More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2608 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  100 
 
 		 328 aa  668    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  59.94 
 
 		 329 aa  396  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  48.33 
 
 		 326 aa  268  8e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  45.87 
 
 		 328 aa  261  8e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  44.38 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  45.9 
 
 		 328 aa  255  7e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.34 
 
 		 328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.04 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  43.64 
 
 		 328 aa  249  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  43.64 
 
 		 328 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  44 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  43.37 
 
 		 342 aa  245  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  42.15 
 
 		 330 aa  222  6e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  37.05 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  39.08 
 
 		 335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  34.35 
 
 		 334 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  37.08 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  40.62 
 
 		 328 aa  178  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  35.88 
 
 		 338 aa  153  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  32.02 
 
 		 331 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.94 
 
 		 338 aa  146  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  30.47 
 
 		 667 aa  142  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  34.84 
 
 		 667 aa  142  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  34.04 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  32.83 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  33.65 
 
 		 667 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  32.42 
 
 		 336 aa  136  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  32.15 
 
 		 667 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  37.3 
 
 		 670 aa  129  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  32.04 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  34.44 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  34.53 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 		 324 aa  122  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  33.66 
 
 		 331 aa  122  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  31.75 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  29.54 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  39.36 
 
 		 337 aa  119  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1266  oxidoreductase domain-containing protein  42.46 
 
 		 336 aa  119  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.051874  hitchhiker  0.000127029 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  33.13 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  32.73 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2611  oxidoreductase domain-containing protein  32.22 
 
 		 320 aa  116  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1333  oxidoreductase domain protein  36.36 
 
 		 665 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.157894 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  31.91 
 
 		 665 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  30.41 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  24.05 
 
 		 438 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  30.41 
 
 		 342 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  31.58 
 
 		 331 aa  112  6e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.01 
 
 		 327 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  31.44 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  29.57 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3970  oxidoreductase domain-containing protein  31.12 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000828304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  23.58 
 
 		 319 aa  110  5e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01685  hypothetical protein  29.18 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  35.2 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  31.19 
 
 		 329 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  29.3 
 
 		 365 aa  106  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  29.25 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  29.94 
 
 		 433 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  30.29 
 
 		 329 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  30.36 
 
 		 356 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  30.12 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  28.14 
 
 		 370 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  28.37 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  29.88 
 
 		 327 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  32.22 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  27.88 
 
 		 324 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  26.16 
 
 		 321 aa  99  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  25.8 
 
 		 458 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  30.72 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  30.41 
 
 		 322 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  25.97 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  31.79 
 
 		 360 aa  97.1  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 		 435 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  32.27 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  30.72 
 
 		 374 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  28.14 
 
 		 435 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  31.75 
 
 		 408 aa  95.5  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 435 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  25.81 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 		 334 aa  94.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  25.81 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03524  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  30.7 
 
 		 416 aa  94.4  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00618611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  35.07 
 
 		 331 aa  94  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 		 338 aa  93.2  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  29.57 
 
 		 356 aa  93.2  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  31.7 
 
 		 349 aa  92.8  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  27.11 
 
 		 432 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 		 338 aa  92.4  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  29.72 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  28.95 
 
 		 340 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  34.33 
 
 		 358 aa  90.5  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  31.69 
 
 		 338 aa  90.5  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  27.62 
 
 		 328 aa  90.1  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  37.2 
 
 		 338 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  30.89 
 
 		 359 aa  90.1  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  32.21 
 
 		 359 aa  89.7  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  24.14 
 
 		 329 aa  89.4  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>