More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1030 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1030  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  294  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.163763 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1794  hypothetical protein  66.67 
 
 		 163 aa  174  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.786211 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1141  MSHA pilin protein MshB  42.16 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  48.48 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1410  hypothetical protein  59.18 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1172  hypothetical protein  35.92 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123806  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  36.49 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  38.89 
 
 		 159 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  45.65 
 
 		 201 aa  52.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  38.24 
 
 		 201 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  46.43 
 
 		 139 aa  52  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  38.46 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  46.94 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0391  hypothetical protein  59.46 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.588550000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0366  N-terminal methylation  37.84 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  39.44 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  35.24 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  46.94 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  39.29 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  35.21 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  50 
 
 		 218 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  33.68 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3268  hypothetical protein  57.89 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0320  N- methylation  34.55 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  35.82 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  38.24 
 
 		 205 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000885834  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  35.59 
 
 		 205 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  38.03 
 
 		 187 aa  51.2  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  35.59 
 
 		 205 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  32.33 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  46.94 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3100  hypothetical protein  52.63 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  35.94 
 
 		 169 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  43.48 
 
 		 205 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  35.59 
 
 		 205 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  35.71 
 
 		 202 aa  51.2  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  39.66 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  34.95 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  55 
 
 		 186 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  37.74 
 
 		 193 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  33.78 
 
 		 186 aa  51.2  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  44.19 
 
 		 146 aa  50.8  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  35.59 
 
 		 205 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  55 
 
 		 182 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  33.33 
 
 		 176 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  35.59 
 
 		 205 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  35.82 
 
 		 174 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4570  MSHA pilin protein MshB  47.73 
 
 		 229 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527275  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  35.59 
 
 		 205 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  45.61 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  42.86 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  35.59 
 
 		 205 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  45.61 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  33.87 
 
 		 174 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  47.73 
 
 		 211 aa  50.8  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  53.85 
 
 		 172 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  32.41 
 
 		 187 aa  50.4  0.000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  35.29 
 
 		 205 aa  50.4  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  55 
 
 		 171 aa  50.4  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  34.78 
 
 		 173 aa  50.1  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  48 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  35.71 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0324  hypothetical protein  44.07 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00212965  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  36.84 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  36.21 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  49.02 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  36.84 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  44.19 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  37.1 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  53.85 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  36.54 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  36.54 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  32.5 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  36.84 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  36.54 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4411  methylation site containing protein  46.81 
 
 		 219 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000316241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  38.46 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  65.62 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  31.67 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  63.64 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  50 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  55 
 
 		 195 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  47.62 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  31.85 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  50.98 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  46.67 
 
 		 212 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  31.15 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  31.19 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  34.43 
 
 		 173 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  41.07 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  32.76 
 
 		 179 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  43.66 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  30.15 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  35.71 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  53.85 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  34.38 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  34.38 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  34.38 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  37.7 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  34.38 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>