein HypB  25.81 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.708429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  27.81 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>