More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2655 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  100 
 
 
232 aa  461  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  44.54 
 
 
234 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  44.95 
 
 
226 aa  198  7e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  42.61 
 
 
256 aa  194  8.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  47.95 
 
 
232 aa  187  9e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  42.42 
 
 
231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  42.98 
 
 
239 aa  182  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  46.45 
 
 
239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  47.64 
 
 
241 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  45.5 
 
 
239 aa  180  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  45.5 
 
 
239 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  45.5 
 
 
239 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  45.5 
 
 
239 aa  180  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  45.5 
 
 
239 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  45.5 
 
 
239 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  45.5 
 
 
239 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  45.5 
 
 
239 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  45.5 
 
 
239 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  45.5 
 
 
239 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  40.79 
 
 
236 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  41.32 
 
 
249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  45.5 
 
 
239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  42.79 
 
 
245 aa  178  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  41.48 
 
 
244 aa  178  8e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  46.67 
 
 
235 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  46.67 
 
 
235 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  45.66 
 
 
236 aa  176  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  40.38 
 
 
237 aa  174  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  44.55 
 
 
241 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  44.08 
 
 
239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  40.38 
 
 
265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  44.93 
 
 
243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  44.55 
 
 
239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  40.38 
 
 
237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  40.38 
 
 
237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  40.38 
 
 
237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  40.38 
 
 
237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  40.38 
 
 
237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  40.38 
 
 
237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  40.38 
 
 
237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  40.38 
 
 
237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  44.08 
 
 
249 aa  171  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  44.08 
 
 
241 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  45.83 
 
 
207 aa  169  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  44.91 
 
 
243 aa  168  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  44.88 
 
 
241 aa  168  7e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  44.02 
 
 
244 aa  168  8e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  43.93 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  43.6 
 
 
240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  43.19 
 
 
246 aa  162  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  45.24 
 
 
249 aa  161  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  43.41 
 
 
242 aa  159  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  41.18 
 
 
244 aa  158  7e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  41.67 
 
 
233 aa  156  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  41.67 
 
 
233 aa  155  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  45.41 
 
 
219 aa  152  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  41.86 
 
 
149 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  47.37 
 
 
114 aa  114  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  45.3 
 
 
118 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1343  RpoD family RNA polymerase sigma factor  33.2 
 
 
407 aa  107  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000061259  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1343  RpoD family RNA polymerase sigma factor  33.2 
 
 
407 aa  107  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000691641  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1726  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  31.85 
 
 
369 aa  97.8  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1223  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  31.71 
 
 
387 aa  97.4  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0115586  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  33.47 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0624  RNA polymerase sigma factor RpoD  31.65 
 
 
361 aa  95.9  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00076534  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  42.61 
 
 
126 aa  95.5  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0492  RNA polymerase sigma factor RpoD  32.66 
 
 
360 aa  95.1  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.187427  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1426  RNA polymerase sigma factor RpoD  30.86 
 
 
369 aa  94.4  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0144524  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1029  RpoD family RNA polymerase sigma factor  31.23 
 
 
370 aa  94.7  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0650  RpoD family RNA polymerase sigma factor  31.25 
 
 
418 aa  94.4  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  30.57 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0374  sporulation sigma factor SigF  28.92 
 
 
252 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2250  sporulation sigma factor SigF  29.72 
 
 
250 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41331  predicted protein  32.31 
 
 
344 aa  93.6  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.060749  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  31.35 
 
 
255 aa  93.2  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  30.83 
 
 
256 aa  92.8  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3521  RpoD family RNA polymerase sigma factor  30.8 
 
 
372 aa  92.4  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0582772  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0609  RpoD family RNA polymerase sigma factor  29.37 
 
 
424 aa  92.4  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000182504  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1314  RNA polymerase sigma factor RpoD  31 
 
 
357 aa  91.7  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000145678  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1546  RNA polymerase sigma factor RpoD  31.45 
 
 
617 aa  91.7  9e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.413231  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1448  RNA polymerase sigma factor RpoD  30.86 
 
 
369 aa  91.7  9e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000454729  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0234  RpoD family RNA polymerase sigma factor  32.14 
 
 
371 aa  91.3  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417606  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0713  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  32.96 
 
 
417 aa  91.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0431  RpoD family RNA polymerase sigma factor  31.17 
 
 
372 aa  90.9  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0297  RNA polymerase sigma factor  34.3 
 
 
474 aa  90.5  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0895  RNA polymerase sigma factor RpoD  31.39 
 
 
358 aa  90.9  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000160053  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3369  RpoD family RNA polymerase sigma factor  31.2 
 
 
353 aa  90.9  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.453528  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0687  sporulation sigma factor SigG  32.41 
 
 
257 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0853  sporulation sigma factor SigG  30.33 
 
 
272 aa  89.7  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0182418  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0975  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  28 
 
 
285 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000391946  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2406  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  28.98 
 
 
444 aa  89.4  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127973  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0692  RNA polymerase sigma factor RpoD  34.3 
 
 
489 aa  89.4  5e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0879  RNA polymerase, sigma 28 subunit  31.17 
 
 
365 aa  89  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1552  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  30.43 
 
 
256 aa  88.6  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4216  RNA polymerase sigma factor RpoD  30.51 
 
 
372 aa  88.6  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000301264  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1975  RNA polymerase sigma factor RpoD  31.39 
 
 
366 aa  88.2  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000064083  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1680  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  30.83 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1761  RNA polymerase sigma factor  32.13 
 
 
559 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3690  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  29.26 
 
 
664 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556111  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0649  RNA polymerase sigma factor RpoD  31.28 
 
 
399 aa  87.8  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>