More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4213 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4213  urease accessory protein UreG  100 
 
 
212 aa  428  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1424  urease accessory protein UreG  64.47 
 
 
201 aa  264  7e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2877  urease accessory protein UreG  65.5 
 
 
203 aa  261  6e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1813  urease accessory protein UreG  60.51 
 
 
202 aa  255  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2768  urease accessory protein UreG  62.24 
 
 
205 aa  255  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1764  urease accessory protein UreG  64.1 
 
 
203 aa  254  5e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.861416  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3942  urease accessory protein UreG  63.68 
 
 
225 aa  254  6e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0664  urease accessory protein UreG  64.58 
 
 
204 aa  254  7e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.469815  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64670  urease accessory protein UreG  63 
 
 
204 aa  254  8e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00341231  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  63 
 
 
204 aa  252  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4832  urease accessory protein UreG  57.07 
 
 
212 aa  251  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1477  urease accessory protein UreG  57.07 
 
 
212 aa  251  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0957656  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0983  urease accessory protein UreG  61.54 
 
 
217 aa  251  7e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.942838  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4636  urease accessory protein UreG  64.58 
 
 
200 aa  250  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000195315  normal  0.0674257 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09380  urease accessory protein UreG  63.54 
 
 
204 aa  250  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0224  urease accessory protein UreG  60.3 
 
 
207 aa  248  7e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4708  urease accessory protein UreG  62.5 
 
 
209 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3046  urease accessory protein UreG  60.61 
 
 
203 aa  248  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.317226  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2261  urease accessory protein UreG  65.08 
 
 
201 aa  247  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587702  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1244  urease accessory protein UreG  61.03 
 
 
213 aa  247  1e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2008  urease accessory protein UreG  61.46 
 
 
206 aa  246  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2377  urease accessory protein UreG  62.96 
 
 
203 aa  246  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.168299 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00892  urease accessory protein UreG  59 
 
 
203 aa  245  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870329  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1384  urease accessory protein UreG  60.91 
 
 
210 aa  245  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2997  urease accessory protein UreG  62.5 
 
 
203 aa  245  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.787106 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2451  urease accessory protein UreG  61.22 
 
 
219 aa  244  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.296243  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3302  urease accessory protein UreG  60.1 
 
 
203 aa  244  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.200502 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3350  urease accessory protein UreG  62.94 
 
 
226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.632937  normal  0.806624 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2621  urease accessory protein UreG  63.21 
 
 
201 aa  243  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131688  normal  0.804945 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03470  urease accessory protein UreG  58.97 
 
 
203 aa  243  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.546995  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4032  urease accessory protein UreG  62.11 
 
 
207 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.199977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3080  urease accessory protein UreG  62.44 
 
 
226 aa  242  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0322849  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0187  urease accessory protein UreG  61.81 
 
 
211 aa  242  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2251  urease accessory protein UreG  63.73 
 
 
201 aa  241  3.9999999999999997e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0959  urease accessory protein UreG  59.02 
 
 
213 aa  241  3.9999999999999997e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29751  urease accessory protein UreG  62.69 
 
 
203 aa  241  7e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1701  urease accessory protein UreG  66.49 
 
 
204 aa  241  7e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2830  urease accessory protein UreG  61.66 
 
 
230 aa  240  9e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2803  urease accessory protein UreG  61.66 
 
 
230 aa  240  9e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2847  urease accessory protein UreG  61.66 
 
 
230 aa  240  9e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2187  urease accessory protein UreG  58.91 
 
 
216 aa  238  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3079  urease accessory protein UreG  58.91 
 
 
216 aa  238  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3115  urease accessory protein UreG  58.91 
 
 
216 aa  238  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0720  urease accessory protein UreG  58.91 
 
 
216 aa  238  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2554  urease accessory protein UreG  58.91 
 
 
216 aa  238  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2060  urease accessory protein UreG  58.91 
 
 
216 aa  238  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2687  urease accessory protein UreG  60.21 
 
 
207 aa  238  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1493  urease accessory protein UreG  57.56 
 
 
216 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.286659  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1364  urease accessory protein UreG  59.39 
 
 
210 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3107  urease accessory protein UreG  62.05 
 
 
202 aa  236  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3138  urease accessory protein UreG  58.42 
 
 
216 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11880  urease accessory protein ureG  61.66 
 
 
224 aa  236  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.405112 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0561  urease accessory protein UreG  63.08 
 
 
204 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562305  normal  0.940607 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0684  urease accessory protein UreG  56.48 
 
 
203 aa  234  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0246  urease accessory protein UreG  57.5 
 
 
205 aa  234  6e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2867  urease accessory protein UreG  59.39 
 
 
205 aa  234  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.378326  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0787  urease accessory protein UreG  56.44 
 
 
215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876633  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0867  urease accessory protein UreG  56.59 
 
 
215 aa  232  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2117  urease accessory protein UreG  61.14 
 
 
204 aa  232  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4003  urease accessory protein UreG  56.44 
 
 
215 aa  232  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2360  urease accessory protein UreG  55.9 
 
 
204 aa  232  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.553398  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2317  urease accessory protein UreG  55.9 
 
 
204 aa  232  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.301422  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3202  urease accessory protein UreG  60.32 
 
 
204 aa  232  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0418  urease accessory protein UreG  56.59 
 
 
215 aa  232  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0776  urease accessory protein UreG  56.44 
 
 
215 aa  232  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0897  urease accessory protein UreG  56.59 
 
 
215 aa  232  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626533  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3468  urease accessory protein UreG  60 
 
 
203 aa  231  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0395  urease accessory protein UreG  57.44 
 
 
204 aa  231  6e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1263  urease accessory protein  56.25 
 
 
244 aa  231  7.000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2493  urease accessory protein UreG  55.12 
 
 
215 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0302  urease accessory protein G  59.38 
 
 
207 aa  230  9e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4911  urease accessory protein UreG  60.8 
 
 
205 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2360  urease accessory protein  58.33 
 
 
202 aa  230  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.695138 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3013  urease accessory protein UreG  61.08 
 
 
204 aa  229  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311602  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1946  urease accessory protein UreG  59.38 
 
 
207 aa  229  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00965207  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3238  urease accessory protein UreG  61.08 
 
 
204 aa  229  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.522124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1089  urease accessory protein UreG  60.1 
 
 
204 aa  229  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0380  urease accessory protein UreG  57.58 
 
 
213 aa  229  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235072  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06560  Urease accessory protein ureG, putative  59.28 
 
 
315 aa  229  3e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4453  urease accessory protein UreG  60.8 
 
 
205 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1190  urease accessory protein UreG  54.9 
 
 
206 aa  229  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.257386  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4160  urease accessory protein UreG  56.78 
 
 
211 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2663  urease accessory protein UreG  60.2 
 
 
249 aa  229  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.093444 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0723  urease accessory protein UreG  56.92 
 
 
203 aa  229  3e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19201  urease accessory protein UreG  57.36 
 
 
205 aa  228  4e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3261  urease accessory protein UreG  57.81 
 
 
221 aa  228  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0992  urease accessory protein UreG  58.33 
 
 
207 aa  228  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1723  urease accessory protein UreG  56.52 
 
 
225 aa  228  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1874  urease accessory protein UreG  54.87 
 
 
204 aa  226  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2029  urease accessory protein  59.81 
 
 
210 aa  227  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.133283 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3659  urease accessory protein UreG  53.33 
 
 
205 aa  226  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.319946  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1049  urease accessory protein UreG  57.51 
 
 
205 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.113322  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0474  urease accessory protein UreG  55.72 
 
 
206 aa  226  2e-58  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4248  urease accessory protein UreG  55.05 
 
 
216 aa  224  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3533  urease accessory protein UreG  55.28 
 
 
229 aa  224  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.490615 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3408  urease accessory protein UreG  56.63 
 
 
229 aa  224  8e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.835805  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2753  urease accessory protein UreG  61.38 
 
 
228 aa  224  8e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0806758  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0273  urease accessory protein UreG  56.63 
 
 
208 aa  223  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0287  urease accessory protein UreG  56.12 
 
 
208 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08891  urease accessory protein UreG  55.44 
 
 
203 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>