166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3086 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 349 aa  707    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2397  beta-lactamase domain-containing protein  68.93 
 
 		 344 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21584  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0741  putative metallo-beta-lactamase family protein  68.64 
 
 		 344 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.844995  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2461  beta-lactamase domain-containing protein  66.67 
 
 		 344 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  67.6 
 
 		 329 aa  447  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3893  beta-lactamase-like  64.67 
 
 		 349 aa  437  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0433  beta-lactamase domain-containing protein  58.02 
 
 		 340 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  44.87 
 
 		 342 aa  278  8e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  43.28 
 
 		 352 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  42.73 
 
 		 365 aa  260  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  40.87 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  42.12 
 
 		 400 aa  249  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  40.06 
 
 		 371 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  37.72 
 
 		 348 aa  246  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  41.72 
 
 		 349 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  41.59 
 
 		 357 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  37.24 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  39.18 
 
 		 363 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  36.02 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  38.51 
 
 		 352 aa  229  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  36.75 
 
 		 354 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  41.07 
 
 		 374 aa  226  6e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  37.17 
 
 		 354 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  37.43 
 
 		 341 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  35.48 
 
 		 354 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  37.93 
 
 		 359 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  36.18 
 
 		 361 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  37.85 
 
 		 369 aa  204  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  35.1 
 
 		 359 aa  202  9e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  36.07 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  35.28 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  37.95 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  37.95 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  37.95 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  37.95 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  37.95 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  37.95 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.65 
 
 		 357 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  38.39 
 
 		 335 aa  199  7.999999999999999e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  35.59 
 
 		 359 aa  198  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  36.31 
 
 		 359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  35.57 
 
 		 357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  37.29 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  37.29 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  35.48 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  37.29 
 
 		 359 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  35.8 
 
 		 356 aa  196  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2940  beta-lactamase domain-containing protein  36.72 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.571743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  36.52 
 
 		 362 aa  192  9e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  35 
 
 		 366 aa  192  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  36.16 
 
 		 384 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  34.42 
 
 		 354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  33.9 
 
 		 358 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  35.88 
 
 		 358 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  35.88 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  37.76 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4200  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 		 363 aa  179  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000948581 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  36.7 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4193  beta-lactamase-like  31.48 
 
 		 394 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  31.11 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  29.94 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  31.66 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  32.8 
 
 		 329 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  27.13 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  32.84 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  26.27 
 
 		 324 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  29.08 
 
 		 355 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  30.18 
 
 		 335 aa  102  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  30.21 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  31.71 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 		 332 aa  99.8  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  31.33 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  23.96 
 
 		 310 aa  92.4  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  26.96 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 		 334 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  29.21 
 
 		 334 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  29.66 
 
 		 314 aa  89  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  30.42 
 
 		 368 aa  88.6  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.72 
 
 		 346 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  28.89 
 
 		 334 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  30.51 
 
 		 366 aa  85.9  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  24.53 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  24.45 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  29.75 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  25.83 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  27.9 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  21.78 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  24.14 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  26.1 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  24.3 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  25.61 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  28.31 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  28.78 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  26.01 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  30.34 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  25.56 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  24.46 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  24.14 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>