171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1878 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1878  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 179 aa  343  7e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2055  OmpA/MotB domain-containing protein  99.44 
 
 		 179 aa  340  9e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0263919  normal  0.321427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3940  OmpA/MotB domain-containing protein  73.45 
 
 		 174 aa  216  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0125128  normal  0.230028 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2800  OmpA/MotB domain-containing protein  59.55 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.705658  normal  0.415796 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2987  OmpA/MotB domain-containing protein  58.79 
 
 		 179 aa  162  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.221024  normal  0.129145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3709  OmpA/MotB domain protein  51.93 
 
 		 183 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3552  OmpA/MotB  48.44 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237192  normal  0.244916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2357  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  64.08 
 
 		 842 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131798  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2121  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  63.28 
 
 		 823 aa  122  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.475646 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1793  OmpA/MotB  37.7 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.557894 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  63.93 
 
 		 532 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  50.52 
 
 		 525 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  50.52 
 
 		 525 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  63.93 
 
 		 532 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  50.52 
 
 		 517 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  50.52 
 
 		 517 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  50.52 
 
 		 525 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  50.52 
 
 		 517 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  63.93 
 
 		 532 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  47.92 
 
 		 525 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  62.3 
 
 		 532 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  59.68 
 
 		 538 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  62.3 
 
 		 535 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  62.3 
 
 		 531 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  62.3 
 
 		 535 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  49.48 
 
 		 525 aa  72  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  62.3 
 
 		 557 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  59.02 
 
 		 544 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0102  outer membrane related peptidoglycan-associated lipoprotein  52.38 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207037  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.92 
 
 		 560 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 383 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 537 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1412  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 		 321 aa  52  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.166227  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  32.54 
 
 		 261 aa  51.6  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  35.19 
 
 		 364 aa  50.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  31.36 
 
 		 261 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  31.36 
 
 		 261 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06186  hypothetical protein  27.42 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  36.19 
 
 		 543 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5131  OmpA/MotB domain protein  37.66 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.19 
 
 		 542 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  30.1 
 
 		 271 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  31.43 
 
 		 558 aa  48.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  32.38 
 
 		 218 aa  48.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  31.07 
 
 		 270 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 		 228 aa  47.8  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  36.19 
 
 		 544 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  32.69 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  30.1 
 
 		 271 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  33.63 
 
 		 260 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2312  OmpA/MotB  33.66 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  30.77 
 
 		 270 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1604  OmpA family protein  30.4 
 
 		 558 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395642  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0155  OmpA family protein  30.4 
 
 		 558 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  32.41 
 
 		 510 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  33.93 
 
 		 260 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  33.6 
 
 		 310 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  33.01 
 
 		 226 aa  45.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  37.5 
 
 		 326 aa  45.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  33.65 
 
 		 248 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  35.92 
 
 		 220 aa  45.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  34.95 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0781  OmpA domain-containing protein  34.29 
 
 		 573 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  34.95 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  34.95 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  29.41 
 
 		 412 aa  45.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  32.43 
 
 		 525 aa  45.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  40.58 
 
 		 215 aa  45.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  33.01 
 
 		 228 aa  45.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  34.95 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  39.13 
 
 		 317 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  27.27 
 
 		 229 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0131  OmpA family protein  31.62 
 
 		 542 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 		 313 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  33.01 
 
 		 220 aa  44.7  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0357  OmpA/MotB  29.2 
 
 		 187 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  31.37 
 
 		 214 aa  44.7  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  32.38 
 
 		 587 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  29.37 
 
 		 222 aa  44.3  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  29.13 
 
 		 270 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  32.67 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  32.67 
 
 		 316 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.24 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  35.24 
 
 		 221 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  29.01 
 
 		 648 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  33.01 
 
 		 264 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000182136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  31.37 
 
 		 231 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 		 221 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  29.81 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 224 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  32.67 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  32.67 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 		 221 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  32.67 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  32.67 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  32.67 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  32.28 
 
 		 244 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  30.88 
 
 		 727 aa  43.9  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1787  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 569 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  35.78 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>