More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3914 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3914  Sigma 54 interacting domain protein  100 
 
 		 464 aa  954    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000232592  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0071  ABC transporter, ATP-binding protein  45.28 
 
 		 212 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3762  ABC transporter related  30.5 
 
 		 632 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3609  AAA ATPase  31.91 
 
 		 296 aa  97.1  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.687866  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3396  hypothetical protein  24.1 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7136  hypothetical protein  24.26 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000678278 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0073  hypothetical protein  27.33 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1946  ABC transporter related protein  29.13 
 
 		 744 aa  73.2  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05410  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  27.68 
 
 		 613 aa  62.4  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0302406  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  29.67 
 
 		 706 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0505  50S ribosomal protein L25 (general stress protein Ctc)  28.21 
 
 		 223 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.522593  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4216  ABC transporter related  29.19 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  25.29 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4264  ABC transporter related  28.16 
 
 		 255 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16611  ABC transporter, ATP-binding component  25.68 
 
 		 229 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0361  ABC transporter related  26.96 
 
 		 1194 aa  54.7  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4372  ABC transporter related  26.86 
 
 		 253 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.191075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4848  Sigma 54 interacting domain protein  26.86 
 
 		 253 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.627338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  26.82 
 
 		 445 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1504  ABC transporter related  25.46 
 
 		 268 aa  53.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  28.02 
 
 		 258 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  27.07 
 
 		 279 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  23.31 
 
 		 276 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  27.62 
 
 		 712 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  28.42 
 
 		 264 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  27.57 
 
 		 239 aa  52.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  28 
 
 		 273 aa  52.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2048  ABC transporter related  25.76 
 
 		 569 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.671831 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  25.4 
 
 		 251 aa  52.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0478  methionine import ATP-binding protein MetN  27.18 
 
 		 223 aa  52  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  25.41 
 
 		 437 aa  51.6  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  27.57 
 
 		 257 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5078  ABC transporter, ATP-binding protein  28.02 
 
 		 219 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  25.47 
 
 		 657 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  26.26 
 
 		 445 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  27.03 
 
 		 257 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  28.92 
 
 		 724 aa  50.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2749  sulfonate/taurine ABC transporter ATP-binding protein  24.2 
 
 		 259 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  27.22 
 
 		 720 aa  50.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3059  taurine import ATP-binding protein TauB  24.66 
 
 		 259 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18760  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  28.67 
 
 		 270 aa  50.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.19842  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1015  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  26.63 
 
 		 224 aa  50.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  27.57 
 
 		 632 aa  50.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2965  ABC transporter  23.92 
 
 		 265 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0568085  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2724  ABC transporter, ATP-binding protein  27.32 
 
 		 225 aa  50.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.497191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  25.4 
 
 		 260 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3307  ABC transporter related  24.19 
 
 		 259 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  28.93 
 
 		 225 aa  49.7  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2646  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.65 
 
 		 200 aa  49.7  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1233  ABC transporter related  25.52 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1821  ABC transporter related  24.43 
 
 		 243 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0936228  hitchhiker  0.0000000174264 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3061  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  23.74 
 
 		 259 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00453099  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1413  cytochrome c biogenesis protein CcmA  24.4 
 
 		 210 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0578  ABC transporter related  27.6 
 
 		 276 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.206439  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0627  ABC transporter ATP-binding protein  27.6 
 
 		 276 aa  49.7  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00990626  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1496  putative ATPase RIL  27.63 
 
 		 590 aa  49.7  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  25.82 
 
 		 257 aa  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  24.21 
 
 		 551 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2487  ABC transporter related protein  30.73 
 
 		 944 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.053528  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1856  ABC transporter related  26.52 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.500244  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0064  polar amino acid ABC transporter ATPase  23.19 
 
 		 261 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684363 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4373  ABC transporter related  26.04 
 
 		 297 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.403478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  26.49 
 
 		 257 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0039  ABC transporter related  30.52 
 
 		 359 aa  49.7  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2223  ABC transporter related  25.88 
 
 		 212 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0225  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.84 
 
 		 272 aa  49.3  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2527  ABC transporter, ATP-binding protein  26.7 
 
 		 263 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  25.82 
 
 		 257 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1114  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  25.76 
 
 		 252 aa  48.9  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  26.09 
 
 		 242 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  25.82 
 
 		 257 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1237  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  27.91 
 
 		 271 aa  48.9  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017659 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  27.75 
 
 		 235 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4456  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  25.81 
 
 		 280 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.458938  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0973  ABC transporter related  25.74 
 
 		 338 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0173  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.6 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  25.82 
 
 		 257 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4422  ABC transporter related  27.54 
 
 		 226 aa  49.3  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5105  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  25.84 
 
 		 371 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.116998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4393  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  25.81 
 
 		 280 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2892  putative phytochrome sensor protein  28.34 
 
 		 453 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1849  ABC transporter related  23.79 
 
 		 251 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2291  ABC transporter related  26.09 
 
 		 255 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398246 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  26.09 
 
 		 242 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0595  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  26.83 
 
 		 259 aa  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.062853  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  25.29 
 
 		 269 aa  48.5  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1284  cytochrome c biogenesis protein CcmA  27.27 
 
 		 208 aa  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.339928  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0723  ABC transporter related  26.35 
 
 		 251 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00967662  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4355  ABC transporter related  25.29 
 
 		 342 aa  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  24.08 
 
 		 249 aa  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3644  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  22.91 
 
 		 376 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.84314  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  25.94 
 
 		 224 aa  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  25.13 
 
 		 731 aa  48.5  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5460  ABC transporter, ATP-binding protein  27.12 
 
 		 280 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00101212  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0356  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  27.91 
 
 		 271 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  25.54 
 
 		 261 aa  47.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  29.21 
 
 		 579 aa  48.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2858  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  26.23 
 
 		 259 aa  47.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0664638  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0758  ABC transporter related  26.78 
 
 		 237 aa  48.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0209945  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  26.26 
 
 		 228 aa  48.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>