214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0682 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0682  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 
232 aa  475  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1456  cobalamin synthesis protein, P47K  73.71 
 
 
232 aa  364  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0687195  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1401  cobalamin synthesis protein, P47K  62.93 
 
 
232 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.265062  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1275  cobalamin synthesis protein P47K  62.93 
 
 
232 aa  318  6e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1283  cobalamin synthesis protein P47K  60.68 
 
 
234 aa  317  9e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0155  cobalamin synthesis protein P47K  62.03 
 
 
236 aa  316  2e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0681  cobalamin synthesis protein P47K  61.64 
 
 
232 aa  315  3e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1977  cobalamin synthesis protein P47K  48.68 
 
 
231 aa  227  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856485  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1684  hypothetical protein  48.02 
 
 
230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0476  hypothetical protein  47.14 
 
 
238 aa  223  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1067  cobalamin synthesis protein/P47K  48.07 
 
 
233 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4262  cobalamin synthesis protein P47K  45.58 
 
 
232 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000645522  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1989  cobalamin synthesis protein P47K  47.35 
 
 
232 aa  217  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2095  hypothetical protein  46.7 
 
 
227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.142349  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00470  nickel incorporation protein  46.7 
 
 
240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146336  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1675  hypothetical protein  44.44 
 
 
230 aa  210  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0445  cobalamin synthesis protein P47K  44.25 
 
 
228 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1036  cobalamin synthesis protein P47K  46.02 
 
 
227 aa  208  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2370  cobalamin synthesis protein, P47K  46.29 
 
 
234 aa  208  7e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2105  urease and hydrogenase maturation regulator/Ni2+-binding GTPase  46.02 
 
 
228 aa  206  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3327  cobalamin synthesis protein, P47K  46.26 
 
 
227 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2266  hypothetical protein  45 
 
 
230 aa  203  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0407392  normal  0.68566 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0345  cobalamin synthesis protein, P47K  44.89 
 
 
232 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0743251  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02420  nickel incorporation protein  43.23 
 
 
234 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183496  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0108  cobalamin synthesis protein, P47K  44.3 
 
 
235 aa  192  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.83483  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2114  cobalamin synthesis protein, P47K  43.61 
 
 
235 aa  191  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2260  cobalamin synthesis protein P47K  43.36 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2737  cobalamin synthesis protein P47K  43.61 
 
 
235 aa  189  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2980  cobalamin synthesis protein, P47K  42.11 
 
 
234 aa  186  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0500  hypothetical protein  43.29 
 
 
236 aa  186  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2610  cobalamin synthesis protein P47K  39.82 
 
 
234 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000165447  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1793  cobalamin synthesis protein P47K  38.33 
 
 
235 aa  168  8e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  29.65 
 
 
281 aa  68.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  29.07 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  32.02 
 
 
231 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  29.65 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  29.07 
 
 
280 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  30.81 
 
 
227 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3363  hydrogenase accessory protein HypB  30.43 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  31.46 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  28.74 
 
 
246 aa  60.1  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  33.53 
 
 
269 aa  59.3  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  33.14 
 
 
276 aa  58.9  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  25.13 
 
 
278 aa  58.5  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  25.13 
 
 
247 aa  58.5  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1302  urease accessory protein UreG  30.14 
 
 
215 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1464  urease accessory protein UreG  30.14 
 
 
215 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  24.06 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1458  hydrogenase accessory protein HypB  30.73 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4413  urease accessory protein UreG  30.54 
 
 
208 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  25.13 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3904  hydrogenase accessory protein HypB  28.81 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2063  urease accessory protein UreG  29.08 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000301925  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1136  urease accessory protein UreG  29.47 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.755264  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1082  urease accessory protein UreG  29.47 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3559  urease accessory protein  29.47 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29571  normal  0.0153059 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  27.07 
 
 
250 aa  56.2  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2717  urease accessory protein  31.09 
 
 
209 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  29.69 
 
 
283 aa  55.8  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  32.56 
 
 
273 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  30.68 
 
 
326 aa  55.5  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  30.81 
 
 
253 aa  55.5  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  34.42 
 
 
296 aa  55.1  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0748  urease accessory protein UreG  31.38 
 
 
212 aa  55.1  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  31.98 
 
 
282 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  27.12 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5119  urease accessory protein UreG  30.53 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  27.33 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  31.61 
 
 
204 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3881  hydrogenase accessory protein HypB  25.81 
 
 
267 aa  53.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  29.71 
 
 
226 aa  53.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0802  hydrogenase accessory protein HypB  26.52 
 
 
279 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.287566  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0534  hydrogenase accessory protein HypB  27.89 
 
 
275 aa  53.1  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  26.74 
 
 
303 aa  52.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  26.52 
 
 
292 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1701  urease accessory protein UreG  31.58 
 
 
204 aa  52.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266659 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1563  hydrogenase accessory protein HypB  26.8 
 
 
224 aa  51.6  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0444465  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4441  urease accessory protein UreG  33.11 
 
 
214 aa  52  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  28.57 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1317  urease accessory protein UreG  28.36 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  26.06 
 
 
294 aa  51.2  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3942  urease accessory protein UreG  31.25 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  26.11 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  26.11 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  23.81 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  25.13 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1169  hydrogenase accessory protein HypB  27.17 
 
 
268 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  24.06 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  32 
 
 
322 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0469  hydrogenase accessory protein HypB  30.34 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.590808  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0884  urease accessory protein UreG  28.93 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1361  urease accessory protein UreG  27.86 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.346026  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0171  hydrogenase accessory protein HypB  26.16 
 
 
303 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.452603  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  25.26 
 
 
244 aa  50.1  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  26.92 
 
 
242 aa  50.1  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1684  urease accessory protein UreG  31.16 
 
 
206 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  28.49 
 
 
286 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2165  hydrogenase accessory protein HypB  27.49 
 
 
220 aa  49.7  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  26.86 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1765  hydrogenase accessory protein HypB  29.89 
 
 
264 aa  49.7  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.997182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>