252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6443 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6443  urease accessory protein UreG  100 
 
 
226 aa  447  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187428  normal  0.14632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2663  urease accessory protein UreG  72.25 
 
 
249 aa  285  5e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.093444 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2753  urease accessory protein UreG  68.97 
 
 
228 aa  266  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0806758  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2803  urease accessory protein UreG  69.5 
 
 
230 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2830  urease accessory protein UreG  69.5 
 
 
230 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2847  urease accessory protein UreG  69.5 
 
 
230 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11880  urease accessory protein ureG  67.8 
 
 
224 aa  262  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.405112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3080  urease accessory protein UreG  69.35 
 
 
226 aa  261  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0322849  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3350  urease accessory protein UreG  70.77 
 
 
226 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.632937  normal  0.806624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3206  urease accessory protein UreG  70.44 
 
 
220 aa  259  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00429017  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0504  urease accessory protein UreG  68.56 
 
 
237 aa  251  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0193  urease accessory protein UreG  68.12 
 
 
225 aa  249  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3506  urease accessory protein UreG  64.76 
 
 
239 aa  249  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138901  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09380  urease accessory protein UreG  70 
 
 
204 aa  243  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64670  urease accessory protein UreG  71.1 
 
 
204 aa  242  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00341231  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0664  urease accessory protein UreG  70 
 
 
204 aa  240  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.469815  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1764  urease accessory protein UreG  63.08 
 
 
203 aa  239  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.861416  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4636  urease accessory protein UreG  61.5 
 
 
200 aa  238  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000195315  normal  0.0674257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  62.63 
 
 
204 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5701  urease accessory protein UreG  69.73 
 
 
245 aa  238  8e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0552283  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3942  urease accessory protein UreG  70.76 
 
 
225 aa  237  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2261  urease accessory protein UreG  62.05 
 
 
201 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587702  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0224  urease accessory protein UreG  61.86 
 
 
207 aa  236  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2008  urease accessory protein UreG  56.74 
 
 
206 aa  236  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29751  urease accessory protein UreG  67.39 
 
 
203 aa  235  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2877  urease accessory protein UreG  63.78 
 
 
203 aa  231  5e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3013  urease accessory protein UreG  64.36 
 
 
204 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311602  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3238  urease accessory protein UreG  64.36 
 
 
204 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.522124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4003  urease accessory protein UreG  61.54 
 
 
215 aa  230  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2867  urease accessory protein UreG  64.52 
 
 
205 aa  230  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.378326  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3107  urease accessory protein UreG  67.03 
 
 
202 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3202  urease accessory protein UreG  62 
 
 
204 aa  229  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0983  urease accessory protein UreG  58.46 
 
 
217 aa  229  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.942838  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2493  urease accessory protein UreG  61.03 
 
 
215 aa  229  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0787  urease accessory protein UreG  61.03 
 
 
215 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876633  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1701  urease accessory protein UreG  61.73 
 
 
204 aa  229  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1089  urease accessory protein UreG  61.73 
 
 
204 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0776  urease accessory protein UreG  61.03 
 
 
215 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4160  urease accessory protein UreG  61.58 
 
 
211 aa  228  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2621  urease accessory protein UreG  65.93 
 
 
201 aa  228  6e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131688  normal  0.804945 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0187  urease accessory protein UreG  64.67 
 
 
211 aa  228  6e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0418  urease accessory protein UreG  61.03 
 
 
215 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0867  urease accessory protein UreG  61.03 
 
 
215 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0897  urease accessory protein UreG  61.03 
 
 
215 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626533  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1190  urease accessory protein UreG  61.2 
 
 
206 aa  227  9e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.257386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1493  urease accessory protein UreG  61.03 
 
 
216 aa  227  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.286659  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00232  urease accessory protein UreG, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12900)  63.93 
 
 
266 aa  226  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.391279 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1813  urease accessory protein UreG  58.25 
 
 
202 aa  226  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1424  urease accessory protein UreG  64.29 
 
 
201 aa  226  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2117  urease accessory protein UreG  64.13 
 
 
204 aa  226  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2451  urease accessory protein UreG  60.59 
 
 
219 aa  226  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.296243  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0959  urease accessory protein UreG  62.5 
 
 
213 aa  225  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1244  urease accessory protein UreG  61.5 
 
 
213 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2377  urease accessory protein UreG  62.5 
 
 
203 aa  224  7e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.168299 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4032  urease accessory protein UreG  63.59 
 
 
207 aa  224  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.199977 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1364  urease accessory protein UreG  61.96 
 
 
210 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2251  urease accessory protein UreG  65.93 
 
 
201 aa  223  1e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00892  urease accessory protein UreG  58.25 
 
 
203 aa  223  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870329  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2997  urease accessory protein UreG  58.76 
 
 
203 aa  223  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.787106 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0971  urease accessory protein UreG  57.95 
 
 
218 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3115  urease accessory protein UreG  58.45 
 
 
216 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2187  urease accessory protein UreG  58.45 
 
 
216 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3138  urease accessory protein UreG  58.45 
 
 
216 aa  222  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2554  urease accessory protein UreG  58.45 
 
 
216 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2060  urease accessory protein UreG  58.45 
 
 
216 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3079  urease accessory protein UreG  58.45 
 
 
216 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0720  urease accessory protein UreG  58.45 
 
 
216 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4248  urease accessory protein UreG  57.95 
 
 
216 aa  222  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4708  urease accessory protein UreG  61.96 
 
 
209 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3302  urease accessory protein UreG  61.41 
 
 
203 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.200502 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3468  urease accessory protein UreG  59.18 
 
 
203 aa  221  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3261  urease accessory protein UreG  60.33 
 
 
221 aa  222  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4832  urease accessory protein UreG  59.78 
 
 
212 aa  222  4.9999999999999996e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1723  urease accessory protein UreG  57.58 
 
 
225 aa  221  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1263  urease accessory protein  62.28 
 
 
244 aa  221  8e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3533  urease accessory protein UreG  60.66 
 
 
229 aa  221  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.490615 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0338  urease accessory protein UreG  62.21 
 
 
206 aa  220  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0273  urease accessory protein UreG  62.21 
 
 
208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2687  urease accessory protein UreG  57.58 
 
 
207 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3046  urease accessory protein UreG  60.87 
 
 
203 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.317226  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0287  urease accessory protein UreG  61.63 
 
 
208 aa  219  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1179  urease accessory protein UreG  60 
 
 
213 aa  219  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.585829  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1384  urease accessory protein UreG  60.87 
 
 
210 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0380  urease accessory protein UreG  61.76 
 
 
213 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235072  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4453  urease accessory protein UreG  67.78 
 
 
205 aa  218  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0561  urease accessory protein UreG  70.41 
 
 
204 aa  218  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562305  normal  0.940607 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1477  urease accessory protein UreG  54.46 
 
 
212 aa  218  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0957656  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0684  urease accessory protein UreG  55.38 
 
 
203 aa  218  7e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03270  urease accessory protein UreG  55.87 
 
 
249 aa  218  7e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3659  urease accessory protein UreG  54.36 
 
 
205 aa  217  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.319946  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1347  urease accessory protein UreG  57.44 
 
 
218 aa  217  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0830  urease accessory protein UreG  61.08 
 
 
203 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4911  urease accessory protein UreG  66.11 
 
 
205 aa  215  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3408  urease accessory protein UreG  53.55 
 
 
229 aa  215  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.835805  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0695  urease accessory protein UreG  66.47 
 
 
279 aa  215  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00707405  hitchhiker  0.0000000649369 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1049  urease accessory protein UreG  63.31 
 
 
205 aa  215  5e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.113322  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08891  urease accessory protein UreG  52.22 
 
 
203 aa  215  5e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4213  urease accessory protein UreG  60.1 
 
 
212 aa  214  5.9999999999999996e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2768  urease accessory protein UreG  54.87 
 
 
205 aa  214  8e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2931  urease accessory protein UreG  64.48 
 
 
207 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.193752  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>