More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1307 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1307  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1022  transcriptional regulator, TetR family  92.93 
 
 		 202 aa  320  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  78.79 
 
 		 202 aa  317  6e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  69.7 
 
 		 202 aa  284  5e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  69.7 
 
 		 202 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  68 
 
 		 202 aa  281  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  68 
 
 		 202 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  68 
 
 		 202 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  68 
 
 		 202 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  67.5 
 
 		 202 aa  278  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  63 
 
 		 202 aa  261  6e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  59.5 
 
 		 202 aa  248  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1915  transcriptional regulator, TetR family  64.82 
 
 		 200 aa  246  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  52.26 
 
 		 203 aa  219  3e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  56.92 
 
 		 201 aa  218  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1240  TetR family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 201 aa  215  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1362  TetR family transcriptional regulator  76.3 
 
 		 139 aa  211  7e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  52.53 
 
 		 202 aa  206  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  51.5 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  44.15 
 
 		 212 aa  180  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  44.56 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3254  TetR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 199 aa  152  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3622  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 236 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2838  hypothetical protein  44.76 
 
 		 186 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209272 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3302  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.696216 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2389  nucleoid occlusion protein  30.83 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.102395  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1903  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000201758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1012  hypothetical protein  35.38 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0620  nucleoid occlusion protein  28.4 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000140669 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  24.21 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1117  nucleoid occlusion protein  25.79 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.862438  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0111  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00780937  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0194  nucleoid occlusion protein  28.76 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0501  nucleoid occlusion protein  28.65 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.957497  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  25.62 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00047  nucleoid occlusion protein  27.98 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0182  nucleoid occlusion protein  26.42 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847466  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2985  nucleoid occlusion protein  29.41 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2484  nucleoid occlusion protein  28.24 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.11022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3098  nucleoid occlusion protein  28.24 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170288  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3114  nucleoid occlusion protein  28.07 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  23.81 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0044  nucleoid occlusion protein  29.79 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00442405  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001824  transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000410739  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3674  nucleoid occlusion protein  28.48 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00408157  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3502  nucleoid occlusion protein  28.4 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.284468  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  25 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4387  nucleoid occlusion protein  27.27 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.449333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3719  nucleoid occlusion protein  26.54 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3396  nucleoid occlusion protein  26.54 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6449  nucleoid occlusion protein  25.44 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3145  nucleoid occlusion protein  31.37 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0031  nucleoid occlusion protein  25.31 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0399  nucleoid occlusion protein  25 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0627309  hitchhiker  0.000000000130483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0374  nucleoid occlusion protein  25 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0373  nucleoid occlusion protein  25 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0485263  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0378  nucleoid occlusion protein  32.52 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.99909  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0385  nucleoid occlusion protein  25 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000224895  hitchhiker  0.00861349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3979  nucleoid occlusion protein  27.35 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0777  nucleoid occlusion protein  25.42 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3440  nucleoid occlusion protein  32.52 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3247  nucleoid occlusion protein  32.52 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0542  nucleoid occlusion protein  24.58 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0459  nucleoid occlusion protein  23.93 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126678  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3647  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  22.4 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0126984  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3007  nucleoid occlusion protein  30.41 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.8305 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2181  nucleoid occlusion protein  32.52 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0062  nucleoid occlusion protein  30.07 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2908  nucleoid occlusion protein  32.52 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.946505  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03122  DNA-binding transcriptional regulator  22.4 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0442  transcriptional regulator, TetR family  22.4 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.671353  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4251  nucleoid occlusion protein  23.93 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2012  nucleoid occlusion protein  24.86 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0193  nucleoid occlusion protein  32.52 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0183  nucleoid occlusion protein  32.52 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.24476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03073  hypothetical protein  22.4 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.807649  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0442  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  22.4 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3749  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  22.4 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000431628  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3457  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  22.4 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315342  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  22.4 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00305215  normal  0.159786 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0158  nucleoid occlusion protein  31.71 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0142  nucleoid occlusion protein  25.93 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3840  nucleoid occlusion protein  25.61 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00664895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>