More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2663 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2663  urease accessory protein UreG  100 
 
 		 249 aa  492  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5701  urease accessory protein UreG  82.7 
 
 		 245 aa  297  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0552283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2830  urease accessory protein UreG  77.16 
 
 		 230 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2803  urease accessory protein UreG  77.16 
 
 		 230 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2847  urease accessory protein UreG  77.16 
 
 		 230 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6443  urease accessory protein UreG  72.25 
 
 		 226 aa  285  7e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187428  normal  0.14632 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11880  urease accessory protein ureG  74.75 
 
 		 224 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.405112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3350  urease accessory protein UreG  76.68 
 
 		 226 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.632937  normal  0.806624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3206  urease accessory protein UreG  74.04 
 
 		 220 aa  280  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00429017  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3080  urease accessory protein UreG  74.11 
 
 		 226 aa  279  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0322849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2753  urease accessory protein UreG  73.13 
 
 		 228 aa  276  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0806758  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0504  urease accessory protein UreG  69.91 
 
 		 237 aa  271  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3506  urease accessory protein UreG  69.19 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0193  urease accessory protein UreG  73.06 
 
 		 225 aa  255  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0274  urease accessory protein UreG  63.41 
 
 		 240 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3407  urease accessory protein UreG  64.58 
 
 		 250 aa  244  8e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.893548  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0695  urease accessory protein UreG  63.82 
 
 		 279 aa  242  5e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00707405  hitchhiker  0.0000000649369 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2251  urease accessory protein UreG  65.8 
 
 		 201 aa  239  4e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2621  urease accessory protein UreG  64.25 
 
 		 201 aa  238  5.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131688  normal  0.804945 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29751  urease accessory protein UreG  63.73 
 
 		 203 aa  238  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4636  urease accessory protein UreG  62.3 
 
 		 200 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000195315  normal  0.0674257 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1764  urease accessory protein UreG  59.9 
 
 		 203 aa  232  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.861416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03270  urease accessory protein UreG  62.69 
 
 		 249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2261  urease accessory protein UreG  60.62 
 
 		 201 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1813  urease accessory protein UreG  58.03 
 
 		 202 aa  229  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4213  urease accessory protein UreG  60.2 
 
 		 212 aa  229  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09380  urease accessory protein UreG  60.42 
 
 		 204 aa  228  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1424  urease accessory protein UreG  57.95 
 
 		 201 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2451  urease accessory protein UreG  60.8 
 
 		 219 aa  227  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.296243  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0959  urease accessory protein UreG  63.48 
 
 		 213 aa  226  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0664  urease accessory protein UreG  58.85 
 
 		 204 aa  226  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.469815  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0224  urease accessory protein UreG  57.22 
 
 		 207 aa  225  5.0000000000000005e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2008  urease accessory protein UreG  58.33 
 
 		 206 aa  225  6e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2768  urease accessory protein UreG  56.48 
 
 		 205 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0983  urease accessory protein UreG  56.08 
 
 		 217 aa  224  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.942838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1701  urease accessory protein UreG  59.26 
 
 		 204 aa  224  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266659 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3942  urease accessory protein UreG  58.37 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4832  urease accessory protein UreG  57.37 
 
 		 212 aa  223  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64670  urease accessory protein UreG  58.85 
 
 		 204 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00341231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3107  urease accessory protein UreG  60.94 
 
 		 202 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0723  urease accessory protein UreG  53.89 
 
 		 203 aa  221  6e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  58.33 
 
 		 204 aa  221  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2877  urease accessory protein UreG  57.29 
 
 		 203 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00232  urease accessory protein UreG, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12900)  53.6 
 
 		 266 aa  219  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.391279 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4160  urease accessory protein UreG  62.5 
 
 		 211 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06560  Urease accessory protein ureG, putative  59.78 
 
 		 315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0787  urease accessory protein UreG  57.81 
 
 		 215 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1089  urease accessory protein UreG  59.79 
 
 		 204 aa  218  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4003  urease accessory protein UreG  57.81 
 
 		 215 aa  218  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1244  urease accessory protein UreG  56.77 
 
 		 213 aa  218  7e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0867  urease accessory protein UreG  58.33 
 
 		 215 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0776  urease accessory protein UreG  57.81 
 
 		 215 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2493  urease accessory protein UreG  57.29 
 
 		 215 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0418  urease accessory protein UreG  58.33 
 
 		 215 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0897  urease accessory protein UreG  58.33 
 
 		 215 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626533  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0830  urease accessory protein UreG  54.4 
 
 		 203 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1493  urease accessory protein UreG  57.81 
 
 		 216 aa  217  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.286659  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2997  urease accessory protein UreG  56.77 
 
 		 203 aa  217  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.787106 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00892  urease accessory protein UreG  55.21 
 
 		 203 aa  216  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870329  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08891  urease accessory protein UreG  53.89 
 
 		 203 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2117  urease accessory protein UreG  63.07 
 
 		 204 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1477  urease accessory protein UreG  56.84 
 
 		 212 aa  216  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0957656  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3013  urease accessory protein UreG  59.26 
 
 		 204 aa  215  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3238  urease accessory protein UreG  59.26 
 
 		 204 aa  215  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.522124 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0684  urease accessory protein UreG  55.67 
 
 		 203 aa  215  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08871  urease accessory protein UreG  53.89 
 
 		 203 aa  215  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3202  urease accessory protein UreG  58.73 
 
 		 204 aa  214  9e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0187  urease accessory protein UreG  59.16 
 
 		 211 aa  214  9e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2409  urease accessory protein UreG  58.43 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2867  urease accessory protein UreG  59.89 
 
 		 205 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.378326  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19201  urease accessory protein UreG  60 
 
 		 205 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4032  urease accessory protein UreG  57.29 
 
 		 207 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.199977 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1049  urease accessory protein UreG  60 
 
 		 205 aa  212  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.113322  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1190  urease accessory protein UreG  53.12 
 
 		 206 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.257386  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3046  urease accessory protein UreG  55.73 
 
 		 203 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.317226  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2187  urease accessory protein UreG  56.77 
 
 		 216 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3115  urease accessory protein UreG  56.77 
 
 		 216 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3079  urease accessory protein UreG  56.77 
 
 		 216 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2060  urease accessory protein UreG  56.77 
 
 		 216 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0720  urease accessory protein UreG  56.77 
 
 		 216 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2554  urease accessory protein UreG  56.77 
 
 		 216 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7567  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3302  urease accessory protein UreG  55.73 
 
 		 203 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200502 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2196  urease accessory protein UreG  56.35 
 
 		 220 aa  211  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4708  urease accessory protein UreG  55.28 
 
 		 209 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3659  urease accessory protein UreG  50.78 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.319946  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3138  urease accessory protein UreG  56.25 
 
 		 216 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4248  urease accessory protein UreG  54.69 
 
 		 216 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1364  urease accessory protein UreG  55.21 
 
 		 210 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2377  urease accessory protein UreG  56.61 
 
 		 203 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.168299 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2360  urease accessory protein  55.73 
 
 		 202 aa  208  8e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.695138 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1384  urease accessory protein UreG  55.21 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3261  urease accessory protein UreG  53.47 
 
 		 221 aa  207  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0395  urease accessory protein UreG  51.53 
 
 		 204 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0971  urease accessory protein UreG  53.06 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1723  urease accessory protein UreG  52.17 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2317  urease accessory protein UreG  51.58 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.301422  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1317  urease accessory protein UreG  55.78 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2360  urease accessory protein UreG  51.58 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.553398  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03470  urease accessory protein UreG  53.44 
 
 		 203 aa  206  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.546995  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1263  urease accessory protein  55.68 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>