220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0256 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  100 
 
 
182 aa  370  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  41.82 
 
 
181 aa  133  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  38.17 
 
 
184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  36.76 
 
 
183 aa  119  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  40.7 
 
 
190 aa  104  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  40.12 
 
 
190 aa  104  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  36.55 
 
 
202 aa  90.9  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  37.35 
 
 
190 aa  87.8  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  34.72 
 
 
189 aa  87.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  40.82 
 
 
202 aa  84.3  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  34.12 
 
 
195 aa  82  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  34.91 
 
 
193 aa  80.9  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  31.74 
 
 
177 aa  80.9  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  36.47 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  30.21 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  32.16 
 
 
216 aa  77.4  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  34.9 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  35.29 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  34.71 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  39.86 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  34.04 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  32.62 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  35.71 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  34.19 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5981  methyltransferase type 12  34.19 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2096  methyltransferase type 12  34.19 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  34.48 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  37.32 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  31.16 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  34.25 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  32.8 
 
 
194 aa  67  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13353  methyltransferase  36.5 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.356592  normal  0.242787 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  36.03 
 
 
218 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  37.69 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  32.8 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  33.55 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  33.56 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1011  methyltransferase type 12  30.43 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  33.56 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  36.69 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  29.33 
 
 
174 aa  64.3  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  30.72 
 
 
220 aa  63.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  24.67 
 
 
276 aa  62.8  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
207 aa  62  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1178  methyltransferase type 11  36.3 
 
 
200 aa  62  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000106336 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  36.5 
 
 
168 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28840  methyltransferase family protein  39.1 
 
 
256 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0991  methyltransferase type 11  31.11 
 
 
182 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  27.59 
 
 
192 aa  59.7  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  36.43 
 
 
253 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13140  hypothetical protein  31.64 
 
 
200 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.225832 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  28.68 
 
 
188 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2716  hypothetical protein  33.12 
 
 
172 aa  57.4  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287363 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  32.14 
 
 
205 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3243  methyltransferase type 12  30.51 
 
 
206 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0787423  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  32.37 
 
 
205 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  26.55 
 
 
209 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  30.97 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  38.24 
 
 
214 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  33.08 
 
 
195 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  32.37 
 
 
205 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  32.37 
 
 
205 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  32.37 
 
 
205 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  32.37 
 
 
205 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  28.68 
 
 
188 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  26.49 
 
 
194 aa  56.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  28.89 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  35.53 
 
 
243 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 
194 aa  55.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  32.37 
 
 
205 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  30.82 
 
 
177 aa  54.7  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0907  methyltransferase type 12  31.43 
 
 
176 aa  54.7  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  38.95 
 
 
208 aa  54.7  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  31.39 
 
 
190 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  29.79 
 
 
181 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  35.77 
 
 
226 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5088  methyltransferase type 11  31.34 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00483087 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  29.79 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  31.87 
 
 
195 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  29.79 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  30 
 
 
200 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  30.08 
 
 
173 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  29.79 
 
 
181 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2956  methyltransferase type 12  30.05 
 
 
189 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.311517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  35.82 
 
 
206 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1197  methyltransferase type 11  30.94 
 
 
209 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  37.17 
 
 
204 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  27.65 
 
 
292 aa  52.8  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  36.27 
 
 
217 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2006  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
200 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534679  hitchhiker  0.00000495846 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  31.65 
 
 
187 aa  52.4  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  34.33 
 
 
208 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  35.04 
 
 
208 aa  52.4  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  35.04 
 
 
211 aa  52.4  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 
218 aa  52  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
198 aa  52  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  27.86 
 
 
235 aa  52  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  30.73 
 
 
217 aa  51.2  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>