138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0339 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0339  protein of unknown function DUF849  100 
 
 		 292 aa  585  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.124207  normal  0.72562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3440  protein of unknown function DUF849  59.3 
 
 		 296 aa  328  8e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1737  hypothetical protein  59.93 
 
 		 291 aa  324  9e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2519  protein of unknown function DUF849  55.9 
 
 		 343 aa  246  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4725  hypothetical protein  25.17 
 
 		 299 aa  85.5  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  29.14 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  28.78 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  28.78 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  28.93 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  28.78 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  27.46 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  28.52 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  30.83 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  27.46 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  28.42 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  28.21 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  27.46 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  27.7 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  28.06 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  28.72 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  26.41 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3085  hypothetical protein  25.34 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  27.34 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  29.18 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  27.14 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  27.34 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  27.14 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  26.98 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  26.98 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  27.34 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  27.7 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  25.62 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  25.4 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  26.9 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  27.7 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  27.05 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  28.03 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  25.5 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  25.85 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  23.61 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  25.68 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  27.24 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  27.18 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1770  hypothetical protein  26.01 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  27.87 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  27.87 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  28.31 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  24.19 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  26.35 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  25 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  27.63 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  26.28 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  25.49 
 
 		 449 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  26.89 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3440  protein of unknown function DUF849  22.61 
 
 		 315 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  hitchhiker  0.000162331 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  28.4 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  25.95 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  25.87 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4715  hypothetical protein  23.4 
 
 		 351 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155352  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  26.83 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  25.52 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.18 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  29.29 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  27.95 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  24.7 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  25.4 
 
 		 272 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3295  hypothetical protein  24.23 
 
 		 305 aa  52.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  24.02 
 
 		 290 aa  52.8  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  27.24 
 
 		 293 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  25.7 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  27.27 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  26.29 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  26.42 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  24.57 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  24.5 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4492  protein of unknown function DUF849  25.99 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  25.8 
 
 		 453 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  25 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  26.14 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  24.9 
 
 		 293 aa  50.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  25.1 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  24.67 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6431  protein of unknown function DUF849  26.15 
 
 		 300 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  24.51 
 
 		 310 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  25.09 
 
 		 300 aa  49.3  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  24.26 
 
 		 308 aa  49.3  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004321  hypothetical protein  32.46 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2188  hypothetical protein  23.57 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  27.24 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2376  protein of unknown function DUF849  27.24 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  25.84 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3344  protein of unknown function DUF849  38.1 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6127  hypothetical protein  25.78 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  27.49 
 
 		 296 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  25.61 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  25.33 
 
 		 281 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3667  protein of unknown function DUF849  37.14 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  32.18 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2814  hypothetical protein  26.07 
 
 		 290 aa  46.6  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.151503  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3412  hypothetical protein  27.78 
 
 		 277 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>