283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_00470 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_00470  nickel incorporation protein  100 
 
 		 240 aa  491  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146336  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0345  cobalamin synthesis protein, P47K  65.78 
 
 		 232 aa  309  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0743251  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1989  cobalamin synthesis protein P47K  62.56 
 
 		 232 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3327  cobalamin synthesis protein, P47K  62.11 
 
 		 227 aa  304  8.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0445  cobalamin synthesis protein P47K  61.67 
 
 		 228 aa  301  5.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2266  hypothetical protein  58.26 
 
 		 230 aa  297  8e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0407392  normal  0.68566 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0476  hypothetical protein  56.49 
 
 		 238 aa  290  1e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1036  cobalamin synthesis protein P47K  58.85 
 
 		 227 aa  289  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2095  hypothetical protein  54.63 
 
 		 227 aa  286  2e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.142349  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1977  cobalamin synthesis protein P47K  57.46 
 
 		 231 aa  285  4e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856485  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4262  cobalamin synthesis protein P47K  57.08 
 
 		 232 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000645522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02420  nickel incorporation protein  58.87 
 
 		 234 aa  281  6.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183496  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1675  hypothetical protein  56.77 
 
 		 230 aa  281  7.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2370  cobalamin synthesis protein, P47K  55.51 
 
 		 234 aa  277  9e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2105  urease and hydrogenase maturation regulator/Ni2+-binding GTPase  57.71 
 
 		 228 aa  276  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2260  cobalamin synthesis protein P47K  49.17 
 
 		 259 aa  254  7e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1684  hypothetical protein  47.79 
 
 		 230 aa  244  6e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1283  cobalamin synthesis protein P47K  46.02 
 
 		 234 aa  219  3e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1401  cobalamin synthesis protein, P47K  45.09 
 
 		 232 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.265062  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1275  cobalamin synthesis protein P47K  44.64 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0682  cobalamin synthesis protein, P47K  46.7 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0681  cobalamin synthesis protein P47K  44.64 
 
 		 232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1456  cobalamin synthesis protein, P47K  43.81 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0687195  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0155  cobalamin synthesis protein P47K  42.11 
 
 		 236 aa  201  7e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2610  cobalamin synthesis protein P47K  41.59 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000165447  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0500  hypothetical protein  36.24 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0108  cobalamin synthesis protein, P47K  38.33 
 
 		 235 aa  155  8e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.83483  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2980  cobalamin synthesis protein, P47K  34.65 
 
 		 234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1067  cobalamin synthesis protein/P47K  37.72 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2737  cobalamin synthesis protein P47K  37 
 
 		 235 aa  142  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1793  cobalamin synthesis protein P47K  35.81 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2114  cobalamin synthesis protein, P47K  34.36 
 
 		 235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  32.24 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  30.57 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  29.83 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  30.51 
 
 		 293 aa  65.1  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0983  urease accessory protein UreG  29.89 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.942838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  27.96 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  33.33 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  30.6 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  30.6 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  29.55 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  33.79 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  30.77 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  30.56 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  33.33 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1938  hydrogenase accessory protein HypB  30.68 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  29.44 
 
 		 352 aa  62.4  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  29.48 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  28.98 
 
 		 284 aa  62  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  29.89 
 
 		 246 aa  62  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  29.89 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  29.35 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  30 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2717  urease accessory protein  28.8 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2357  hydrogenase accessory protein HypB  29.69 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0748  urease accessory protein UreG  31.72 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  32.2 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  28.98 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4513  hydrogenase accessory protein HypB  34.03 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  28.65 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4441  urease accessory protein UreG  31.76 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2829  hydrogenase accessory protein HypB  30 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  26.11 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  31.43 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  30.05 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3881  hydrogenase accessory protein HypB  30.56 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1424  urease accessory protein UreG  28.65 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2063  urease accessory protein UreG  28.06 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000301925  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0756  hydrogenase accessory protein HypB  28.02 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.901261  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3363  hydrogenase accessory protein HypB  26.97 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1169  hydrogenase accessory protein HypB  29.55 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2360  urease accessory protein  30.11 
 
 		 202 aa  57  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.695138 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  30.11 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1759  hydrogenase accessory protein HypB  32.54 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  27.84 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  29.51 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  27.84 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  29.05 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  27.84 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  27.84 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  28.33 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3165  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  27.84 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.591749 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0506  NI2+-binding GTPase protein HypB  26.29 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0475  hydrogenase accessory protein HypB  26.7 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  28.16 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  30.48 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0175  hydrogenase nickel incorporation protein  31.51 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  27.84 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3942  urease accessory protein UreG  29.95 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1556  urease accessory protein UreG  29.19 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02577  GTP hydrolase involved in nickel liganding into hydrogenases  27.84 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  27.84 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  29.1 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  27.84 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2852  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  27.84 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.484483 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  27.84 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3150  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  27.84 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  30.48 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  27.84 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>