More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1029 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1029  RpoD family RNA polymerase sigma factor  100 
 
 
370 aa  746    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1343  RpoD family RNA polymerase sigma factor  69.84 
 
 
407 aa  512  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000061259  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1343  RpoD family RNA polymerase sigma factor  69.84 
 
 
407 aa  512  1e-144  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000691641  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0431  RpoD family RNA polymerase sigma factor  68.98 
 
 
372 aa  509  1e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0713  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  57.06 
 
 
417 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0650  RpoD family RNA polymerase sigma factor  55.01 
 
 
418 aa  386  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0797  RpoD family RNA polymerase sigma factor  55.71 
 
 
414 aa  387  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.671814  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1223  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  54.93 
 
 
387 aa  380  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0115586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0895  RNA polymerase sigma factor RpoD  57.18 
 
 
358 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000160053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0157  RNA polymerase sigma factor RpoD  53.95 
 
 
375 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1726  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  54.44 
 
 
369 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0624  RNA polymerase sigma factor RpoD  56.27 
 
 
361 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00076534  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12400  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  57.26 
 
 
358 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0607  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1314  RNA polymerase sigma factor RpoD  58.81 
 
 
357 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000145678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3036  RNA polymerase sigma factor RpoD  54.52 
 
 
359 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0549205  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2462  RNA polymerase sigma factor RpoD  53.83 
 
 
367 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0127291  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2414  RNA polymerase sigma factor RpoD  54.47 
 
 
374 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000700134  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1653  RNA polymerase sigma factor RpoD  53.35 
 
 
368 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1619  RNA polymerase sigma factor RpoD  53.35 
 
 
368 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000324281  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3521  RpoD family RNA polymerase sigma factor  54.7 
 
 
372 aa  364  1e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0582772  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0609  RpoD family RNA polymerase sigma factor  50.83 
 
 
424 aa  364  1e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000182504  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1127  RNA polymerase sigma factor RpoD  53.07 
 
 
368 aa  363  3e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000620377  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4216  RNA polymerase sigma factor RpoD  53.83 
 
 
372 aa  361  9e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000301264  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0492  RNA polymerase sigma factor RpoD  53.93 
 
 
360 aa  359  5e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.187427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0827  RNA polymerase sigma factor RpoD  52.21 
 
 
375 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000804536  decreased coverage  6.75333e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4409  RNA polymerase sigma factor RpoD  52.21 
 
 
375 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000427068  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4372  RNA polymerase sigma factor RpoD  52.49 
 
 
375 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000624256  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0234  RpoD family RNA polymerase sigma factor  50.68 
 
 
371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4194  RNA polymerase sigma factor RpoD  52.5 
 
 
373 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000145872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4032  RNA polymerase sigma factor RpoD  52.5 
 
 
373 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.92398e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4042  RNA polymerase sigma factor RpoD  52.5 
 
 
373 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000102439  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4426  RNA polymerase sigma factor RpoD  52.49 
 
 
375 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4314  RNA polymerase sigma factor RpoD  52.5 
 
 
373 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.2227e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4515  RNA polymerase sigma factor RpoD  52.5 
 
 
373 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000315443  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3019  RNA polymerase sigma factor RpoD  52.5 
 
 
373 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000207905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4144  RNA polymerase sigma factor RpoD  52.21 
 
 
375 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000635558  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1448  RNA polymerase sigma factor RpoD  51.92 
 
 
369 aa  355  5.999999999999999e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000454729  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1113  RNA polymerase sigma factor RpoD  54.71 
 
 
373 aa  355  7.999999999999999e-97  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000049377  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1426  RNA polymerase sigma factor RpoD  51.77 
 
 
369 aa  355  1e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0144524  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1215  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  53.1 
 
 
360 aa  354  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000256701  hitchhiker  0.00656648 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0541  RNA polymerase sigma factor RpoD  54.44 
 
 
359 aa  352  5e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000181279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1975  RNA polymerase sigma factor RpoD  55.93 
 
 
366 aa  350  2e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000064083  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1977  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  52.57 
 
 
368 aa  347  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.129295  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2264  RNA polymerase sigma factor RpoD  55.65 
 
 
366 aa  347  3e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0028881  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0743  RNA polymerase sigma factor RpoD  62.31 
 
 
380 aa  346  4e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000129687  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1241  DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32)  51.53 
 
 
432 aa  345  8.999999999999999e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00483871  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2943  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  48.83 
 
 
387 aa  342  9e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0053335  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1507  sigma 38 (RpoS)  53.8 
 
 
358 aa  341  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000451966  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0996  DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32)  50.69 
 
 
458 aa  340  2e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0015  RpoD family RNA polymerase sigma factor  46.41 
 
 
400 aa  335  7.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2352  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.67 
 
 
392 aa  333  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1283  sigma 38  49.35 
 
 
409 aa  333  4e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2129  RpoD family RNA polymerase sigma factor  49.35 
 
 
409 aa  332  5e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0571  RNA polymerase sigma factor RpoD  54.28 
 
 
447 aa  329  4e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.750581  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0486  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  48.76 
 
 
379 aa  325  6e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3197  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  46.17 
 
 
385 aa  323  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119315  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1311  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  54.61 
 
 
409 aa  321  9.999999999999999e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.046516 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1315  putative RNA polymerase, sigma 70 family subunit  50.29 
 
 
413 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.120093  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1188  RpoD subfamily RNA polymerase sigma-70  52.16 
 
 
367 aa  319  6e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0824  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  53.47 
 
 
455 aa  314  9.999999999999999e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00671165  hitchhiker  0.000482481 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09420  RNA polymerase sigma factor RpoD, C-terminal domain/RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  53.62 
 
 
394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09100  RNA polymerase sigma factor RpoD, C-terminal domain/RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  53.11 
 
 
422 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.321739  normal  0.63498 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1135  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  61.73 
 
 
602 aa  312  6.999999999999999e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00130789  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1530  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  58.85 
 
 
578 aa  311  1e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4379  RpoD family RNA polymerase sigma factor  45.81 
 
 
400 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0476  RNA polymerase, sigma 28 subunit  52.06 
 
 
532 aa  311  2e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4296  sigma 38, RpoS  61.63 
 
 
574 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.939988  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0297  RNA polymerase sigma factor  52.17 
 
 
474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0551  RNA polymerase sigma factor RpoD  61.28 
 
 
520 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0692  RNA polymerase sigma factor RpoD  52.17 
 
 
489 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2963  RNA polymerase sigma factor  53.02 
 
 
495 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.743322  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_491  DNA-directed RNA polymerase sigma subunit (sigma70/sigma32)  61.28 
 
 
520 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000448627  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2139  RNA polymerase sigma factor  52.51 
 
 
616 aa  306  3e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1761  RNA polymerase sigma factor  49.85 
 
 
559 aa  306  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0526  RpoD family RNA polymerase sigma factor  61.28 
 
 
520 aa  306  3e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000172392  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0762  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  63.56 
 
 
819 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.023937  normal  0.967295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4672  RpoD family RNA polymerase sigma factor  42.28 
 
 
375 aa  306  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6393  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  63.14 
 
 
697 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0721  sigma 70 (RpoD)  63.56 
 
 
805 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.473729  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1626  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  58.26 
 
 
688 aa  306  5.0000000000000004e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0758  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  63.56 
 
 
805 aa  305  6e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0758  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  63.56 
 
 
802 aa  305  6e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4348  RpoD family RNA polymerase sigma factor  44.62 
 
 
399 aa  305  7e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866985  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0191  RpoD family RNA polymerase sigma factor  44.88 
 
 
402 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000166048  decreased coverage  0.00192271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3312  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  52.51 
 
 
571 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1607  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  52.84 
 
 
559 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.512877  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0805  RpoD family RNA polymerase sigma factor  60.49 
 
 
683 aa  304  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.469743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0762  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  51.19 
 
 
364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2306  RNA polymerase, sigma 28 subunit  43.32 
 
 
366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.136108  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4595  RpoD family RNA polymerase sigma factor  58.58 
 
 
640 aa  303  4.0000000000000003e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1427  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  52.17 
 
 
504 aa  302  6.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.744088 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3036  RNA polymerase sigma factor RpoD  59.09 
 
 
650 aa  302  6.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672133  normal  0.0730738 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1430  RNA polymerase, sigma 28 subunit  52.35 
 
 
495 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7088  DNA-directed RNA polymerase sigma subunit (sigma70/sigma32)-like protein  50.98 
 
 
561 aa  302  7.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0640657  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2057  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  52.17 
 
 
495 aa  301  8.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130961  normal  0.746729 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0257  RpoD family RNA polymerase sigma factor  61.11 
 
 
541 aa  301  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.201917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0287  RpoD family RNA polymerase sigma factor  61.11 
 
 
541 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.332062  hitchhiker  0.00728099 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1917  RNA polymerase sigma factor  52.35 
 
 
499 aa  301  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1235  RNA polymerase sigma factor RpoD  57.03 
 
 
595 aa  301  1e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1531  RNA polymerase sigma factor  52.35 
 
 
502 aa  301  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.138503  decreased coverage  0.00383208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>