More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0884 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0884  urease accessory protein UreG  100 
 
 
211 aa  421  1e-117  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0058  urease accessory protein UreG  49.03 
 
 
204 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.418935  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4636  urease accessory protein UreG  51.53 
 
 
200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000195315  normal  0.0674257 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1813  urease accessory protein UreG  51.9 
 
 
202 aa  194  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5119  urease accessory protein UreG  51.49 
 
 
215 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3468  urease accessory protein UreG  50.5 
 
 
203 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1082  urease accessory protein UreG  49.74 
 
 
220 aa  191  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3559  urease accessory protein  49.74 
 
 
220 aa  191  5e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29571  normal  0.0153059 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1136  urease accessory protein UreG  49.74 
 
 
220 aa  191  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.755264  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4160  urease accessory protein UreG  51.49 
 
 
211 aa  191  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4832  urease accessory protein UreG  52.6 
 
 
212 aa  191  7e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1684  urease accessory protein UreG  53.03 
 
 
206 aa  191  9e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1477  urease accessory protein UreG  49.27 
 
 
212 aa  190  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0957656  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08891  urease accessory protein UreG  48.53 
 
 
203 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1464  urease accessory protein UreG  50 
 
 
215 aa  188  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4032  urease accessory protein UreG  49.5 
 
 
207 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.199977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1302  urease accessory protein UreG  50 
 
 
215 aa  188  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2008  urease accessory protein UreG  50.73 
 
 
206 aa  188  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4248  urease accessory protein UreG  49.49 
 
 
216 aa  188  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1364  urease accessory protein UreG  50.25 
 
 
210 aa  187  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3046  urease accessory protein UreG  49.01 
 
 
203 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.317226  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4708  urease accessory protein UreG  50.5 
 
 
209 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2867  urease accessory protein UreG  50 
 
 
205 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.378326  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08871  urease accessory protein UreG  49 
 
 
203 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3659  urease accessory protein UreG  46.8 
 
 
205 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.319946  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2251  urease accessory protein UreG  48 
 
 
201 aa  186  3e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0830  urease accessory protein UreG  49 
 
 
203 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1179  urease accessory protein UreG  50.51 
 
 
213 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.585829  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2409  urease accessory protein UreG  48.77 
 
 
220 aa  185  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2377  urease accessory protein UreG  51.02 
 
 
203 aa  185  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.168299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0748  urease accessory protein UreG  47.6 
 
 
212 aa  185  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1317  urease accessory protein UreG  47.24 
 
 
212 aa  184  7e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3942  urease accessory protein UreG  49.75 
 
 
225 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  49.75 
 
 
204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3107  urease accessory protein UreG  49.75 
 
 
202 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1089  urease accessory protein UreG  50.5 
 
 
204 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1361  urease accessory protein UreG  46.73 
 
 
212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.346026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2117  urease accessory protein UreG  50 
 
 
204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1384  urease accessory protein UreG  49.5 
 
 
210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0224  urease accessory protein UreG  47.74 
 
 
207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3302  urease accessory protein UreG  48.51 
 
 
203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.200502 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1764  urease accessory protein UreG  48.5 
 
 
203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.861416  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2261  urease accessory protein UreG  47.52 
 
 
201 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587702  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0287  urease accessory protein UreG  47.78 
 
 
208 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0273  urease accessory protein UreG  47.29 
 
 
208 aa  181  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2196  urease accessory protein UreG  48.28 
 
 
220 aa  181  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358866  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4413  urease accessory protein UreG  50 
 
 
208 aa  181  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0664  urease accessory protein UreG  48.74 
 
 
204 aa  181  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.469815  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3238  urease accessory protein UreG  49.01 
 
 
204 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.522124 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3013  urease accessory protein UreG  49.01 
 
 
204 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311602  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1723  urease accessory protein UreG  48.08 
 
 
225 aa  181  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3202  urease accessory protein UreG  49.01 
 
 
204 aa  180  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0380  urease accessory protein UreG  47.72 
 
 
213 aa  180  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235072  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2687  urease accessory protein UreG  46.04 
 
 
207 aa  180  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64670  urease accessory protein UreG  49.25 
 
 
204 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00341231  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1030  urease accessory protein UreG  49.47 
 
 
202 aa  179  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.190155 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0684  urease accessory protein UreG  46.08 
 
 
203 aa  180  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03470  urease accessory protein UreG  49.73 
 
 
203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.546995  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2317  urease accessory protein UreG  46.73 
 
 
204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.301422  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2360  urease accessory protein UreG  46.73 
 
 
204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.553398  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0959  urease accessory protein UreG  47.55 
 
 
213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2621  urease accessory protein UreG  46.5 
 
 
201 aa  178  4e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131688  normal  0.804945 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0328  urease accessory protein  46.07 
 
 
204 aa  179  4e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1874  urease accessory protein UreG  43.84 
 
 
204 aa  178  4.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1424  urease accessory protein UreG  49.75 
 
 
201 aa  178  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0246  urease accessory protein UreG  48.97 
 
 
205 aa  178  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0561  urease accessory protein UreG  50.25 
 
 
204 aa  177  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562305  normal  0.940607 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0787  urease accessory protein UreG  48.24 
 
 
215 aa  177  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876633  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4441  urease accessory protein UreG  45.73 
 
 
214 aa  177  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19201  urease accessory protein UreG  46.57 
 
 
205 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4003  urease accessory protein UreG  48.24 
 
 
215 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1493  urease accessory protein UreG  48.74 
 
 
216 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.286659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2768  urease accessory protein UreG  44.93 
 
 
205 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0338  urease accessory protein UreG  47.06 
 
 
206 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2063  urease accessory protein UreG  49.22 
 
 
211 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000301925  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0187  urease accessory protein UreG  49.27 
 
 
211 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1701  urease accessory protein UreG  49.5 
 
 
204 aa  176  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2717  urease accessory protein  49.22 
 
 
209 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2493  urease accessory protein UreG  47.74 
 
 
215 aa  176  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0723  urease accessory protein UreG  46.31 
 
 
203 aa  176  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1244  urease accessory protein UreG  48.7 
 
 
213 aa  176  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29751  urease accessory protein UreG  46.27 
 
 
203 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0992  urease accessory protein UreG  47.55 
 
 
207 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3408  urease accessory protein UreG  48.77 
 
 
229 aa  176  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.835805  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0971  urease accessory protein UreG  48.77 
 
 
218 aa  176  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0776  urease accessory protein UreG  47.74 
 
 
215 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1205  urease accessory protein UreG  47.55 
 
 
211 aa  176  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0395  urease accessory protein UreG  46.27 
 
 
204 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0983  urease accessory protein UreG  47.24 
 
 
217 aa  176  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.942838  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0867  urease accessory protein UreG  47.74 
 
 
215 aa  175  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1049  urease accessory protein UreG  48.42 
 
 
205 aa  175  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.113322  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0418  urease accessory protein UreG  47.74 
 
 
215 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0897  urease accessory protein UreG  47.74 
 
 
215 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626533  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1347  urease accessory protein UreG  48.28 
 
 
218 aa  175  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2997  urease accessory protein UreG  45.5 
 
 
203 aa  174  8e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.787106 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0302  urease accessory protein G  46.57 
 
 
207 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1190  urease accessory protein UreG  45.73 
 
 
206 aa  174  9e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.257386  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09380  urease accessory protein UreG  47.24 
 
 
204 aa  174  9e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06560  Urease accessory protein ureG, putative  46.11 
 
 
315 aa  174  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2554  urease accessory protein UreG  48.24 
 
 
216 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>