More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1424 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1424  urease accessory protein UreG  100 
 
 
201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09380  urease accessory protein UreG  79.6 
 
 
204 aa  332  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  78.61 
 
 
204 aa  327  6e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64670  urease accessory protein UreG  78.11 
 
 
204 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00341231  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3942  urease accessory protein UreG  79.08 
 
 
225 aa  322  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2877  urease accessory protein UreG  77.11 
 
 
203 aa  321  5e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0664  urease accessory protein UreG  76.12 
 
 
204 aa  319  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.469815  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1764  urease accessory protein UreG  77.89 
 
 
203 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.861416  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0959  urease accessory protein UreG  71.64 
 
 
213 aa  308  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0983  urease accessory protein UreG  74.49 
 
 
217 aa  305  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.942838  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2997  urease accessory protein UreG  72.86 
 
 
203 aa  301  3.0000000000000004e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.787106 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4911  urease accessory protein UreG  77.11 
 
 
205 aa  300  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4453  urease accessory protein UreG  77.11 
 
 
205 aa  299  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0561  urease accessory protein UreG  77.61 
 
 
204 aa  299  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562305  normal  0.940607 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00892  urease accessory protein UreG  71.14 
 
 
203 aa  298  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870329  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1190  urease accessory protein UreG  72.45 
 
 
206 aa  296  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.257386  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1244  urease accessory protein UreG  69.95 
 
 
213 aa  295  4e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0187  urease accessory protein UreG  71.86 
 
 
211 aa  295  4e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2008  urease accessory protein UreG  70.92 
 
 
206 aa  294  6e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3107  urease accessory protein UreG  70.85 
 
 
202 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0224  urease accessory protein UreG  69.5 
 
 
207 aa  290  7e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1701  urease accessory protein UreG  72.96 
 
 
204 aa  290  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266659 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0787  urease accessory protein UreG  70.41 
 
 
215 aa  288  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876633  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0776  urease accessory protein UreG  70.41 
 
 
215 aa  288  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4636  urease accessory protein UreG  71.88 
 
 
200 aa  288  5.0000000000000004e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000195315  normal  0.0674257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4003  urease accessory protein UreG  70.41 
 
 
215 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1364  urease accessory protein UreG  70.92 
 
 
210 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4708  urease accessory protein UreG  71.43 
 
 
209 aa  287  7e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2493  urease accessory protein UreG  69.9 
 
 
215 aa  287  8e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0867  urease accessory protein UreG  69.9 
 
 
215 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0418  urease accessory protein UreG  69.9 
 
 
215 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0897  urease accessory protein UreG  69.9 
 
 
215 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626533  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1179  urease accessory protein UreG  67.86 
 
 
213 aa  283  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.585829  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3261  urease accessory protein UreG  68.88 
 
 
221 aa  282  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4248  urease accessory protein UreG  69.39 
 
 
216 aa  282  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1493  urease accessory protein UreG  69.39 
 
 
216 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.286659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1089  urease accessory protein UreG  69.39 
 
 
204 aa  281  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4032  urease accessory protein UreG  70.41 
 
 
207 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.199977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1384  urease accessory protein UreG  69.9 
 
 
210 aa  280  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29751  urease accessory protein UreG  69.43 
 
 
203 aa  280  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2187  urease accessory protein UreG  68.88 
 
 
216 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3079  urease accessory protein UreG  68.88 
 
 
216 aa  279  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3115  urease accessory protein UreG  68.88 
 
 
216 aa  279  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3138  urease accessory protein UreG  68.88 
 
 
216 aa  279  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2251  urease accessory protein UreG  68.91 
 
 
201 aa  279  2e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2554  urease accessory protein UreG  68.88 
 
 
216 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7567  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0720  urease accessory protein UreG  68.88 
 
 
216 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2060  urease accessory protein UreG  68.88 
 
 
216 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2990  urease accessory protein UreG  74.46 
 
 
212 aa  279  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.386954  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3533  urease accessory protein UreG  68 
 
 
229 aa  278  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.490615 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3408  urease accessory protein UreG  69 
 
 
229 aa  278  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.835805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1813  urease accessory protein UreG  66.33 
 
 
202 aa  278  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2377  urease accessory protein UreG  71.05 
 
 
203 aa  278  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.168299 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1477  urease accessory protein UreG  66.5 
 
 
212 aa  278  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0957656  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2117  urease accessory protein UreG  68.88 
 
 
204 aa  277  6e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2302  urease accessory protein UreG  73.91 
 
 
224 aa  277  8e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2621  urease accessory protein UreG  67.88 
 
 
201 aa  276  2e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131688  normal  0.804945 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1347  urease accessory protein UreG  69.5 
 
 
218 aa  275  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2261  urease accessory protein UreG  72.11 
 
 
201 aa  275  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587702  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0885  urease accessory protein UreG  73.37 
 
 
212 aa  274  6e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0925  urease accessory protein UreG  71.74 
 
 
217 aa  273  8e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3238  urease accessory protein UreG  66.33 
 
 
204 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.522124 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0971  urease accessory protein UreG  68 
 
 
218 aa  273  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3302  urease accessory protein UreG  66.84 
 
 
203 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.200502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3013  urease accessory protein UreG  66.33 
 
 
204 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311602  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3046  urease accessory protein UreG  66.84 
 
 
203 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.317226  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4160  urease accessory protein UreG  65.82 
 
 
211 aa  271  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3697  urease accessory protein UreG  71.2 
 
 
217 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.393725 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3202  urease accessory protein UreG  65.31 
 
 
204 aa  271  6e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2768  urease accessory protein UreG  66.16 
 
 
205 aa  270  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19201  urease accessory protein UreG  66.84 
 
 
205 aa  270  9e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1723  urease accessory protein UreG  68 
 
 
225 aa  270  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3469  urease accessory protein UreG  71.36 
 
 
205 aa  268  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000202938  normal  0.193841 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2867  urease accessory protein UreG  64.29 
 
 
205 aa  268  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.378326  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2849  urease accessory protein UreG  70.35 
 
 
207 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2931  urease accessory protein UreG  70.35 
 
 
207 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.193752  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2840  urease accessory protein UreG  70.35 
 
 
207 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1326  urease accessory protein UreG  71.86 
 
 
205 aa  268  5e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2029  urease accessory protein  70.05 
 
 
210 aa  266  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.133283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2421  urease accessory protein UreG  70.35 
 
 
207 aa  266  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0484289  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1049  urease accessory protein UreG  66.32 
 
 
205 aa  266  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.113322  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0585  urease accessory protein UreG  69.57 
 
 
214 aa  266  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.084211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0964  urease accessory protein UreG  68.48 
 
 
207 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0360581 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4213  urease accessory protein UreG  64.47 
 
 
212 aa  264  7e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1858  urease accessory protein UreG  69.54 
 
 
208 aa  263  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.801773  normal  0.157985 
 
 
-
 
NC_004310  BR0273  urease accessory protein UreG  65.31 
 
 
208 aa  263  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0998  urease accessory protein UreG  67.93 
 
 
209 aa  263  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2181  urease accessory protein UreG  69.54 
 
 
206 aa  263  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0338  urease accessory protein UreG  65.31 
 
 
206 aa  263  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0287  urease accessory protein UreG  64.8 
 
 
208 aa  263  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2263  urease accessory protein UreG  68.48 
 
 
213 aa  261  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.346179  normal  0.749182 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4832  urease accessory protein UreG  61.81 
 
 
212 aa  260  8e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7005  urease accessory protein UreG  67.93 
 
 
207 aa  260  8.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.896739 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2451  urease accessory protein UreG  65.13 
 
 
219 aa  259  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.296243  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0302  urease accessory protein G  63.18 
 
 
207 aa  258  4e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0992  urease accessory protein UreG  63.18 
 
 
207 aa  258  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0684  urease accessory protein UreG  61.54 
 
 
203 aa  256  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1946  urease accessory protein UreG  62.69 
 
 
207 aa  256  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00965207  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3468  urease accessory protein UreG  64.29 
 
 
203 aa  256  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0663  urease accessory protein  66.49 
 
 
219 aa  256  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>