More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2766 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2766  ABC transporter related  100 
 
 
301 aa  580  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2513  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  60.38 
 
 
342 aa  291  9e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.898182  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  45.59 
 
 
547 aa  237  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2856  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.83 
 
 
338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.843723 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.51 
 
 
564 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5775  ABC transporter related protein  50.2 
 
 
257 aa  232  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0511642  normal  0.641423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2814  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.06 
 
 
340 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.241348  normal  0.0563642 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1000  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.91 
 
 
351 aa  229  6e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.344291  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.2 
 
 
335 aa  228  7e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501271  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27820  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  50.6 
 
 
612 aa  228  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1251  ABC transporter related  48.03 
 
 
284 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  48.94 
 
 
661 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  48.55 
 
 
557 aa  225  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4372  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  52.73 
 
 
325 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1951  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.28 
 
 
322 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176704  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  46.44 
 
 
533 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0035  ABC transporter related  46.85 
 
 
285 aa  223  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00363386  normal  0.320006 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7185  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  45.42 
 
 
332 aa  222  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.16 
 
 
548 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0810  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0806  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.57 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0212  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.66 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1003  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.57 
 
 
330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2961  ABC transporter  49.8 
 
 
547 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0948  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.57 
 
 
330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  48.61 
 
 
540 aa  221  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2744  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.61 
 
 
336 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5112  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.66 
 
 
336 aa  220  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0999  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
330 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0825  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0487  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.02 
 
 
340 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3600  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.85 
 
 
331 aa  219  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3266  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.19 
 
 
330 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496309  normal  0.0441332 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0111  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44 
 
 
322 aa  219  6e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4383  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.57 
 
 
330 aa  219  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.0305999999999999e-22 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  47.1 
 
 
543 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0869  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  47.04 
 
 
343 aa  219  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1016  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.21 
 
 
662 aa  218  7.999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  44.62 
 
 
537 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1812  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.85 
 
 
328 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2323  ABC transporter related  47.47 
 
 
277 aa  218  8.999999999999998e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.936398 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2462  ABC transporter related  49.21 
 
 
274 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.612548  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5668  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.24 
 
 
342 aa  218  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.467741  normal  0.0318296 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  49 
 
 
540 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0188  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  41.08 
 
 
336 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0052  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.71 
 
 
326 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.617772  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0804  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppD  49.21 
 
 
274 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.69273  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0187  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  41.08 
 
 
336 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1615  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.5 
 
 
353 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4095  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.1 
 
 
326 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0047  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.31 
 
 
326 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0207  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.08 
 
 
336 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  46.38 
 
 
543 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5140  ABC transporter related  51.34 
 
 
588 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187142  normal  0.0538978 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0375  ABC transporter related  49.21 
 
 
274 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0759  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.9 
 
 
353 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6090  ABC transporter related  47.71 
 
 
532 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0178  oligopeptide ABC transportor, ATP-binding protein  40.66 
 
 
336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  51.04 
 
 
558 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  45.88 
 
 
545 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4477  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.15 
 
 
326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.178074  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0532  putative peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.31 
 
 
530 aa  216  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2963  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.39 
 
 
338 aa  216  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1269  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.25 
 
 
340 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0263793  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4502  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.59 
 
 
329 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0175  oligopeptide ABC transportor, ATP-binding protein  40.66 
 
 
336 aa  216  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.917923  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  47.31 
 
 
531 aa  216  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0944  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.55 
 
 
338 aa  216  5e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2602  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.49 
 
 
355 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  50.64 
 
 
561 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  43.38 
 
 
586 aa  215  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf400  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  39.69 
 
 
393 aa  215  7e-55  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1765  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.18 
 
 
325 aa  215  7e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.743742  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  45.04 
 
 
539 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3292  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44.9 
 
 
341 aa  215  9e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2989  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 
333 aa  215  9e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2913  ABC transporter-related protein  46.99 
 
 
278 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  40.3 
 
 
522 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0046  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.16 
 
 
336 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3904  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.92 
 
 
326 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.463258  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0187  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.56 
 
 
327 aa  214  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235094  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.82 
 
 
527 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2175  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  49.61 
 
 
344 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00209002  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0141  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.1 
 
 
326 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1932  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  53.11 
 
 
650 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  40.96 
 
 
555 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2800  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.41 
 
 
322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110388  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  44.94 
 
 
557 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5789  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.96 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  hitchhiker  0.00122785 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  50.21 
 
 
565 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4059  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.56 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  50.21 
 
 
534 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  46.67 
 
 
542 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0091  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.56 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.887805  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4072  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.56 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0671  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.2 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642349  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1080  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.35 
 
 
347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  43.43 
 
 
527 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  41.07 
 
 
556 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1194  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.35 
 
 
347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>