More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1277 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1277  ABC transporter related  100 
 
 		 234 aa  456  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219395  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  60.09 
 
 		 230 aa  257  9e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  58.48 
 
 		 234 aa  251  6e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0699  ABC transporter related  59.46 
 
 		 233 aa  244  6.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.664628  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  56.36 
 
 		 230 aa  244  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0084  ABC transporter, ATP-binding protein  54.59 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0086  ABC transporter, ATP-binding protein  54.59 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  57.53 
 
 		 237 aa  234  8e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  57.08 
 
 		 231 aa  231  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0098  ABC transporter related  53.21 
 
 		 242 aa  229  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  56.62 
 
 		 231 aa  228  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  55.14 
 
 		 217 aa  228  6e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0125  ABC transporter related  55.91 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0415  ABC transporter, ATPase subunit  55.96 
 
 		 240 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3956  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  57.53 
 
 		 229 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  54.34 
 
 		 235 aa  224  8e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  54.34 
 
 		 230 aa  224  9e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3287  ABC transporter related  57.99 
 
 		 229 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3602  ABC efflux transporter, ATPase subunit  57.99 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258305  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4055  ABC transporter related  52.51 
 
 		 235 aa  222  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  55.3 
 
 		 246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  55.56 
 
 		 251 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  54.75 
 
 		 238 aa  221  9e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2221  ABC transporter related  52.75 
 
 		 252 aa  221  9e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3074  ABC transporter related  54.13 
 
 		 239 aa  221  9e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  55.5 
 
 		 228 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0550  ABC transporter related  51.36 
 
 		 224 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0929666  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  52.17 
 
 		 226 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  55.09 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3732  ABC transporter related  52.05 
 
 		 235 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  55.09 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1018  ABC transporter related  51.54 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  51.38 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  52.75 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  52.51 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  51.38 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2713  ABC transporter related  53.18 
 
 		 224 aa  218  6e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.889678  hitchhiker  0.0038315 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  52.04 
 
 		 250 aa  218  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  52.25 
 
 		 227 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  52.25 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  50.9 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3686  ABC transporter related  57 
 
 		 202 aa  217  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  55.09 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  54.26 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  51.36 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  49.78 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  51.83 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  52.04 
 
 		 242 aa  216  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  52.25 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2678  ABC transporter  58.72 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00869869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  50.45 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  54.63 
 
 		 260 aa  215  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  54.63 
 
 		 230 aa  215  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  51.82 
 
 		 234 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  49.78 
 
 		 239 aa  214  8e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0830  ABC transporter related  55.05 
 
 		 237 aa  214  9e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229113  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0412  ATPase  50.69 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  49.77 
 
 		 228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  54.13 
 
 		 233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3362  ABC transporter, ATP-binding protein  54.26 
 
 		 238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1450  ABC transporter, ATP-binding protein  54.26 
 
 		 238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2309  ABC transporter, ATP-binding protein  54.26 
 
 		 238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  50.45 
 
 		 227 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1943  ABC transporter, ATP-binding protein  54.26 
 
 		 238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1217  ABC transporter, ATP-binding protein  54.26 
 
 		 238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1356  ABC transporter related  53.6 
 
 		 233 aa  211  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0383519  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2348  ABC transporter, ATP-binding protein  53.81 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378115  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3019  ABC transporter-related protein  51.36 
 
 		 237 aa  209  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.364354 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2467  ABC transporter, ATP-binding protein  53.36 
 
 		 238 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  53.14 
 
 		 219 aa  209  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  51.64 
 
 		 219 aa  209  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  51.49 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 228 aa  208  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3413  ABC transporter related  50.46 
 
 		 237 aa  208  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  51.15 
 
 		 224 aa  208  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  50 
 
 		 241 aa  207  9e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  49.32 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4015  ABC transporter-like  51.82 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527031  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  46.15 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  49.32 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23060  ABC transporter ATP-binding protein  51.36 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3030  ABC transporter related  53.54 
 
 		 200 aa  205  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0284091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  47.06 
 
 		 249 aa  205  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  47.06 
 
 		 249 aa  205  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  47.06 
 
 		 250 aa  205  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  47.06 
 
 		 249 aa  204  7e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  47.39 
 
 		 227 aa  204  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1930  ABC transporter related  52.97 
 
 		 258 aa  204  8e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304098  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1067  ABC transporter related protein  50.65 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2559  ABC transporter related  51.36 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000178082  hitchhiker  0.000000000000206732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2067  ABC transporter  49.54 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168595  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2267  ABC transporter, ATP-binding protein  49.54 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0167995  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5219  ABC transporter, ATPase subunit  53.15 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6161  ABC transporter related  53.15 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.455478  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  49.54 
 
 		 233 aa  201  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  46.58 
 
 		 227 aa  201  8e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  46.15 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  47.6 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  46.76 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>