More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1755 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  100 
 
 		 266 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  56.87 
 
 		 282 aa  315  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  47.62 
 
 		 265 aa  255  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  47.81 
 
 		 275 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  48.19 
 
 		 265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  47.41 
 
 		 271 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  48.33 
 
 		 263 aa  249  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  44.11 
 
 		 265 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  47.81 
 
 		 254 aa  245  6.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  45.45 
 
 		 263 aa  244  9e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  44.49 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  44.84 
 
 		 265 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  43.73 
 
 		 265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  44.66 
 
 		 263 aa  241  9e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  44.53 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  50 
 
 		 270 aa  228  9e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0073  glutamate racemase  46.47 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1257  glutamate racemase  44.53 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  43.95 
 
 		 268 aa  216  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  42.8 
 
 		 277 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1451  glutamate racemase  46.3 
 
 		 279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00367617  normal  0.1291 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2265  glutamate racemase  44.86 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  38.28 
 
 		 282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  48.84 
 
 		 272 aa  212  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  44.44 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  39.27 
 
 		 280 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2114  glutamate racemase  45.91 
 
 		 287 aa  208  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  38.19 
 
 		 260 aa  208  8e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2221  glutamate racemase  45.37 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0226254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2235  glutamate racemase  46.12 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682473  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1943  glutamate racemase  45.37 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  37.89 
 
 		 260 aa  205  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3138  glutamate racemase  44.44 
 
 		 295 aa  205  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478139  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  42.34 
 
 		 268 aa  205  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5881  glutamate racemase  44.91 
 
 		 285 aa  205  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2196  glutamate racemase  44.91 
 
 		 285 aa  205  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626892  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1411  glutamate racemase  44.86 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426181  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2274  glutamate racemase  39 
 
 		 270 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0643046  hitchhiker  0.00406767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  44.39 
 
 		 292 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1934  glutamate racemase  44.44 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0524  glutamate racemase  44.44 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0621  glutamate racemase  43.98 
 
 		 290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  42.29 
 
 		 259 aa  199  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3247  glutamate racemase  38.76 
 
 		 266 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1088  glutamate racemase  43.98 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1799  glutamate racemase  43.98 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0796  glutamate racemase  43.98 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2060  glutamate racemase  43.98 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  43.06 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2541  glutamate racemase  43.54 
 
 		 272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5525  glutamate racemase  45.37 
 
 		 286 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  42.52 
 
 		 288 aa  193  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0440  glutamate racemase  37.55 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000912391 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  42.59 
 
 		 275 aa  192  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3114  glutamate racemase  39.3 
 
 		 269 aa  188  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  39.15 
 
 		 278 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1360  glutamate racemase  38.89 
 
 		 269 aa  188  5.999999999999999e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1295  glutamate racemase  36.54 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04380  Glutamate racemase  40.66 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  40 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  37.04 
 
 		 273 aa  184  9e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  39.15 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0104  glutamate racemase  38.72 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  39.15 
 
 		 276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  40.43 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  36.95 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  38.91 
 
 		 266 aa  181  9.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06670  glutamate racemase  37.1 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000549454  normal  0.0772332 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1088  glutamate racemase  39.59 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  37.41 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  37.76 
 
 		 267 aa  178  7e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  37.6 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2884  glutamate racemase  38.37 
 
 		 272 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  42.79 
 
 		 269 aa  175  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  37.44 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  37.44 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  38.03 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2517  glutamate racemase  38.33 
 
 		 269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2597  glutamate racemase  40.79 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1488  glutamate racemase  40.44 
 
 		 296 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.044045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  32.95 
 
 		 264 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  33.97 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2045  glutamate racemase  38.95 
 
 		 281 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36787  normal  0.0203699 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2651  glutamate racemase  37.02 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589508  normal  0.507569 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  34.47 
 
 		 289 aa  169  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  39.56 
 
 		 273 aa  169  6e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  33.08 
 
 		 271 aa  168  7e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  33.71 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  34.89 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  34.66 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  36.32 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  32.95 
 
 		 264 aa  166  5e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  39.46 
 
 		 267 aa  166  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3213  glutamate racemase  37.45 
 
 		 301 aa  165  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  34.87 
 
 		 261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  40.87 
 
 		 271 aa  165  9e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  33.05 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2085  glutamate racemase  33.46 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  33.7 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  33.08 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>