More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1136 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1136  urease accessory protein UreG  100 
 
 		 220 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.755264  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1082  urease accessory protein UreG  100 
 
 		 220 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3559  urease accessory protein  100 
 
 		 220 aa  442  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29571  normal  0.0153059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5119  urease accessory protein UreG  77.72 
 
 		 215 aa  330  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1302  urease accessory protein UreG  76.73 
 
 		 215 aa  325  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1464  urease accessory protein UreG  76.73 
 
 		 215 aa  325  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1317  urease accessory protein UreG  71.29 
 
 		 212 aa  314  8e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1361  urease accessory protein UreG  70.33 
 
 		 212 aa  308  4e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.346026  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2063  urease accessory protein UreG  61.73 
 
 		 211 aa  268  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000301925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2717  urease accessory protein  61.73 
 
 		 209 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4413  urease accessory protein UreG  56.86 
 
 		 208 aa  250  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4441  urease accessory protein UreG  57.29 
 
 		 214 aa  247  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0748  urease accessory protein UreG  58.59 
 
 		 212 aa  245  4.9999999999999997e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1556  urease accessory protein UreG  52.71 
 
 		 206 aa  240  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1963  urease accessory protein UreG  55.78 
 
 		 216 aa  239  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1089  urease accessory protein UreG  59.2 
 
 		 204 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1813  urease accessory protein UreG  58.21 
 
 		 202 aa  237  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2117  urease accessory protein UreG  60.1 
 
 		 204 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4636  urease accessory protein UreG  55.17 
 
 		 200 aa  232  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000195315  normal  0.0674257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2409  urease accessory protein UreG  54.77 
 
 		 220 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03470  urease accessory protein UreG  56 
 
 		 203 aa  232  4.0000000000000004e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.546995  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2768  urease accessory protein UreG  56.65 
 
 		 205 aa  231  6e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2317  urease accessory protein UreG  58.59 
 
 		 204 aa  231  8.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.301422  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2360  urease accessory protein UreG  58.59 
 
 		 204 aa  231  8.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.553398  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3261  urease accessory protein UreG  58.85 
 
 		 221 aa  231  8.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0776  urease accessory protein UreG  57.79 
 
 		 215 aa  231  9e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4003  urease accessory protein UreG  57.29 
 
 		 215 aa  230  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4032  urease accessory protein UreG  58.85 
 
 		 207 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.199977 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2493  urease accessory protein UreG  57.79 
 
 		 215 aa  230  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1874  urease accessory protein UreG  57.58 
 
 		 204 aa  229  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0959  urease accessory protein UreG  53.2 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6188  urease accessory protein UreG  54.03 
 
 		 208 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0187  urease accessory protein UreG  54.46 
 
 		 211 aa  229  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2997  urease accessory protein UreG  53.3 
 
 		 203 aa  229  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.787106 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0787  urease accessory protein UreG  57.58 
 
 		 215 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0224  urease accessory protein UreG  54.37 
 
 		 207 aa  229  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3107  urease accessory protein UreG  57.81 
 
 		 202 aa  228  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1493  urease accessory protein UreG  57.29 
 
 		 216 aa  228  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.286659  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0867  urease accessory protein UreG  56.78 
 
 		 215 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0418  urease accessory protein UreG  56.78 
 
 		 215 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3202  urease accessory protein UreG  58.55 
 
 		 204 aa  228  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0897  urease accessory protein UreG  56.78 
 
 		 215 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626533  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2621  urease accessory protein UreG  55.1 
 
 		 201 aa  227  1e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131688  normal  0.804945 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1244  urease accessory protein UreG  53.37 
 
 		 213 aa  227  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1364  urease accessory protein UreG  57.81 
 
 		 210 aa  226  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1190  urease accessory protein UreG  54.63 
 
 		 206 aa  226  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.257386  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1424  urease accessory protein UreG  56.63 
 
 		 201 aa  226  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4248  urease accessory protein UreG  55.28 
 
 		 216 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2867  urease accessory protein UreG  58.33 
 
 		 205 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.378326  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0246  urease accessory protein UreG  55.05 
 
 		 205 aa  226  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2877  urease accessory protein UreG  53.47 
 
 		 203 aa  226  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3238  urease accessory protein UreG  57.51 
 
 		 204 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.522124 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0395  urease accessory protein UreG  55.56 
 
 		 204 aa  225  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3013  urease accessory protein UreG  57.51 
 
 		 204 aa  226  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2196  urease accessory protein UreG  52.76 
 
 		 220 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2251  urease accessory protein UreG  55.1 
 
 		 201 aa  225  5.0000000000000005e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64670  urease accessory protein UreG  55.28 
 
 		 204 aa  224  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00341231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0684  urease accessory protein UreG  53.03 
 
 		 203 aa  224  7e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0664  urease accessory protein UreG  54.77 
 
 		 204 aa  224  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.469815  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1684  urease accessory protein UreG  54.92 
 
 		 206 aa  224  8e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3659  urease accessory protein UreG  56.06 
 
 		 205 aa  224  8e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.319946  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3942  urease accessory protein UreG  55.67 
 
 		 225 aa  224  9e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1137  urease accessory protein UreG  52.5 
 
 		 216 aa  224  9e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4160  urease accessory protein UreG  54.9 
 
 		 211 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1764  urease accessory protein UreG  56.65 
 
 		 203 aa  223  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.861416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1179  urease accessory protein UreG  52.2 
 
 		 213 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.585829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09380  urease accessory protein UreG  57.29 
 
 		 204 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  54.77 
 
 		 204 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4708  urease accessory protein UreG  57.29 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2687  urease accessory protein UreG  58.33 
 
 		 207 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0058  urease accessory protein UreG  52.97 
 
 		 204 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.418935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3079  urease accessory protein UreG  55.78 
 
 		 216 aa  222  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2187  urease accessory protein UreG  55.78 
 
 		 216 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2554  urease accessory protein UreG  55.78 
 
 		 216 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2060  urease accessory protein UreG  55.78 
 
 		 216 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3115  urease accessory protein UreG  55.78 
 
 		 216 aa  222  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1358  urease accessory protein UreG  52.5 
 
 		 214 aa  222  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0720  urease accessory protein UreG  55.78 
 
 		 216 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2008  urease accessory protein UreG  57.73 
 
 		 206 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3138  urease accessory protein UreG  55.78 
 
 		 216 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4832  urease accessory protein UreG  54.37 
 
 		 212 aa  221  4.9999999999999996e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1384  urease accessory protein UreG  54.77 
 
 		 210 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0474  urease accessory protein UreG  53.93 
 
 		 206 aa  221  7e-57  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1198  urease accessory protein UreG  52.5 
 
 		 214 aa  221  8e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195176  normal  0.215478 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1701  urease accessory protein UreG  53.73 
 
 		 204 aa  221  9e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266659 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00892  urease accessory protein UreG  50 
 
 		 203 aa  220  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870329  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1477  urease accessory protein UreG  54.81 
 
 		 212 aa  219  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0957656  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3533  urease accessory protein UreG  52.97 
 
 		 229 aa  219  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.490615 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0302  urease accessory protein G  54.36 
 
 		 207 aa  218  5e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0992  urease accessory protein UreG  53.85 
 
 		 207 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0561  urease accessory protein UreG  55.78 
 
 		 204 aa  217  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562305  normal  0.940607 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29751  urease accessory protein UreG  53.06 
 
 		 203 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1946  urease accessory protein UreG  53.85 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00965207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4911  urease accessory protein UreG  54.77 
 
 		 205 aa  215  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4453  urease accessory protein UreG  55.28 
 
 		 205 aa  215  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0380  urease accessory protein UreG  51.67 
 
 		 213 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2261  urease accessory protein UreG  53.61 
 
 		 201 aa  214  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2377  urease accessory protein UreG  53 
 
 		 203 aa  214  9e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.168299 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0971  urease accessory protein UreG  54.59 
 
 		 218 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3408  urease accessory protein UreG  54.59 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.835805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>