More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_989 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1206  homoserine dehydrogenase  97.92 
 
 		 433 aa  816    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_989  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 433 aa  883    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102122  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1016  homoserine dehydrogenase  94.92 
 
 		 433 aa  788    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00327317  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  44.5 
 
 		 424 aa  356  5.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  44.06 
 
 		 430 aa  350  3e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  44.8 
 
 		 436 aa  350  4e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  46.1 
 
 		 431 aa  346  4e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  44.93 
 
 		 432 aa  345  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  42.47 
 
 		 436 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  43.9 
 
 		 428 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  44.91 
 
 		 427 aa  334  2e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  45.07 
 
 		 418 aa  333  4e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  42.49 
 
 		 440 aa  333  4e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  42.96 
 
 		 436 aa  333  5e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  41 
 
 		 436 aa  330  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  41.44 
 
 		 438 aa  329  4e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  40.88 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  40.77 
 
 		 436 aa  327  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  44.24 
 
 		 435 aa  326  5e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  43.59 
 
 		 423 aa  325  7e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  41.11 
 
 		 439 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  40.52 
 
 		 431 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  40.98 
 
 		 432 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  42.13 
 
 		 428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  40.09 
 
 		 441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  41.84 
 
 		 437 aa  307  3e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  41.84 
 
 		 437 aa  307  3e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  40.69 
 
 		 438 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  40.49 
 
 		 431 aa  306  6e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  41.18 
 
 		 441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  41.78 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  46.3 
 
 		 449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 		 442 aa  304  2.0000000000000002e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  40.36 
 
 		 438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 435 aa  303  5.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26330  homoserine dehydrogenase  41.35 
 
 		 440 aa  302  9e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  41.46 
 
 		 445 aa  300  4e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 432 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  41.33 
 
 		 439 aa  298  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  40.8 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 432 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  40.57 
 
 		 436 aa  298  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 		 434 aa  297  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  41.4 
 
 		 438 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  41.1 
 
 		 440 aa  297  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  41.53 
 
 		 427 aa  296  5e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  41.51 
 
 		 436 aa  296  6e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  39.52 
 
 		 469 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  40.28 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  39.19 
 
 		 433 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  39.86 
 
 		 436 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0280  Homoserine dehydrogenase  41.42 
 
 		 427 aa  293  3e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2465  Homoserine dehydrogenase  40.55 
 
 		 439 aa  292  6e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202426  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  40.47 
 
 		 447 aa  292  7e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1541  homoserine dehydrogenase  44.44 
 
 		 438 aa  292  8e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4841  homoserine dehydrogenase  39.54 
 
 		 429 aa  291  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00593981  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  40.33 
 
 		 436 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  41.28 
 
 		 436 aa  290  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0704  homoserine dehydrogenase  43.58 
 
 		 435 aa  290  4e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320158  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  41.81 
 
 		 437 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 442 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 442 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 442 aa  289  9e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  39.58 
 
 		 437 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  37.82 
 
 		 432 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 		 443 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3882  homoserine dehydrogenase  39.86 
 
 		 445 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.5608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1452  homoserine dehydrogenase  43.51 
 
 		 414 aa  286  5e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0556341  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  40.09 
 
 		 443 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 		 443 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2222  Homoserine dehydrogenase  38.92 
 
 		 441 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.212971  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  40.14 
 
 		 442 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  40.14 
 
 		 442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  40.38 
 
 		 442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3896  homoserine dehydrogenase  39.86 
 
 		 445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519446  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3970  homoserine dehydrogenase  39.86 
 
 		 445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  40.14 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  37.93 
 
 		 448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 		 448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  39.86 
 
 		 433 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  40.5 
 
 		 429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  40.62 
 
 		 430 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  40.09 
 
 		 440 aa  284  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2310  Homoserine dehydrogenase  38.92 
 
 		 441 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  38.62 
 
 		 441 aa  283  4.0000000000000003e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  44.66 
 
 		 442 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1957  homoserine dehydrogenase  41.56 
 
 		 435 aa  282  7.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0702  homoserine dehydrogenase  38.41 
 
 		 438 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0783  homoserine dehydrogenase  40.28 
 
 		 429 aa  281  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00270854  unclonable  0.0000000575852 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  39.02 
 
 		 417 aa  281  1e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  38.15 
 
 		 440 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 442 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  38.44 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4153  Homoserine dehydrogenase  40.33 
 
 		 430 aa  281  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  40.83 
 
 		 439 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  39.77 
 
 		 453 aa  280  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  37.24 
 
 		 439 aa  280  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  44.11 
 
 		 442 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  44.11 
 
 		 442 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  44.11 
 
 		 442 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>