146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1029 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1029  type IV pilus assembly protein PilM  100 
 
 		 343 aa  696    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1718  type IV pilus assembly protein PilM  33.53 
 
 		 334 aa  186  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0998  type IV pilus assembly protein PilM  30.79 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0975  type IV pilus assembly protein PilM  28.73 
 
 		 374 aa  158  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  27.75 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  26.42 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  29.5 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  29.5 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  27.4 
 
 		 352 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  26.27 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  28.76 
 
 		 352 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  25.8 
 
 		 351 aa  119  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  26.74 
 
 		 351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  28.4 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  27.06 
 
 		 354 aa  116  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  27.2 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1545  pilus-associated protein pilM  28.91 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.100373 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  26.01 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  27.43 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  25.21 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  26.25 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  25.21 
 
 		 350 aa  106  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  26.77 
 
 		 379 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  24.26 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  26.45 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  26.8 
 
 		 380 aa  97.4  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  26.01 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2100  type IV pilus assembly protein PilM  27.36 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  24.08 
 
 		 351 aa  92.8  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  27.19 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  27.19 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  25.14 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0539  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  26.47 
 
 		 353 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2409  type IV pilus assembly protein PilM  22.94 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17820  type IV pilus assembly protein PilM  26.71 
 
 		 353 aa  90.9  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.61643 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  24.08 
 
 		 354 aa  90.1  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1037  type IV pilus assembly protein PilM  27.16 
 
 		 348 aa  86.3  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1830  type IV pilus assembly protein PilM  25.32 
 
 		 354 aa  85.9  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0258246  normal  0.367696 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  23.45 
 
 		 359 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1762  type IV pilus assembly protein PilM  24.86 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.35494  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0322  type IV pilus assembly protein PilM  25.59 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3019  type IV pilus assembly protein PilM  26.3 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2203  type IV pilus assembly protein PilM  25.94 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  24.58 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1605  type IV pilus assembly protein PilM  24.4 
 
 		 365 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0826  type IV pilus assembly protein PilM  25.28 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  24.71 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2453  type IV pilus assembly protein PilM  27.72 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.237184  hitchhiker  0.0000000165118 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  25.07 
 
 		 345 aa  79  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  24.78 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0656  type IV pilus assembly protein PilM  20.24 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000003661  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  24.29 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  24.36 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  24.02 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  25.36 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  24.07 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1984  type IV pilus assembly protein PilM  24.82 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0434865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  25.42 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1860  fimbrial assembly membrane protein  25.63 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.151761  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  23.7 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1789  type IV pilus assembly protein PilM  25.35 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.739852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  22.92 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3240  type IV pilus assembly protein PilM  24.71 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0405  Type IV pilus assembly protein PilM  26.97 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417469  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2691  response regulator receiver domain-containing protein  24.25 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540139  hitchhiker  0.00311169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66660  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  28.34 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5781  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  28.34 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  23.43 
 
 		 355 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  24.3 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2701  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  25.77 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.942967 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  24.07 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  23.65 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3899  type IV pilus assembly protein PilM  24.36 
 
 		 359 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00788991  normal  0.338087 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2716  fimbrial assembly protein PilM  24.05 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  25.28 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0233  type IV pilus assembly protein PilM  23.8 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3549  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  25.63 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  23.55 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3703  type IV pilus assembly protein PilM  24.07 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.288222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0242  type IV pilus assembly protein PilM  24.07 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  25.81 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1514  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  22.4 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.87892  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0953  type IV pilus assembly protein PilM  23.2 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5132  type IV pilus biogenesis protein PilM  26.88 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0403  Type IV pilus assembly protein PilM  26.59 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1883  type IV pilus assembly protein  27.56 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.685272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3253  type IV pilus assembly protein PilM  21.53 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  23.36 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  25.25 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0256  type IV pilus assembly protein PilM  23.96 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2173  type IV pilus assembly protein PilM  26.29 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.227783  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2269  type IV pilus assembly protein PilM  19.93 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0608  type IV pilus assembly protein PilM  23.6 
 
 		 356 aa  67  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159327  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2686  type IV pilus assembly protein PilM  21.88 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000584895  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3686  Type IV pilus assembly protein PilM  25.17 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4089  type IV pilus assembly protein PilM  24.07 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4207  type IV pilus assembly protein PilM  24.07 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4008  type IV pilus assembly protein PilM  24.07 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1339  type IV pilus assembly protein PilM  22.87 
 
 		 353 aa  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0208  type IV pilus assembly protein PilM  22.83 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996609 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>