130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3495 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3495  putative SCP-like extracellular protein  100 
 
 		 176 aa  354  3.9999999999999996e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2861  Allergen V5/Tpx-1 family protein  64.63 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1200  hypothetical protein  64.63 
 
 		 184 aa  228  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2638  Allergen V5/Tpx-1 family protein  65.85 
 
 		 179 aa  226  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.450247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2897  Allergen V5/Tpx-1 related  57.83 
 
 		 176 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.870748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2580  Allergen V5/Tpx-1 family protein  54.97 
 
 		 199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.9 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  34.71 
 
 		 541 aa  77  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  37.9 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  39.13 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4232  hypothetical protein  32.2 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  37.39 
 
 		 222 aa  73.9  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  29.92 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  36.13 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  36.79 
 
 		 294 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  34.45 
 
 		 495 aa  68.2  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  32.79 
 
 		 347 aa  67.8  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  31.33 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.09 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2711  SCP-like extracellular  35.71 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000599492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  33.9 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  26.22 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  31.54 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  33.62 
 
 		 264 aa  61.6  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  34.29 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  30.77 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  35.09 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  32.73 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  30.77 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  29.14 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  35.65 
 
 		 287 aa  58.2  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  31.82 
 
 		 283 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  32.38 
 
 		 310 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  33.33 
 
 		 293 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  37.4 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.46 
 
 		 444 aa  57.4  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3446  SCP-like extracellular  29.38 
 
 		 589 aa  57.8  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  29.73 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  31.43 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0598  SCP-like extracellular  33.33 
 
 		 276 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.845775  normal  0.23326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1597  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.85 
 
 		 602 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  30.6 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  30.08 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  30.82 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  33.94 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  30.43 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1399  Allergen V5/Tpx-1 family protein  40.43 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  32.5 
 
 		 458 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  31.34 
 
 		 335 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8011  SCP-like extracellular  33.04 
 
 		 323 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  32.48 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  29.27 
 
 		 255 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.83 
 
 		 443 aa  52  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  33.04 
 
 		 300 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  29.73 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  24.81 
 
 		 235 aa  52  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  34.51 
 
 		 286 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2195  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.59 
 
 		 232 aa  51.6  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0225446  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  31.03 
 
 		 139 aa  50.8  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  30.3 
 
 		 188 aa  50.8  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0323  hypothetical protein  31.03 
 
 		 139 aa  50.8  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  33.08 
 
 		 282 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  27.64 
 
 		 249 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  28.46 
 
 		 423 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  33.98 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  28.57 
 
 		 305 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  26.83 
 
 		 328 aa  48.9  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2756  hypothetical protein  32.33 
 
 		 169 aa  48.9  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  27.14 
 
 		 338 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0703  SCP/PR1 domain-containing proteins-like  32.74 
 
 		 338 aa  48.5  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501608  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1406  Allergen V5/Tpx-1 related  27.78 
 
 		 170 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1386  Allergen V5/Tpx-1 related  27.08 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0140  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.69 
 
 		 372 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.697458  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4689  SCP-like extracellular  28.9 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1215  SCP-like extracellular  28.83 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  28.57 
 
 		 274 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  26.47 
 
 		 263 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  31.3 
 
 		 232 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  26.47 
 
 		 270 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  26.47 
 
 		 275 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  26.47 
 
 		 275 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  26.47 
 
 		 270 aa  45.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  26.47 
 
 		 275 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  32.5 
 
 		 334 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  29.2 
 
 		 244 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  29.81 
 
 		 500 aa  45.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3058  SCP-like extracellular  32.2 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0142297  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  26.47 
 
 		 275 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  26.47 
 
 		 275 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  26.47 
 
 		 275 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  30.84 
 
 		 285 aa  45.1  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3556  Allergen V5/Tpx-1 related  30.08 
 
 		 168 aa  45.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  25.66 
 
 		 450 aa  45.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  28.95 
 
 		 465 aa  45.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1020  SCP-like extracellular  27.95 
 
 		 162 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1086  SCP-like extracellular  28.22 
 
 		 193 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4557  SCP-like extracellular  32.2 
 
 		 169 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  26.32 
 
 		 321 aa  44.3  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4870  SCP-like extracellular  36.49 
 
 		 293 aa  44.3  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.137537 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6973  hypothetical protein  28.21 
 
 		 171 aa  44.3  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>