More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0380 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0380  urease accessory protein UreG  100 
 
 		 213 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1089  urease accessory protein UreG  68.14 
 
 		 204 aa  288  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3046  urease accessory protein UreG  65.33 
 
 		 203 aa  286  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.317226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2117  urease accessory protein UreG  68.14 
 
 		 204 aa  286  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3013  urease accessory protein UreG  68.84 
 
 		 204 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3238  urease accessory protein UreG  68.84 
 
 		 204 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.522124 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2867  urease accessory protein UreG  67.33 
 
 		 205 aa  284  5.999999999999999e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.378326  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2377  urease accessory protein UreG  64.68 
 
 		 203 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.168299 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3302  urease accessory protein UreG  64.82 
 
 		 203 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200502 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1813  urease accessory protein UreG  67.89 
 
 		 202 aa  282  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3202  urease accessory protein UreG  67.84 
 
 		 204 aa  281  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0273  urease accessory protein UreG  66.01 
 
 		 208 aa  280  8.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0338  urease accessory protein UreG  65.2 
 
 		 206 aa  280  9e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0287  urease accessory protein UreG  65.52 
 
 		 208 aa  280  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0187  urease accessory protein UreG  68.53 
 
 		 211 aa  280  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2877  urease accessory protein UreG  68.62 
 
 		 203 aa  280  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1384  urease accessory protein UreG  65.53 
 
 		 210 aa  277  7e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4032  urease accessory protein UreG  65.52 
 
 		 207 aa  277  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.199977 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4832  urease accessory protein UreG  67.91 
 
 		 212 aa  276  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3468  urease accessory protein UreG  64.82 
 
 		 203 aa  276  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3261  urease accessory protein UreG  64.88 
 
 		 221 aa  275  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4708  urease accessory protein UreG  65.83 
 
 		 209 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1205  urease accessory protein UreG  66.83 
 
 		 211 aa  274  6e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1477  urease accessory protein UreG  68.45 
 
 		 212 aa  273  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0957656  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4160  urease accessory protein UreG  62.09 
 
 		 211 aa  270  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2687  urease accessory protein UreG  62.19 
 
 		 207 aa  270  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64670  urease accessory protein UreG  64.65 
 
 		 204 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00341231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0983  urease accessory protein UreG  63.96 
 
 		 217 aa  268  4e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.942838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3107  urease accessory protein UreG  66.84 
 
 		 202 aa  268  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1756  urease accessory protein UreG  63.32 
 
 		 203 aa  268  5e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0086861  normal  0.860103 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1701  urease accessory protein UreG  63.55 
 
 		 204 aa  268  5.9999999999999995e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1364  urease accessory protein UreG  63.41 
 
 		 210 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0224  urease accessory protein UreG  64.47 
 
 		 207 aa  267  7e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2360  urease accessory protein  64.32 
 
 		 202 aa  267  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.695138 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0992  urease accessory protein UreG  65.33 
 
 		 207 aa  266  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09380  urease accessory protein UreG  65.96 
 
 		 204 aa  266  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4636  urease accessory protein UreG  63.16 
 
 		 200 aa  266  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000195315  normal  0.0674257 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1244  urease accessory protein UreG  64.14 
 
 		 213 aa  266  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1764  urease accessory protein UreG  66.49 
 
 		 203 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.861416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0664  urease accessory protein UreG  63.87 
 
 		 204 aa  265  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.469815  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  62.69 
 
 		 204 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0684  urease accessory protein UreG  60.73 
 
 		 203 aa  263  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2768  urease accessory protein UreG  64.43 
 
 		 205 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2997  urease accessory protein UreG  63.64 
 
 		 203 aa  262  3e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.787106 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1946  urease accessory protein UreG  63.82 
 
 		 207 aa  262  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00965207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3942  urease accessory protein UreG  64.8 
 
 		 225 aa  261  4.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2261  urease accessory protein UreG  62.56 
 
 		 201 aa  261  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0302  urease accessory protein G  63.32 
 
 		 207 aa  259  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2008  urease accessory protein UreG  62.81 
 
 		 206 aa  259  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1190  urease accessory protein UreG  62.24 
 
 		 206 aa  258  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.257386  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0959  urease accessory protein UreG  62.77 
 
 		 213 aa  259  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00892  urease accessory protein UreG  61.58 
 
 		 203 aa  257  9e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870329  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0885  urease accessory protein UreG  65.38 
 
 		 212 aa  256  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3533  urease accessory protein UreG  59.33 
 
 		 229 aa  255  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.490615 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4003  urease accessory protein UreG  61.5 
 
 		 215 aa  254  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1179  urease accessory protein UreG  61.54 
 
 		 213 aa  254  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.585829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1424  urease accessory protein UreG  63.4 
 
 		 201 aa  254  8e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2493  urease accessory protein UreG  63.87 
 
 		 215 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2990  urease accessory protein UreG  64.84 
 
 		 212 aa  253  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.386954  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0395  urease accessory protein UreG  60.73 
 
 		 204 aa  252  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2621  urease accessory protein UreG  63.16 
 
 		 201 aa  253  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131688  normal  0.804945 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0246  urease accessory protein UreG  60.73 
 
 		 205 aa  252  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29751  urease accessory protein UreG  62.3 
 
 		 203 aa  252  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0787  urease accessory protein UreG  63.35 
 
 		 215 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2360  urease accessory protein UreG  59.69 
 
 		 204 aa  251  6e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.553398  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2317  urease accessory protein UreG  59.69 
 
 		 204 aa  251  6e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.301422  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1030  urease accessory protein UreG  65.48 
 
 		 202 aa  251  6e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190155 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0867  urease accessory protein UreG  62.83 
 
 		 215 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0418  urease accessory protein UreG  62.83 
 
 		 215 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0776  urease accessory protein UreG  62.83 
 
 		 215 aa  250  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0897  urease accessory protein UreG  62.83 
 
 		 215 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626533  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1874  urease accessory protein UreG  59.16 
 
 		 204 aa  249  2e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4248  urease accessory protein UreG  62.77 
 
 		 216 aa  249  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2302  urease accessory protein UreG  63.74 
 
 		 224 aa  249  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7005  urease accessory protein UreG  63.55 
 
 		 207 aa  249  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.896739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0561  urease accessory protein UreG  62.77 
 
 		 204 aa  249  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562305  normal  0.940607 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03470  urease accessory protein UreG  58.12 
 
 		 203 aa  248  6e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.546995  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3408  urease accessory protein UreG  61.27 
 
 		 229 aa  248  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.835805  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0998  urease accessory protein UreG  62.69 
 
 		 209 aa  248  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1723  urease accessory protein UreG  62.44 
 
 		 225 aa  245  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3659  urease accessory protein UreG  57.59 
 
 		 205 aa  245  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.319946  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2251  urease accessory protein UreG  60.21 
 
 		 201 aa  245  4e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1493  urease accessory protein UreG  62.77 
 
 		 216 aa  245  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.286659  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3079  urease accessory protein UreG  61.03 
 
 		 216 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2187  urease accessory protein UreG  61.03 
 
 		 216 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2060  urease accessory protein UreG  61.03 
 
 		 216 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0720  urease accessory protein UreG  61.03 
 
 		 216 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3115  urease accessory protein UreG  61.03 
 
 		 216 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2554  urease accessory protein UreG  61.03 
 
 		 216 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7567  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3138  urease accessory protein UreG  61.03 
 
 		 216 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0830  urease accessory protein UreG  57.89 
 
 		 203 aa  244  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2840  urease accessory protein UreG  62.56 
 
 		 207 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2849  urease accessory protein UreG  62.56 
 
 		 207 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1049  urease accessory protein UreG  60.75 
 
 		 205 aa  241  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.113322  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19201  urease accessory protein UreG  59.38 
 
 		 205 aa  241  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2931  urease accessory protein UreG  62.56 
 
 		 207 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.193752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4453  urease accessory protein UreG  61.17 
 
 		 205 aa  241  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0971  urease accessory protein UreG  61.54 
 
 		 218 aa  240  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1347  urease accessory protein UreG  59.31 
 
 		 218 aa  240  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2451  urease accessory protein UreG  60.96 
 
 		 219 aa  240  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.296243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>