More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_27820 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_27820  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  100 
 
 
612 aa  1177    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  38.65 
 
 
867 aa  322  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1016  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.67 
 
 
662 aa  318  1e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0782  ABC transporter related  33.86 
 
 
638 aa  317  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.273406 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2959  ABC transporter related  37.15 
 
 
599 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1932  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.4 
 
 
650 aa  298  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3645  ABC transporter related  37.48 
 
 
599 aa  296  7e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5709  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP- binding protein  38.8 
 
 
608 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147492  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0428  ABC transporter related  35.15 
 
 
582 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2684  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  36.44 
 
 
627 aa  281  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00440045  normal  0.764263 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.44 
 
 
650 aa  278  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0892214 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2148  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.43 
 
 
675 aa  277  5e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.770476  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0451  ABC transporter related  32.2 
 
 
597 aa  274  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5140  ABC transporter related  38.85 
 
 
588 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187142  normal  0.0538978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0076  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.45 
 
 
646 aa  274  4.0000000000000004e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000330872  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0933  ABC transporter related  32.99 
 
 
679 aa  273  5.000000000000001e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.311537 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1273  ABC transporter, ATP-binding/permease  32.64 
 
 
650 aa  271  2.9999999999999997e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08350  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  34.22 
 
 
673 aa  270  8e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.335742  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06700  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  32.72 
 
 
664 aa  261  3e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00896986  normal  0.656809 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0424  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.04 
 
 
679 aa  259  8e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.63975 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0186  ABC transporter related  34.64 
 
 
707 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2053  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.93 
 
 
644 aa  258  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2309  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.61 
 
 
643 aa  255  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.819417  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9142  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.08 
 
 
547 aa  253  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269566  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2513  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  53.96 
 
 
342 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.898182  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3389  ABC transporter related  33.95 
 
 
712 aa  248  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.81 
 
 
317 aa  230  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.658486  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2766  ABC transporter related  50.6 
 
 
301 aa  228  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18760  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  49.57 
 
 
270 aa  219  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.19842  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20160  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  30.91 
 
 
621 aa  215  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.533008  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.63 
 
 
294 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7171  peptide ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 
291 aa  210  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2473  ABC transporter, ATP-binding/permease  32.25 
 
 
691 aa  209  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0795859  normal  0.0679647 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7533  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  45.53 
 
 
337 aa  207  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  43.86 
 
 
544 aa  207  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0473.1  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.7 
 
 
281 aa  206  1e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.909105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0221  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  37.75 
 
 
326 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0208  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.75 
 
 
326 aa  204  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0212  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.75 
 
 
326 aa  204  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0234  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  37.75 
 
 
326 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0248  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.07 
 
 
326 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0269  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.75 
 
 
326 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0244  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.75 
 
 
326 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5077  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.07 
 
 
326 aa  204  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0251  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.75 
 
 
326 aa  204  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0211  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.77 
 
 
326 aa  203  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7185  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  44.66 
 
 
332 aa  203  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  45.06 
 
 
540 aa  203  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0999  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
330 aa  203  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1003  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.61 
 
 
330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0810  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.61 
 
 
330 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0948  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.61 
 
 
330 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0825  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.22 
 
 
330 aa  201  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1310  ABC transporter related  44.18 
 
 
544 aa  201  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0559382  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1400  ABC transporter related  29.74 
 
 
638 aa  201  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785888  normal  0.726008 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  38.61 
 
 
547 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4383  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.61 
 
 
330 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.0305999999999999e-22 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2764  ABC transporter related  44.49 
 
 
631 aa  199  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2965  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44 
 
 
338 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2961  ABC transporter  45.17 
 
 
547 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  40.47 
 
 
557 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.46 
 
 
540 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2263  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.78 
 
 
321 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0306947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0806  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.22 
 
 
330 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  40.86 
 
 
557 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2851  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.46 
 
 
341 aa  196  8.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  43.83 
 
 
539 aa  196  8.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0869  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  42.63 
 
 
343 aa  196  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.52 
 
 
703 aa  196  9e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0222  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
326 aa  196  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0065  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.13 
 
 
371 aa  196  1e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  42.4 
 
 
538 aa  195  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5708  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.08 
 
 
338 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2856  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.35 
 
 
338 aa  196  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.843723 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  44.17 
 
 
538 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3854  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 
346 aa  194  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.403514  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2779  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.06 
 
 
336 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0549786  normal  0.0731119 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4046  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.69 
 
 
353 aa  194  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.53 
 
 
365 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2963  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.28 
 
 
338 aa  195  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6445  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.57 
 
 
335 aa  194  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134411  normal  0.258493 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0046  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 
336 aa  194  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0815  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.23 
 
 
386 aa  194  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  39.22 
 
 
671 aa  194  5e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426861  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4352  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.27 
 
 
329 aa  194  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.907997  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
708 aa  193  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108178  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0418  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.98 
 
 
339 aa  193  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.755562  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0313  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.63 
 
 
332 aa  193  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0212  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.93 
 
 
336 aa  193  9e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  42.54 
 
 
543 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1482  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.07 
 
 
727 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3509  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.37 
 
 
330 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.835033 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0113  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.52 
 
 
328 aa  192  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.556831  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1063  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.1 
 
 
339 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  43.75 
 
 
534 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  42.54 
 
 
543 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  42.54 
 
 
543 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05950  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  44.98 
 
 
265 aa  192  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.149541 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf400  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  37.09 
 
 
393 aa  192  2e-47  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  41.34 
 
 
536 aa  192  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>