More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2527 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2527  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 263 aa  537  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2724  ABC transporter, ATP-binding protein  63.83 
 
 		 225 aa  310  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.497191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 249 aa  199  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  48 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  44.49 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  47.26 
 
 		 230 aa  191  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  48.26 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  44.08 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  47.5 
 
 		 235 aa  188  5.999999999999999e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  47.22 
 
 		 249 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  43.96 
 
 		 230 aa  188  9e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  43.66 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  47.55 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0098  ABC transporter related  48.47 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  47.57 
 
 		 237 aa  186  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000167  predicted ABC-type transport system ATPase component  46.5 
 
 		 230 aa  186  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.780039  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  46.77 
 
 		 219 aa  186  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  46.23 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.54 
 
 		 242 aa  185  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  47.76 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  46.15 
 
 		 246 aa  186  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  41.46 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  43.84 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  42.5 
 
 		 234 aa  185  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.54 
 
 		 242 aa  185  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  45.7 
 
 		 251 aa  185  7e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  42.72 
 
 		 246 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  45.19 
 
 		 226 aa  185  8e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  46.54 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  43.5 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  44.61 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  42.38 
 
 		 230 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  44.61 
 
 		 235 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  47.03 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  47.69 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2958  ABC transporter ATP-binding protein  46.08 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  41.74 
 
 		 233 aa  183  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  47.09 
 
 		 227 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  47.69 
 
 		 249 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  44 
 
 		 249 aa  183  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3074  ABC transporter related  44.13 
 
 		 239 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  47.69 
 
 		 249 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_004310  BR0086  ABC transporter, ATP-binding protein  44.76 
 
 		 242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  47.26 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0084  ABC transporter, ATP-binding protein  44.76 
 
 		 242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  47 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  47.26 
 
 		 228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  47.26 
 
 		 227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  43.33 
 
 		 224 aa  182  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  46.86 
 
 		 228 aa  182  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  47.09 
 
 		 227 aa  181  9.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  44.76 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0550  ABC transporter related  45.77 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0929666  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  43.69 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  44.06 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  46.86 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0415  ABC transporter, ATPase subunit  43.33 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  42.72 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0225  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.84 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  43.56 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  44.29 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  43.24 
 
 		 237 aa  179  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.61 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  45.67 
 
 		 246 aa  178  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  45.67 
 
 		 242 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  45.67 
 
 		 242 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  45.67 
 
 		 242 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.55 
 
 		 230 aa  178  9e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0461  ABC transporter-related protein  42.65 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.880159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3956  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  44.66 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  46.04 
 
 		 227 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  46.57 
 
 		 250 aa  178  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0125  ABC transporter related  45.85 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  40.97 
 
 		 239 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2913  ABC transporter related  45.58 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  46.5 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  41.23 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  44.78 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  44.5 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0009  ABC transporter related protein  45.96 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 226 aa  176  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2221  ABC transporter related  42.5 
 
 		 252 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.83 
 
 		 228 aa  176  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 226 aa  176  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.29 
 
 		 274 aa  176  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  42.79 
 
 		 229 aa  176  5e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  40.67 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  42.79 
 
 		 229 aa  175  6e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  39.58 
 
 		 238 aa  175  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  44.5 
 
 		 228 aa  175  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  44.29 
 
 		 228 aa  175  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  42.18 
 
 		 266 aa  175  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3274  ABC transporter related  43.96 
 
 		 232 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991934  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4055  ABC transporter related  43.93 
 
 		 235 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.91 
 
 		 211 aa  174  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.603113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  43.56 
 
 		 228 aa  174  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2566  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.56 
 
 		 247 aa  174  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0799342  normal  0.05105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1277  ABC transporter related  44.83 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219395  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3732  ABC transporter related  42.99 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>