197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1456 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1456  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 232 aa  473  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0687195  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0682  cobalamin synthesis protein, P47K  73.71 
 
 		 232 aa  364  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0681  cobalamin synthesis protein P47K  62.93 
 
 		 232 aa  320  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1275  cobalamin synthesis protein P47K  62.5 
 
 		 232 aa  318  5e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1401  cobalamin synthesis protein, P47K  62.5 
 
 		 232 aa  317  7.999999999999999e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.265062  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1283  cobalamin synthesis protein P47K  60.68 
 
 		 234 aa  313  9.999999999999999e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0155  cobalamin synthesis protein P47K  61.02 
 
 		 236 aa  308  5e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0476  hypothetical protein  50.44 
 
 		 238 aa  248  6e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1684  hypothetical protein  50 
 
 		 230 aa  244  9e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1977  cobalamin synthesis protein P47K  51.1 
 
 		 231 aa  241  5e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1036  cobalamin synthesis protein P47K  47.35 
 
 		 227 aa  229  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4262  cobalamin synthesis protein P47K  45.58 
 
 		 232 aa  228  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000645522  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1675  hypothetical protein  44.44 
 
 		 230 aa  222  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1067  cobalamin synthesis protein/P47K  48.5 
 
 		 233 aa  221  6e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2105  urease and hydrogenase maturation regulator/Ni2+-binding GTPase  46.9 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2095  hypothetical protein  45.33 
 
 		 227 aa  218  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.142349  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2370  cobalamin synthesis protein, P47K  46.15 
 
 		 234 aa  218  7e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0445  cobalamin synthesis protein P47K  44.25 
 
 		 228 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0345  cobalamin synthesis protein, P47K  45.3 
 
 		 232 aa  215  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0743251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3327  cobalamin synthesis protein, P47K  46.7 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1989  cobalamin synthesis protein P47K  45.13 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00470  nickel incorporation protein  43.81 
 
 		 240 aa  207  9e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146336  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2266  hypothetical protein  43.64 
 
 		 230 aa  201  9e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0407392  normal  0.68566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02420  nickel incorporation protein  42.22 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183496  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2260  cobalamin synthesis protein P47K  42.92 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0108  cobalamin synthesis protein, P47K  43.42 
 
 		 235 aa  190  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.83483  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0500  hypothetical protein  43.42 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2114  cobalamin synthesis protein, P47K  41.85 
 
 		 235 aa  187  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2737  cobalamin synthesis protein P47K  42.29 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2980  cobalamin synthesis protein, P47K  38.98 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2610  cobalamin synthesis protein P47K  39.38 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000165447  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1793  cobalamin synthesis protein P47K  37.29 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  29.07 
 
 		 284 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  28.49 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  27.72 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  28.4 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  31.4 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1458  hydrogenase accessory protein HypB  30.22 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  29.61 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0534  hydrogenase accessory protein HypB  30.05 
 
 		 275 aa  57  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3363  hydrogenase accessory protein HypB  26.88 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  29.12 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  27.59 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  28.49 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  30.56 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  28.57 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  31.77 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  30.41 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  30.41 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2717  urease accessory protein  28.87 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0664  urease accessory protein UreG  31.25 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.469815  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0469  hydrogenase accessory protein HypB  28.57 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.590808  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  29.07 
 
 		 280 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  28.74 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0721  hydrogenase accessory protein HypB  28.42 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  29.48 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  30.06 
 
 		 326 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  22.99 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1082  urease accessory protein UreG  28.95 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3559  urease accessory protein  28.95 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29571  normal  0.0153059 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1136  urease accessory protein UreG  28.95 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.755264  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  30.94 
 
 		 300 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2829  hydrogenase accessory protein HypB  29.26 
 
 		 216 aa  52  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  26.16 
 
 		 286 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1563  hydrogenase accessory protein HypB  26.06 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0444465  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2997  urease accessory protein UreG  30 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.787106 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3904  hydrogenase accessory protein HypB  26.84 
 
 		 284 aa  51.2  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  27.33 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2877  urease accessory protein UreG  28.65 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09380  urease accessory protein UreG  29.02 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64670  urease accessory protein UreG  30.73 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00341231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4413  urease accessory protein UreG  28.12 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  29.61 
 
 		 322 aa  50.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  25.54 
 
 		 352 aa  49.7  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2815  hydrogenase-3 accessory protein, assembly of metallocenter  27.27 
 
 		 345 aa  49.7  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  30.18 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1464  urease accessory protein UreG  28.57 
 
 		 215 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1302  urease accessory protein UreG  28.57 
 
 		 215 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  26.37 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3533  urease accessory protein UreG  28.43 
 
 		 229 aa  49.3  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.490615 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  30.18 
 
 		 269 aa  48.9  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796055  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00892  urease accessory protein UreG  29.47 
 
 		 203 aa  48.9  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870329  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3200  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  28.33 
 
 		 287 aa  48.9  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0438  hydrogenase accessory protein HypB  24.23 
 
 		 284 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4441  urease accessory protein UreG  30.41 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0171  hydrogenase accessory protein HypB  27.75 
 
 		 303 aa  48.5  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.452603  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0427  hydrogenase accessory protein HypB  24.23 
 
 		 284 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  29.59 
 
 		 273 aa  48.5  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4248  urease accessory protein UreG  27.08 
 
 		 216 aa  48.5  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1644  hydrogenase accessory protein HypB  30.59 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2165  hydrogenase accessory protein HypB  25.14 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2187  urease accessory protein UreG  29.73 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5119  urease accessory protein UreG  30.87 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4636  urease accessory protein UreG  30.37 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000195315  normal  0.0674257 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3138  urease accessory protein UreG  29.73 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1347  urease accessory protein UreG  30.2 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2018  hydrogenase accessory protein HypB  30.05 
 
 		 315 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3079  urease accessory protein UreG  29.73 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2060  urease accessory protein UreG  29.73 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  28.99 
 
 		 282 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>