101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2114 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2114  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 235 aa  476  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0108  cobalamin synthesis protein, P47K  73.19 
 
 		 235 aa  360  1e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.83483  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2737  cobalamin synthesis protein P47K  70.64 
 
 		 235 aa  341  5e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0500  hypothetical protein  70.21 
 
 		 236 aa  338  5e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1793  cobalamin synthesis protein P47K  72.34 
 
 		 235 aa  333  2e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2980  cobalamin synthesis protein, P47K  68.51 
 
 		 234 aa  323  1e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1067  cobalamin synthesis protein/P47K  56.78 
 
 		 233 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0682  cobalamin synthesis protein, P47K  43.61 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0681  cobalamin synthesis protein P47K  43.11 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1275  cobalamin synthesis protein P47K  42.67 
 
 		 232 aa  188  7e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1401  cobalamin synthesis protein, P47K  42.22 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.265062  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1456  cobalamin synthesis protein, P47K  41.85 
 
 		 232 aa  187  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0687195  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1283  cobalamin synthesis protein P47K  40.97 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0155  cobalamin synthesis protein P47K  38.86 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4262  cobalamin synthesis protein P47K  38.7 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000645522  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1675  hypothetical protein  40.99 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0476  hypothetical protein  37.45 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2105  urease and hydrogenase maturation regulator/Ni2+-binding GTPase  36.12 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0345  cobalamin synthesis protein, P47K  35.4 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0743251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3327  cobalamin synthesis protein, P47K  34.78 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1989  cobalamin synthesis protein P47K  34.8 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1977  cobalamin synthesis protein P47K  37.18 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856485  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1684  hypothetical protein  36.56 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2370  cobalamin synthesis protein, P47K  36.12 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0445  cobalamin synthesis protein P47K  35.53 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2095  hypothetical protein  36.48 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.142349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2266  hypothetical protein  36.16 
 
 		 230 aa  148  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0407392  normal  0.68566 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2260  cobalamin synthesis protein P47K  37.12 
 
 		 259 aa  148  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1036  cobalamin synthesis protein P47K  33.92 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02420  nickel incorporation protein  35.5 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183496  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00470  nickel incorporation protein  34.36 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146336  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2610  cobalamin synthesis protein P47K  31.53 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000165447  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  26.01 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  26.01 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3363  hydrogenase accessory protein HypB  25.97 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  24.72 
 
 		 303 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0469  hydrogenase accessory protein HypB  27.43 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.590808  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  28.4 
 
 		 231 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  26.01 
 
 		 284 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  25.71 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  25.43 
 
 		 281 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  25.6 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  24.44 
 
 		 271 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  21.31 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  26.11 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  26.01 
 
 		 290 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02577  GTP hydrolase involved in nickel liganding into hydrogenases  26.01 
 
 		 290 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  26.01 
 
 		 290 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  26.01 
 
 		 290 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  26.01 
 
 		 290 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2852  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  26.01 
 
 		 290 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.484483 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3150  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  26.01 
 
 		 290 aa  48.9  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  25.43 
 
 		 280 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  26.01 
 
 		 290 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  26.01 
 
 		 290 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3200  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  26.59 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  25.14 
 
 		 292 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  24.28 
 
 		 296 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  23.6 
 
 		 307 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  24.4 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1563  hydrogenase accessory protein HypB  21.59 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0444465  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  22.62 
 
 		 322 aa  46.2  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  21.71 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  23.81 
 
 		 282 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3165  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  26.59 
 
 		 290 aa  45.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.591749 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  26.59 
 
 		 290 aa  45.1  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1938  hydrogenase accessory protein HypB  23.08 
 
 		 283 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  24.4 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  22.53 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3904  hydrogenase accessory protein HypB  21.93 
 
 		 284 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  23.81 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  21.55 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  26.59 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  26.59 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  26.59 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1963  hydrogenase accessory protein HypB  35.06 
 
 		 328 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0298  hydrogenase accessory protein HypB  27.17 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  23.67 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  22.16 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  24.1 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  22.16 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3219  hydrogenase accessory protein HypB  22.91 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1285  hydrogenase accessory protein HypB  32.35 
 
 		 345 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.497783 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  22.03 
 
 		 326 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2132  hydrogenase accessory protein HypB  24.31 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1477  urease accessory protein UreG  27.59 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0957656  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2581  hydrogenase accessory protein HypB  24.4 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  20.99 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0721  hydrogenase accessory protein HypB  22.91 
 
 		 270 aa  42.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4608  hydrogenase accessory protein HypB  21.81 
 
 		 281 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0171  hydrogenase accessory protein HypB  21.98 
 
 		 303 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.452603  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  20.71 
 
 		 277 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2145  hydrogenase accessory protein HypB  23.2 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2191  hydrogenase accessory protein HypB  23.2 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23990  hydrogenase accessory protein HypB  26.92 
 
 		 230 aa  42.4  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1458  hydrogenase accessory protein HypB  22.49 
 
 		 268 aa  42  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1851  hydrogenase expression/formation protein  23.95 
 
 		 222 aa  42  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  25.55 
 
 		 268 aa  41.6  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  33.33 
 
 		 306 aa  41.6  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4832  urease accessory protein UreG  25.13 
 
 		 212 aa  41.6  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>