More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18760 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_18760  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  100 
 
 
270 aa  524  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.19842  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2229  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  57.71 
 
 
313 aa  236  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1000  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.84 
 
 
351 aa  236  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.344291  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  45.95 
 
 
547 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  46.97 
 
 
557 aa  232  5e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  46.46 
 
 
536 aa  230  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  46.06 
 
 
534 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1838  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.88 
 
 
344 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  46.46 
 
 
536 aa  230  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2856  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.61 
 
 
338 aa  229  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.843723 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  46.59 
 
 
557 aa  228  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3292  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.62 
 
 
341 aa  227  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  46.85 
 
 
545 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  47.62 
 
 
539 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  47.62 
 
 
539 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  48.43 
 
 
543 aa  225  6e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6445  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.24 
 
 
335 aa  224  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134411  normal  0.258493 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2684  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.39 
 
 
627 aa  224  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00440045  normal  0.764263 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  47.83 
 
 
539 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  47.64 
 
 
542 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  45.96 
 
 
620 aa  222  4.9999999999999996e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  46.46 
 
 
545 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2014  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.25 
 
 
318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.288233  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5346  ABC transporter related  49.6 
 
 
536 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173896  normal  0.0532745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4716  ABC transporter related  48.44 
 
 
271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.796997  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27820  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  49.57 
 
 
612 aa  219  5e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3723  ABC transporter related  46.06 
 
 
545 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2602  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.97 
 
 
355 aa  218  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2989  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.97 
 
 
333 aa  218  7e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4210  ABC transporter related  48.03 
 
 
545 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355372  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  48.15 
 
 
867 aa  218  7.999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6268  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.43 
 
 
335 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  49.4 
 
 
543 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0209  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.11 
 
 
331 aa  216  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3751  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.02 
 
 
334 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.603755 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0868  dipeptide transport ATP-binding protein DppD  44.68 
 
 
336 aa  217  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2854  putative oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  43.31 
 
 
327 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.609157  normal  0.248149 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1406  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  41.46 
 
 
361 aa  217  2e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  46.03 
 
 
534 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  44.09 
 
 
553 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4863  ABC transporter ATP-binding protein, putative oligo/dipeptide transport protein  45.78 
 
 
335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  0.902987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1443  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.59 
 
 
344 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251976  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5668  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.08 
 
 
342 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.467741  normal  0.0318296 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  46.64 
 
 
533 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1281  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.59 
 
 
344 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0113  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.8 
 
 
328 aa  216  4e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.556831  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36500  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  46.39 
 
 
332 aa  216  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.632882  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  49 
 
 
543 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47.45 
 
 
531 aa  214  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4477  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.28 
 
 
326 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.178074  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  47.81 
 
 
530 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3509  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.88 
 
 
330 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.835033 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  47.43 
 
 
533 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  49.03 
 
 
547 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0869  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  47.46 
 
 
343 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  47.21 
 
 
555 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0842  ABC transporter related  50.64 
 
 
593 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0423448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2513  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.4 
 
 
342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.898182  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1930  ABC transporter related  48 
 
 
264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1812  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.7 
 
 
328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6192  ABC transporter related  42.37 
 
 
570 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512255  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5085  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.65 
 
 
334 aa  212  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.371908 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19570  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  46.67 
 
 
332 aa  212  3.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.487374  normal  0.0690527 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  47.21 
 
 
556 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3603  ABC transporter related protein  47.45 
 
 
518 aa  212  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.57 
 
 
674 aa  212  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.734122 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001851  oligopeptide transport ATP-binding protein OppD  43.08 
 
 
285 aa  212  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7020  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  43.7 
 
 
338 aa  212  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1774  ABC transporter related  46.85 
 
 
545 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.846994  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6465  putative oligopeptide ABC transporter (ATP binding protein)  45.56 
 
 
324 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.603078 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  47.48 
 
 
557 aa  212  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1272  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.88 
 
 
328 aa  212  5.999999999999999e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.76985  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00642  ABC transporter ATPase component  43.08 
 
 
285 aa  212  5.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05950  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  50.8 
 
 
265 aa  212  5.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.149541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  50.21 
 
 
593 aa  212  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6090  ABC transporter related  48.59 
 
 
532 aa  211  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44.62 
 
 
324 aa  212  7e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3465  ABC transporter related  46.18 
 
 
548 aa  211  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  47.04 
 
 
542 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  51.03 
 
 
601 aa  211  9e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3821  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.64 
 
 
332 aa  211  9e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.282595  normal  0.751344 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6372  ABC transporter related  41.22 
 
 
569 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.623258 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  44.18 
 
 
525 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  43.08 
 
 
539 aa  211  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  47.11 
 
 
540 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5775  ABC transporter related protein  46 
 
 
257 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0511642  normal  0.641423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  47.04 
 
 
542 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0849  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.51 
 
 
346 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  47.04 
 
 
542 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2384  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.78 
 
 
346 aa  210  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0779922  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0393  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  41.95 
 
 
349 aa  210  2e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0435  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.88 
 
 
330 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.96 
 
 
564 aa  209  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3651  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.46 
 
 
349 aa  209  3e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0185  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
334 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3149  ABC transporter related protein  52.09 
 
 
587 aa  209  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3682  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41.92 
 
 
590 aa  209  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732686  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  44.09 
 
 
619 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1668  ABC transporter related  41.8 
 
 
279 aa  209  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  44.27 
 
 
531 aa  209  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>