275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3150 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3150  Resolvase domain protein  100 
 
 
532 aa  1104    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.617817  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  23.38 
 
 
475 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4607  DNA recombinase, putative  26.96 
 
 
526 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4586  DNA recombinase, putative  26.96 
 
 
532 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  23.59 
 
 
525 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  28.38 
 
 
462 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4608  DNA recombinase, putative  25.96 
 
 
511 aa  99  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  24.78 
 
 
511 aa  99.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  25.89 
 
 
447 aa  99.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  24.89 
 
 
586 aa  96.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4587  DNA recombinase, putative  25.94 
 
 
486 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  25.64 
 
 
534 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  24.86 
 
 
537 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  25.36 
 
 
534 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  25.43 
 
 
534 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  29.21 
 
 
546 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  24.94 
 
 
525 aa  94.4  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  25.07 
 
 
534 aa  94  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  25.32 
 
 
445 aa  93.2  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  24.28 
 
 
534 aa  93.2  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2577  Resolvase domain protein  24.41 
 
 
603 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.551292 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  25.43 
 
 
537 aa  91.3  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  25.19 
 
 
525 aa  91.3  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  23.04 
 
 
528 aa  91.3  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  25.52 
 
 
445 aa  90.9  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  24.5 
 
 
534 aa  90.9  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0850  DNA recombinase, putative  23.58 
 
 
543 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  24.18 
 
 
445 aa  89.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0854  DNA recombinase, putative  23.58 
 
 
543 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000136603 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  23.37 
 
 
521 aa  89  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  22.46 
 
 
528 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  25.55 
 
 
489 aa  88.2  3e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  24.19 
 
 
462 aa  87.8  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  24.7 
 
 
441 aa  88.2  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0853  DNA recombinase, putative  23.72 
 
 
494 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000111674 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  24.83 
 
 
449 aa  87  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  24.71 
 
 
459 aa  86.7  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  24.42 
 
 
462 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0849  DNA recombinase, putative  23.36 
 
 
494 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  24.39 
 
 
475 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  24.29 
 
 
441 aa  85.9  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  25.41 
 
 
505 aa  85.5  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  24.71 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  22.98 
 
 
515 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  26.67 
 
 
441 aa  83.6  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  26.74 
 
 
523 aa  83.6  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  22.28 
 
 
485 aa  82.8  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  24.32 
 
 
474 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  26.37 
 
 
523 aa  81.3  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  27.13 
 
 
522 aa  80.9  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  19.34 
 
 
546 aa  80.9  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  21.3 
 
 
613 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  25.53 
 
 
522 aa  78.6  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  25.55 
 
 
500 aa  78.6  0.0000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  23.83 
 
 
520 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  21.44 
 
 
535 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  25.59 
 
 
519 aa  77.4  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  22.03 
 
 
488 aa  77  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3568  Resolvase domain protein  21.73 
 
 
484 aa  76.6  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  25.7 
 
 
542 aa  76.3  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  25.7 
 
 
542 aa  76.3  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  24.74 
 
 
498 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  26.38 
 
 
513 aa  75.5  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  25.35 
 
 
516 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  25.7 
 
 
542 aa  75.9  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  24.64 
 
 
522 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  26.59 
 
 
487 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  24.7 
 
 
474 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  24.55 
 
 
549 aa  75.1  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  20.54 
 
 
534 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  21.99 
 
 
524 aa  74.7  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  23.38 
 
 
479 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3963  recombinase  24.12 
 
 
493 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  24.18 
 
 
552 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  24.32 
 
 
421 aa  74.3  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  27.03 
 
 
545 aa  74.3  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3310  recombinase family  24.59 
 
 
501 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19852  hitchhiker  0.000000416205 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  25.12 
 
 
516 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  22.2 
 
 
510 aa  73.9  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  24.15 
 
 
524 aa  73.9  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  19.87 
 
 
509 aa  73.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  22.92 
 
 
537 aa  73.9  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  23.55 
 
 
518 aa  73.6  0.000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  24.44 
 
 
441 aa  73.6  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0615  Resolvase domain protein  23.94 
 
 
461 aa  73.6  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  25.33 
 
 
443 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  23.05 
 
 
460 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.62 
 
 
522 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  21.43 
 
 
527 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  24.92 
 
 
445 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  26.05 
 
 
500 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4097  Recombinase  24.59 
 
 
575 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667971  normal  0.110676 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  25 
 
 
568 aa  71.6  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  21.44 
 
 
517 aa  71.2  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  24.48 
 
 
504 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  22.52 
 
 
521 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  23.61 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  23.32 
 
 
579 aa  70.5  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  25.76 
 
 
500 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3036  recombinase  21.81 
 
 
548 aa  70.5  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>