294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2112 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  100 
 
 		 425 aa  852    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3064  ribonuclease BN, putative  44.25 
 
 		 473 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00183316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  38.97 
 
 		 453 aa  287  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  42.38 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  37.56 
 
 		 449 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  39.16 
 
 		 479 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  38.2 
 
 		 446 aa  249  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  39.84 
 
 		 446 aa  249  9e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  39.77 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1819  putative ribonuclease BN  34.18 
 
 		 442 aa  234  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.193645 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2681  ribonuclease BN  39.54 
 
 		 561 aa  232  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.267088 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  38.9 
 
 		 450 aa  229  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  32.49 
 
 		 452 aa  202  6e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2655  ribonuclease BN  34.31 
 
 		 439 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0958  ribonuclease BN, putative  32.22 
 
 		 411 aa  197  4.0000000000000005e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.107096 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0595  ribonuclease BN  36.6 
 
 		 460 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4086  putative ribonuclease BN  33.82 
 
 		 487 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1514  ribonuclease BN  33.51 
 
 		 472 aa  184  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.258349  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3053  putative ribonuclease BN  34.64 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1636  ribonuclease BN  33.15 
 
 		 447 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  32.37 
 
 		 499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0931  putative ribonuclease BN  30.79 
 
 		 459 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2157  ribonuclease BN, putative  34.18 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0732  ribonuclease BN  27.87 
 
 		 424 aa  149  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119651  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0818  ribonuclease BN  26.5 
 
 		 405 aa  146  6e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  33.02 
 
 		 422 aa  146  9e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0935  ribonuclease BN  30.12 
 
 		 432 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  34.96 
 
 		 340 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2958  ribonuclease BN  36.8 
 
 		 286 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0739  putative ribonuclease BN  31.38 
 
 		 434 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  32.98 
 
 		 405 aa  133  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  34.9 
 
 		 285 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  31.74 
 
 		 292 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  33.1 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1323  ribonuclease BN  32.25 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  34.27 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  34.27 
 
 		 323 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  34.27 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  34.27 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  32.75 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  35.18 
 
 		 336 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  32.75 
 
 		 337 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  30.87 
 
 		 298 aa  130  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  29.23 
 
 		 412 aa  129  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  34.93 
 
 		 320 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2769  putative ribonuclease BN  28.27 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  33.21 
 
 		 295 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  28.87 
 
 		 412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  29.02 
 
 		 451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  28.68 
 
 		 447 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1521  ribonuclease BN  33.09 
 
 		 441 aa  126  9e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00169169  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  31.14 
 
 		 290 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  32.16 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  31.14 
 
 		 290 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  31.14 
 
 		 290 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  31.14 
 
 		 290 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  31.14 
 
 		 290 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1119  ribonuclease BN  29.12 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695932  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1013  ribonuclease BN  30.8 
 
 		 427 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.58276 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1200  putative ribonuclease BN  28.88 
 
 		 429 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  29.37 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  33.46 
 
 		 313 aa  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  29.56 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  34.24 
 
 		 411 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1471  ribonuclease BN  30.63 
 
 		 422 aa  124  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.604096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  34.24 
 
 		 411 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  35.06 
 
 		 408 aa  123  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1653  putative ribonuclease BN  33.96 
 
 		 449 aa  123  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.957488  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001900  ribonuclease BN  31.68 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.886374  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3404  ribonuclease BN  36.08 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  28.93 
 
 		 416 aa  121  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  32.12 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  33.13 
 
 		 445 aa  121  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1623  ribonuclease BN  32.73 
 
 		 428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722239  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  28.81 
 
 		 437 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1670  ribonuclease BN  29.63 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0418  ribonuclease BN  35.55 
 
 		 294 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  30.77 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1519  ribonuclease BN  28.24 
 
 		 424 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1830  ribonuclease BN, putative  28.81 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0291213 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  30.34 
 
 		 290 aa  117  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  30.34 
 
 		 290 aa  117  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  30.34 
 
 		 290 aa  117  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  30.34 
 
 		 290 aa  117  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  30.34 
 
 		 290 aa  117  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  30.34 
 
 		 290 aa  117  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  30.34 
 
 		 290 aa  117  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  30.34 
 
 		 290 aa  117  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  28.77 
 
 		 436 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  30.34 
 
 		 290 aa  117  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  28.91 
 
 		 437 aa  116  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0697  ribonuclease BN, putative  33.21 
 
 		 429 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47498  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  28.67 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  29.76 
 
 		 417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0732  ribonuclease BN  33.21 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0733  ribonuclease BN  33.83 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  28.12 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  28.12 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2991  ribonuclease BN, putative  29.68 
 
 		 416 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  31.95 
 
 		 442 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>