103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2980 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2980  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 
234 aa  477  1e-134  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0108  cobalamin synthesis protein, P47K  69.79 
 
 
235 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.83483  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2114  cobalamin synthesis protein, P47K  68.51 
 
 
235 aa  323  1e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0500  hypothetical protein  65.53 
 
 
236 aa  319  3e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2737  cobalamin synthesis protein P47K  65.96 
 
 
235 aa  308  2.9999999999999997e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1793  cobalamin synthesis protein P47K  65.96 
 
 
235 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1067  cobalamin synthesis protein/P47K  52.12 
 
 
233 aa  250  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1275  cobalamin synthesis protein P47K  43.81 
 
 
232 aa  190  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0681  cobalamin synthesis protein P47K  43.81 
 
 
232 aa  190  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1401  cobalamin synthesis protein, P47K  43.36 
 
 
232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.265062  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0682  cobalamin synthesis protein, P47K  42.11 
 
 
232 aa  186  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1283  cobalamin synthesis protein P47K  41.23 
 
 
234 aa  182  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1456  cobalamin synthesis protein, P47K  38.98 
 
 
232 aa  179  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0687195  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1675  hypothetical protein  39.92 
 
 
230 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0155  cobalamin synthesis protein P47K  40.26 
 
 
236 aa  176  3e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4262  cobalamin synthesis protein P47K  39.21 
 
 
232 aa  174  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000645522  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1977  cobalamin synthesis protein P47K  39.13 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856485  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2105  urease and hydrogenase maturation regulator/Ni2+-binding GTPase  38.43 
 
 
228 aa  170  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1989  cobalamin synthesis protein P47K  37.61 
 
 
232 aa  171  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0476  hypothetical protein  37.89 
 
 
238 aa  168  6e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0345  cobalamin synthesis protein, P47K  35.84 
 
 
232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0743251  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2370  cobalamin synthesis protein, P47K  37 
 
 
234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2095  hypothetical protein  39.04 
 
 
227 aa  164  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.142349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3327  cobalamin synthesis protein, P47K  35.68 
 
 
227 aa  164  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2260  cobalamin synthesis protein P47K  38.03 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0445  cobalamin synthesis protein P47K  35.37 
 
 
228 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2266  hypothetical protein  36.29 
 
 
230 aa  161  9e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0407392  normal  0.68566 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1684  hypothetical protein  36.56 
 
 
230 aa  159  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1036  cobalamin synthesis protein P47K  37.55 
 
 
227 aa  158  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00470  nickel incorporation protein  34.65 
 
 
240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146336  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02420  nickel incorporation protein  34.96 
 
 
234 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183496  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2610  cobalamin synthesis protein P47K  32.89 
 
 
234 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000165447  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  26.63 
 
 
296 aa  55.8  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  31.15 
 
 
204 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  23.5 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0664  urease accessory protein UreG  30.94 
 
 
204 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.469815  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  26.14 
 
 
227 aa  52  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  24.35 
 
 
235 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64670  urease accessory protein UreG  30.6 
 
 
204 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00341231  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3942  urease accessory protein UreG  33.51 
 
 
225 aa  52  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09380  urease accessory protein UreG  31.15 
 
 
204 aa  52  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  24.29 
 
 
252 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  26.61 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  25 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  24.86 
 
 
271 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  23.46 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  25.58 
 
 
281 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3363  hydrogenase accessory protein HypB  24.58 
 
 
220 aa  50.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  23.46 
 
 
246 aa  49.7  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  25.58 
 
 
280 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  25.58 
 
 
284 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1764  urease accessory protein UreG  29.83 
 
 
203 aa  48.9  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.861416  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4911  urease accessory protein UreG  31.72 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  22.86 
 
 
277 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1477  urease accessory protein UreG  28.89 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0957656  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6188  urease accessory protein UreG  28.21 
 
 
208 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226032  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3261  urease accessory protein UreG  28.65 
 
 
221 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3107  urease accessory protein UreG  30.77 
 
 
202 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  22.62 
 
 
278 aa  47.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  24.86 
 
 
234 aa  46.6  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  25.29 
 
 
306 aa  46.6  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4441  urease accessory protein UreG  26.63 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  22.99 
 
 
246 aa  47  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0983  urease accessory protein UreG  26.26 
 
 
217 aa  46.2  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.942838  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0175  hydrogenase nickel incorporation protein  25.18 
 
 
279 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  25 
 
 
231 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3080  urease accessory protein UreG  26.79 
 
 
226 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0322849  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00350  hydrogenase accessory protein HypB  24.74 
 
 
248 aa  45.4  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  24.71 
 
 
269 aa  45.1  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796055  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4453  urease accessory protein UreG  30.65 
 
 
205 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  26.12 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1556  urease accessory protein UreG  28.34 
 
 
206 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0756  hydrogenase accessory protein HypB  23.3 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.901261  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06560  Urease accessory protein ureG, putative  30.54 
 
 
315 aa  43.9  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0187  urease accessory protein UreG  27.57 
 
 
211 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1963  urease accessory protein UreG  27.32 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  23.84 
 
 
269 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00892  urease accessory protein UreG  24.86 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870329  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  23.56 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2008  urease accessory protein UreG  28.16 
 
 
206 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  23.56 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  23.7 
 
 
253 aa  43.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1082  urease accessory protein UreG  26.56 
 
 
220 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1563  hydrogenase accessory protein HypB  23.5 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0444465  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3559  urease accessory protein  26.56 
 
 
220 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29571  normal  0.0153059 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1136  urease accessory protein UreG  26.56 
 
 
220 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.755264  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  22.86 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0475  hydrogenase accessory protein HypB  22.53 
 
 
288 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2753  urease accessory protein UreG  25.9 
 
 
228 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0806758  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3881  hydrogenase accessory protein HypB  23.12 
 
 
242 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.785177 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0193  urease accessory protein UreG  27.98 
 
 
225 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1169  hydrogenase accessory protein HypB  23.86 
 
 
268 aa  42.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1430  hydrogenase accessory protein HypB  23.17 
 
 
266 aa  42.7  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1205  urease accessory protein UreG  28.57 
 
 
211 aa  42.7  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4213  urease accessory protein UreG  28.19 
 
 
212 aa  42.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0469  hydrogenase accessory protein HypB  24.43 
 
 
230 aa  42.4  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.590808  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1424  urease accessory protein UreG  26.98 
 
 
201 aa  42.4  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  25.13 
 
 
276 aa  42  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  22.91 
 
 
286 aa  42  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1938  hydrogenase accessory protein HypB  25 
 
 
283 aa  42  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1209  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>